More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2288 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2288  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
255 aa  510  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.018697  decreased coverage  3.21635e-05 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2482  TonB system transport protein ExbB  95.45 
 
 
242 aa  458  1e-128  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378751  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0219  MotA/TolQ/ExbB proton channel  85.12 
 
 
241 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.748984  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  81.82 
 
 
239 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0296  MotA/TolQ/ExbB proton channel  80.58 
 
 
239 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0686936 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0280  transport protein ExbB  76.86 
 
 
239 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02500  transport protein ExbB  76.86 
 
 
239 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102562  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08070  ExbB proton channel  76.68 
 
 
236 aa  341  7e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21700  ExbB proton channel  76.68 
 
 
236 aa  341  7e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.798679  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21820  ExbB proton channel  76.23 
 
 
236 aa  338  4e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.129559  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0270  biopolymer transport protein ExbB, putative  59.23 
 
 
235 aa  267  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0136  MotA/TolQ/ExbB proton channel  59.23 
 
 
235 aa  267  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  61.29 
 
 
234 aa  266  3e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2640  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.33 
 
 
232 aa  240  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.14 
 
 
244 aa  238  8e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.413379  hitchhiker  0.000693318 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  60.48 
 
 
238 aa  226  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0673  TonB system transport protein ExbB  57.89 
 
 
230 aa  222  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649257  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.24 
 
 
240 aa  221  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4481  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.37 
 
 
230 aa  220  2e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.09 
 
 
238 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0125924  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4332  MotA/TolQ/ExbB proton channel  60.31 
 
 
238 aa  218  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.236556  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3985  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.88 
 
 
238 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912211  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.42 
 
 
238 aa  214  9e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0442  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  48.82 
 
 
218 aa  183  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.256552  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0669  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  48.02 
 
 
218 aa  178  7e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1021  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.69 
 
 
249 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00477503  normal  0.0346927 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0877  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.69 
 
 
249 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0394331  normal  0.0815705 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.16 
 
 
224 aa  146  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.66729e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2590  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.9 
 
 
250 aa  142  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  3.18132e-07 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0573  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.16 
 
 
222 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.250468 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0547  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.16 
 
 
222 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232514  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2734  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.45 
 
 
222 aa  140  1e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38 
 
 
224 aa  140  2e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.20137e-08  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0712  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.02 
 
 
250 aa  139  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0154333 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  36.95 
 
 
225 aa  139  5e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0009  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.36 
 
 
253 aa  139  5e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00486785 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0010  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.74 
 
 
254 aa  139  6e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.686858  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1755  biopolymer transport ExbB protein  39.71 
 
 
307 aa  138  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.449833 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.5 
 
 
223 aa  138  8e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1048  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.81 
 
 
254 aa  138  9e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03475  biopolymer transport ExbB protein  36.54 
 
 
253 aa  138  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0169  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.53 
 
 
222 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.5 
 
 
223 aa  137  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0652  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.53 
 
 
222 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2407  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.38 
 
 
238 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.18242  normal  0.658816 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1441  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.38 
 
 
238 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1806  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.38 
 
 
238 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.388089  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0010  biopolymer transport ExbB protein  36.28 
 
 
254 aa  136  3e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.07 
 
 
222 aa  135  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.219229 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3382  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.12 
 
 
238 aa  135  6e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  1.29068e-06 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3519  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.78 
 
 
253 aa  135  6e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.874446  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1793  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.33 
 
 
242 aa  135  6e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.418463 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0619  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.07 
 
 
222 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.701482  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.33 
 
 
242 aa  135  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065084  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2236  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.82 
 
 
242 aa  134  1e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3312  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.3 
 
 
238 aa  134  1e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  37 
 
 
224 aa  134  1e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0574  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36.07 
 
 
236 aa  133  2e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  37.37 
 
 
223 aa  134  2e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  36.5 
 
 
224 aa  134  2e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1120  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.45 
 
 
286 aa  133  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3075  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.3 
 
 
239 aa  132  4e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00179933  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4695  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.44 
 
 
303 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1115  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.91 
 
 
247 aa  132  7e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.955363  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.21 
 
 
243 aa  131  1e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314419  normal  0.0287229 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0814  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.27 
 
 
265 aa  131  1e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0118  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
241 aa  130  2e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.604603  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2569  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.76 
 
 
242 aa  130  2e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0695018  hitchhiker  0.0010528 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6110  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.9 
 
 
246 aa  130  2e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0706  Tol-Pal system TolQ  34.83 
 
 
245 aa  129  4e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal  0.496524 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.5 
 
 
243 aa  129  4e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108659 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4623  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.3 
 
 
240 aa  129  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.89868  hitchhiker  3.4158e-05 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.5 
 
 
311 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.47 
 
 
301 aa  128  7e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.876301  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0696  protein TolQ  36.36 
 
 
257 aa  128  7e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0697  protein TolQ  36.36 
 
 
257 aa  128  7e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.553708  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1209  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.2 
 
 
235 aa  128  8e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.484595  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0911  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.64 
 
 
253 aa  128  9e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  35.64 
 
 
227 aa  128  9e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0662  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.36 
 
 
247 aa  128  9e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3141  biopolymer transport transmembrane protein, MotA/TolQ/ExbB like  39.39 
 
 
242 aa  128  1e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.346915  normal  0.0492826 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.68 
 
 
266 aa  127  1e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.36409 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.19 
 
 
301 aa  127  2e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471993  normal  0.437872 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1716  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.19 
 
 
303 aa  127  2e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1053  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.42 
 
 
250 aa  127  2e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3719  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.61 
 
 
247 aa  127  2e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.561641  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6362  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.19 
 
 
303 aa  127  2e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.413769  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1231  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.39 
 
 
235 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0372  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.39 
 
 
235 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4552  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.51 
 
 
222 aa  126  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3454  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.39 
 
 
235 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2642  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.39 
 
 
235 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1938  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.79 
 
 
263 aa  126  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2999  biopolymer transport transmembrane protein, ExbB/TolQ  39.34 
 
 
301 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0477  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.22 
 
 
233 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1964  biopolymer transport transmembrane protein  40.64 
 
 
243 aa  126  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368694  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3452  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.39 
 
 
235 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2455  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.39 
 
 
235 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4497  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.28 
 
 
242 aa  126  4e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1441  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.25 
 
 
301 aa  125  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>