143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2287 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  100 
 
 
277 aa  523  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  3.80211e-05 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  94.58 
 
 
273 aa  342  3e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  92.13 
 
 
285 aa  172  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  76.34 
 
 
274 aa  156  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  81.61 
 
 
270 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  77.53 
 
 
275 aa  155  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  80.46 
 
 
264 aa  153  3e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  77.53 
 
 
286 aa  153  3e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0295  TonB family protein  83.91 
 
 
264 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.14734 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5227  TonB family protein  82.76 
 
 
266 aa  135  7e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.631844  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  66.67 
 
 
266 aa  129  7e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  65.52 
 
 
273 aa  129  8e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  66.67 
 
 
266 aa  129  8e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  58.24 
 
 
276 aa  119  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  46.31 
 
 
193 aa  118  1e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  50.39 
 
 
288 aa  114  2e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  41.94 
 
 
287 aa  112  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  42.2 
 
 
212 aa  112  8e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  38.01 
 
 
285 aa  112  9e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  54.35 
 
 
275 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  41.67 
 
 
248 aa  110  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  37.04 
 
 
256 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  53.66 
 
 
273 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  52.44 
 
 
274 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0674  tonB domain protein  55.17 
 
 
267 aa  92  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4480  TonB, C-terminal  55.29 
 
 
269 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  51.16 
 
 
253 aa  90.9  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  47.19 
 
 
233 aa  89.4  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  8.76595e-05 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3737  TonB-like  60.98 
 
 
272 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  48.84 
 
 
228 aa  85.1  1e-15  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  50 
 
 
244 aa  82  9e-15  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  32.4 
 
 
249 aa  80.5  3e-14  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.28507e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  40.38 
 
 
234 aa  80.1  3e-14  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  45.35 
 
 
232 aa  80.1  3e-14  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  42.7 
 
 
233 aa  79  8e-14  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  40.49 
 
 
244 aa  78.2  1e-13  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  40.49 
 
 
244 aa  78.2  1e-13  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  47.62 
 
 
289 aa  76.6  4e-13  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.32201e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  38.24 
 
 
237 aa  72.4  7e-12  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  44.25 
 
 
271 aa  71.6  1e-11  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  43.9 
 
 
212 aa  71.2  2e-11  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  41.03 
 
 
215 aa  65.1  1e-09  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2903  TonB family protein  44.55 
 
 
218 aa  65.1  1e-09  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  35.29 
 
 
270 aa  65.1  1e-09  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  41.67 
 
 
308 aa  64.3  2e-09  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  39.51 
 
 
231 aa  63.2  4e-09  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  39.51 
 
 
231 aa  62.8  6e-09  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  42.16 
 
 
117 aa  62.4  7e-09  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  39.74 
 
 
215 aa  62  1e-08  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3718  periplasmic protein/ biopolymer transport  40.22 
 
 
238 aa  60.8  2e-08  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  34.83 
 
 
259 aa  60.5  3e-08  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0184  TonB family protein  28.11 
 
 
267 aa  59.3  7e-08  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.140188 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  33.33 
 
 
218 aa  58.5  1e-07  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  34.34 
 
 
243 aa  58.5  1e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  37.04 
 
 
246 aa  57.8  2e-07  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  26.64 
 
 
267 aa  58.2  2e-07  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  26.64 
 
 
267 aa  58.2  2e-07  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  26.28 
 
 
267 aa  58.2  2e-07  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  33.33 
 
 
280 aa  57.8  2e-07  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  35.16 
 
 
234 aa  57  3e-07  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01076  TonB protein  43.42 
 
 
219 aa  57.4  3e-07  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147824  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06243  TonB protein  43.42 
 
 
219 aa  57.4  3e-07  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.442028  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  37.66 
 
 
390 aa  57  3e-07  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  35.9 
 
 
319 aa  55.8  7e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  34.86 
 
 
208 aa  54.7  2e-06  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  36.36 
 
 
243 aa  54.3  2e-06  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  42.86 
 
 
244 aa  54.3  2e-06  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4005  TonB family protein  28.22 
 
 
248 aa  53.9  3e-06  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1027  TonB, C-terminal  38.2 
 
 
235 aa  53.5  3e-06  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  36.36 
 
 
226 aa  53.9  3e-06  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  35.53 
 
 
219 aa  53.9  3e-06  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3339  TonB family protein  27.22 
 
 
284 aa  53.1  4e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  4.715e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  28.63 
 
 
267 aa  53.5  4e-06  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  4.80451e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  35.71 
 
 
441 aa  53.5  4e-06  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0789  TonB-like protein  43.04 
 
 
269 aa  53.5  4e-06  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000813282  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  31.93 
 
 
2449 aa  53.1  5e-06  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1054  TonB protein  31.69 
 
 
236 aa  53.1  5e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1566  TonB family protein  31.63 
 
 
251 aa  52.8  6e-06  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  30.58 
 
 
237 aa  52.8  7e-06  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3236  TonB family protein  38.75 
 
 
291 aa  52.8  7e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00481831  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1840  TonB family protein  38.75 
 
 
138 aa  52.4  7e-06  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.259302 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2420  TonB family protein  32.05 
 
 
443 aa  52.4  8e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0829396 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2946  TonB-like protein  29.49 
 
 
242 aa  52  1e-05  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0708  TonB family protein  31.51 
 
 
256 aa  51.6  1e-05  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  30.26 
 
 
242 aa  51.6  1e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  44.83 
 
 
223 aa  51.6  1e-05  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  32 
 
 
225 aa  52  1e-05  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  30.26 
 
 
242 aa  51.6  1e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  37.66 
 
 
243 aa  51.6  2e-05  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0965  TonB family protein  39.02 
 
 
283 aa  50.4  3e-05  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1523  TonB family protein  38.96 
 
 
228 aa  50.8  3e-05  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2475  TonB like protein  42.86 
 
 
230 aa  50.8  3e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672358  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3670  TonB1 protein  38.75 
 
 
274 aa  50.8  3e-05  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  32.97 
 
 
371 aa  50.1  4e-05  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  27.19 
 
 
252 aa  50.1  4e-05  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01522  TonB protein  39.02 
 
 
140 aa  50.1  4e-05  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  36 
 
 
220 aa  49.7  5e-05  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2537  TonB family protein  36.9 
 
 
190 aa  49.3  7e-05  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741915  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  38.96 
 
 
258 aa  49.3  7e-05  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  34.9 
 
 
244 aa  48.9  8e-05  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>