More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2283 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2593  multidrug resistance protein, AcrA/AcrE family  91.45 
 
 		 386 aa  676    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.800698  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2283  secretion protein HlyD  100 
 
 		 386 aa  770    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00947214 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2427  RND family efflux transporter MFP subunit  63.27 
 
 		 380 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.412114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60850  multidrug efflux RND membrane fusion protein  62.14 
 
 		 387 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2758  secretion protein HlyD  62.63 
 
 		 385 aa  455  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5240  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexC precursor  63.46 
 
 		 387 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2817  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexC  63.54 
 
 		 378 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1460  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.87 
 
 		 367 aa  378  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5858  RND family efflux transporter MFP subunit  60.34 
 
 		 409 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.965315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0288  RND family efflux transporter MFP subunit  51.23 
 
 		 381 aa  325  9e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  49.15 
 
 		 428 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00231  membrane fusion protein  52.33 
 
 		 356 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2937  RND family efflux transporter MFP subunit  49.21 
 
 		 391 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  50.29 
 
 		 415 aa  316  4e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.89 
 
 		 424 aa  313  3.9999999999999997e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.630346  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0323  RND family efflux transporter MFP subunit  48.92 
 
 		 433 aa  311  9e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0389  RND family efflux transporter MFP subunit  50.75 
 
 		 434 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2482  RND family efflux transporter MFP subunit  48.91 
 
 		 391 aa  308  9e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  51.89 
 
 		 430 aa  306  4.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  44.01 
 
 		 395 aa  303  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2035  secretion protein HlyD  49.46 
 
 		 430 aa  303  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.789986  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0318  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.29 
 
 		 436 aa  301  1e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.199682  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  48.49 
 
 		 398 aa  300  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3588  secretion protein HlyD  49.86 
 
 		 415 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2893  secretion protein HlyD  45.92 
 
 		 385 aa  300  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127871  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3560  acriflavine resistance protein E  44.15 
 
 		 385 aa  300  3e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0550362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3745  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.34 
 
 		 423 aa  300  4e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  45.86 
 
 		 409 aa  298  8e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.63 
 
 		 391 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.297905 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  45.86 
 
 		 409 aa  298  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3648  acriflavine resistance protein E  43.88 
 
 		 385 aa  298  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.444601  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  44.44 
 
 		 406 aa  298  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  45.58 
 
 		 397 aa  297  2e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.58 
 
 		 397 aa  297  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  45.58 
 
 		 397 aa  297  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  45.58 
 
 		 397 aa  297  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  45.58 
 
 		 397 aa  297  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  45.58 
 
 		 409 aa  297  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3422  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.22 
 
 		 469 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.04 
 
 		 422 aa  297  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  45.58 
 
 		 397 aa  297  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.62 
 
 		 385 aa  296  5e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3458  acriflavine resistance protein E  43.62 
 
 		 385 aa  296  5e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000310651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3750  acriflavine resistance protein E  43.62 
 
 		 385 aa  296  5e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00329123  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2314  RND family efflux transporter MFP subunit  48.36 
 
 		 391 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0441  RND family efflux transporter MFP subunit  43.62 
 
 		 385 aa  296  5e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4582  acriflavine resistance protein E  43.35 
 
 		 385 aa  294  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  0.314671 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.12 
 
 		 395 aa  294  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03123  cytoplasmic membrane lipoprotein  43.35 
 
 		 385 aa  293  3e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  42.97 
 
 		 386 aa  293  3e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03074  hypothetical protein  43.35 
 
 		 385 aa  293  3e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3241  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.62 
 
 		 398 aa  291  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  46.97 
 
 		 425 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3781  secretion protein HlyD  48.21 
 
 		 398 aa  289  7e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.012367 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3527  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.02 
 
 		 446 aa  288  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.78 
 
 		 410 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  48.44 
 
 		 412 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4027  secretion protein HlyD  46.32 
 
 		 399 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2256  RND family efflux transporter MFP subunit  50 
 
 		 404 aa  286  4e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.16 
 
 		 411 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3714  RND family efflux transporter MFP subunit  49.54 
 
 		 408 aa  286  5e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132208 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1999  secretion protein HlyD  46.97 
 
 		 424 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.931394  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2638  RND family efflux transporter MFP subunit  46.97 
 
 		 424 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2609  RND family efflux transporter MFP subunit  46.97 
 
 		 424 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  44.2 
 
 		 397 aa  286  5e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3651  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.62 
 
 		 441 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1684  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.92 
 
 		 399 aa  285  8e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3327  RND family efflux transporter MFP subunit  43.62 
 
 		 441 aa  285  8e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.53 
 
 		 433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  42.55 
 
 		 395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  42.55 
 
 		 395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  42.74 
 
 		 392 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  42.39 
 
 		 388 aa  282  7.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0910  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.41 
 
 		 393 aa  282  8.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6204  RND family efflux transporter MFP subunit  45.96 
 
 		 412 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103192  hitchhiker  0.00610274 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  45.71 
 
 		 381 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6935  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  43.85 
 
 		 377 aa  280  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5837  secretion protein HlyD  45.96 
 
 		 412 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91911  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1070  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.82 
 
 		 397 aa  280  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2656  RND family efflux transporter MFP subunit  48.15 
 
 		 432 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444245  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2529  RND family efflux transporter MFP subunit  48.15 
 
 		 432 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.210606 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  45.63 
 
 		 400 aa  280  4e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3689  acriflavine resistance protein E  42.93 
 
 		 385 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.10776 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3655  acriflavine resistance protein E  42.93 
 
 		 385 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.369196 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5599  secretion protein HlyD  43.6 
 
 		 418 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5963  RND family efflux transporter MFP subunit  43.6 
 
 		 418 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0363452 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3582  acriflavine resistance protein E  42.93 
 
 		 385 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.372723  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3583  acriflavine resistance protein E  42.93 
 
 		 385 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6680  RND family efflux transporter MFP subunit  48.46 
 
 		 412 aa  278  9e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231623  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1018  RND family efflux transporter MFP subunit  45.51 
 
 		 420 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4046  RND family efflux transporter MFP subunit  44.04 
 
 		 382 aa  277  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0285  RND family efflux transporter MFP subunit  43.36 
 
 		 386 aa  276  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.884794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2887  RND family efflux transporter MFP subunit  47.04 
 
 		 430 aa  276  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303028  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  43.8 
 
 		 405 aa  276  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  42.66 
 
 		 381 aa  275  8e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.66 
 
 		 381 aa  275  8e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0315  RND family efflux transporter MFP subunit  45.22 
 
 		 420 aa  275  9e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0058  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  45.22 
 
 		 420 aa  275  9e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0523497  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4061  RND family efflux transporter MFP subunit  41.76 
 
 		 383 aa  275  9e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000265031  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0610  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  45.22 
 
 		 420 aa  275  9e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>