More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2261 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  91.36 
 
 		 383 aa  703    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  100 
 
 		 383 aa  770    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  57.22 
 
 		 405 aa  414  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2417  peptidase M20  54.69 
 
 		 383 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  50.27 
 
 		 394 aa  348  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  51.38 
 
 		 409 aa  339  4e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  38.86 
 
 		 385 aa  227  3e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2375  peptidase M20  38.11 
 
 		 408 aa  219  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0190  peptidase dimerisation domain protein  41.14 
 
 		 382 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0179  peptidase dimerisation domain protein  40.87 
 
 		 382 aa  212  9e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0179  glutamate carboxypeptidase  40.05 
 
 		 382 aa  209  7e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  35.67 
 
 		 374 aa  207  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  35.65 
 
 		 374 aa  207  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0170  glutamate carboxypeptidase  39.51 
 
 		 382 aa  202  7e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2730  peptidase dimerization domain protein  36.24 
 
 		 385 aa  197  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.319557  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0237  peptidase M20  37.23 
 
 		 388 aa  196  8.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5033  peptidase dimerisation domain-containing protein  38.31 
 
 		 376 aa  195  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  35.9 
 
 		 413 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  34.84 
 
 		 394 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  35.37 
 
 		 409 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  36.58 
 
 		 413 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0034  peptidase M20  40.67 
 
 		 389 aa  190  4e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3807  peptidase M20  37.57 
 
 		 378 aa  187  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.116948  normal  0.414196 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5255  carboxypeptidase  34.41 
 
 		 376 aa  186  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  38.76 
 
 		 377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1368  carboxypeptidase  36.29 
 
 		 376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1225  carboxypeptidase  35.03 
 
 		 376 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1198  carboxypeptidase  34.14 
 
 		 376 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  33.06 
 
 		 376 aa  179  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1410  carboxypeptidase  34.32 
 
 		 376 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212173  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1915  glutamate carboxypeptidase  34.76 
 
 		 432 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  38.24 
 
 		 388 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  38.24 
 
 		 388 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4023  carboxypeptidase  32.8 
 
 		 376 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.50112  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2460  peptidase dimerisation domain-containing protein  33.33 
 
 		 363 aa  171  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.308375  normal  0.162998 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0052  M20 family peptidase  35.88 
 
 		 376 aa  170  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0873  carboxypeptidase  33.96 
 
 		 376 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  38.46 
 
 		 420 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  35.38 
 
 		 391 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2444  glutamate carboxypeptidase  35.07 
 
 		 409 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0328  peptidase M20  34.77 
 
 		 372 aa  163  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2120  peptidase, M20/M25/M40 family  32.38 
 
 		 415 aa  162  9e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0028  peptidase M20  36.81 
 
 		 385 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0895  peptidase M20  32.97 
 
 		 372 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111399  normal  0.0352819 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  33.79 
 
 		 412 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0366  peptidase M20  39.12 
 
 		 367 aa  158  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4254  peptidase M20  38.83 
 
 		 375 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749883  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0896  carboxypeptidase  35.1 
 
 		 388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417572  normal  0.0534097 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  33.15 
 
 		 410 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3983  peptidase dimerization domain protein  34.41 
 
 		 381 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0795  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.36 
 
 		 358 aa  145  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0818  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.36 
 
 		 358 aa  145  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1337  carboxypeptidase G2  31.49 
 
 		 372 aa  143  4e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.214507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6820  peptidase M20  35.91 
 
 		 412 aa  143  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  decreased coverage  0.0081642 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1688  hypothetical protein  33.51 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12450  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  35.34 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0060  glutamate carboxypeptidase  30.25 
 
 		 429 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1664  hypothetical protein  29.79 
 
 		 407 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1670  hypothetical protein  32.93 
 
 		 407 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0934  Glutamate carboxypeptidase  35.73 
 
 		 391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  28.69 
 
 		 416 aa  132  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2201  hypothetical protein  34.19 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.449085 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3093  glutamate carboxypeptidase  28.07 
 
 		 436 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5703  peptidase M20  32.11 
 
 		 405 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0024  glutamate carboxypeptidase  27.27 
 
 		 438 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3377  glutamate carboxypeptidase  27.01 
 
 		 436 aa  124  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  29.59 
 
 		 424 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3030  glutamate carboxypeptidase  27.12 
 
 		 436 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  29.01 
 
 		 417 aa  115  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1858  hypothetical protein  29.43 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0460852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1543  glutamate carboxypeptidase  27.27 
 
 		 428 aa  112  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1297  peptidase M20  29.64 
 
 		 434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0144616  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1203  glutamate carboxypeptidase  27.15 
 
 		 418 aa  111  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1560  glutamate carboxypeptidase  27.07 
 
 		 422 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400095  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4723  peptidase M20  29.92 
 
 		 441 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3250  peptidase M20  28.53 
 
 		 424 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1939  hypothetical protein  31.35 
 
 		 402 aa  99.8  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0524  peptidase, M20/M25/M40 family  27.66 
 
 		 432 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0884  hypothetical protein  32.7 
 
 		 402 aa  95.1  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0530  hypothetical protein  31.25 
 
 		 401 aa  94.4  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1901  peptidase M20  29.34 
 
 		 403 aa  80.1  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296335  normal  0.958689 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  32.02 
 
 		 411 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  27.66 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0238  peptidase M20  28.21 
 
 		 436 aa  78.6  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489939  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3295  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.41 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3656  tripeptidase T  25.83 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4949  peptidase M20  26.56 
 
 		 365 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2393  peptidase dimerisation domain protein  25.89 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000137501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2046  peptidase T-like protein  24.84 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0959  M20A family peptidase  23.8 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.01 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  29.27 
 
 		 383 aa  72.8  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  29.27 
 
 		 383 aa  72.8  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  29.08 
 
 		 383 aa  72.8  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  29.27 
 
 		 383 aa  72.8  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  26.29 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.27 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  29.27 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3889  acetylornithine deacetylase  28.79 
 
 		 426 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  25.88 
 
 		 368 aa  72  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>