More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2129 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3179  major facilitator transporter  84.91 
 
 		 432 aa  733    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107398  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2604  major facilitator family transporter  82.27 
 
 		 480 aa  758    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0325  MFS family transporter  82.86 
 
 		 442 aa  726    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2345  transporter, putative  97.06 
 
 		 439 aa  863    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2129  major facilitator transporter  100 
 
 		 442 aa  889    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.526702  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5030  major facilitator transporter  76.3 
 
 		 441 aa  681    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.580497  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4907  major facilitator transporter  80.67 
 
 		 445 aa  746    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3121  major facilitator transporter  82.27 
 
 		 441 aa  758    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3239  major facilitator transporter  82.27 
 
 		 441 aa  760    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.935103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02990  putative MFS transporter  84.81 
 
 		 441 aa  746    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105539 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51130  MFS (major facilitator superfamily) transporter  82.48 
 
 		 439 aa  740    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.845287  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02062  putative transporter transmembrane protein  71.79 
 
 		 441 aa  628  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000104941  normal  0.781434 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4873  major facilitator transporter  61.06 
 
 		 501 aa  535  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103797  normal  0.996153 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  43.83 
 
 		 433 aa  358  9.999999999999999e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 439 aa  341  1e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5749  major facilitator superfamily MFS_1  42.45 
 
 		 436 aa  336  3.9999999999999995e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  40.88 
 
 		 427 aa  332  9e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  41.81 
 
 		 431 aa  330  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  39.81 
 
 		 424 aa  323  4e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6282  major facilitator superfamily MFS_1  42.11 
 
 		 429 aa  322  7e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  38.46 
 
 		 454 aa  311  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0404  major facilitator superfamily MFS_1  38.86 
 
 		 432 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  39.18 
 
 		 430 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  37.38 
 
 		 430 aa  305  8.000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  38.7 
 
 		 430 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  38.7 
 
 		 430 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  37.29 
 
 		 430 aa  305  9.000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  39.62 
 
 		 429 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  40.67 
 
 		 449 aa  303  3.0000000000000004e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  40.14 
 
 		 431 aa  303  6.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4288  major facilitator transporter  39.76 
 
 		 457 aa  300  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  37.16 
 
 		 441 aa  300  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.200056 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  38.04 
 
 		 430 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  38.04 
 
 		 430 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  39.9 
 
 		 426 aa  296  4e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  38.19 
 
 		 429 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  38.08 
 
 		 453 aa  287  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4271  major facilitator transporter  36.5 
 
 		 468 aa  285  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0659968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1058  major facilitator superfamily MFS_1  37.19 
 
 		 449 aa  263  4e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.494018  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3045  major facilitator transporter  35.49 
 
 		 435 aa  263  4.999999999999999e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2272  major facilitator superfamily MFS_1  34.39 
 
 		 479 aa  247  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.972023  decreased coverage  0.00181869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4265  major facilitator transporter  34.05 
 
 		 489 aa  241  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.762522  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1666  major facilitator transporter  32.59 
 
 		 411 aa  224  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3106  major facilitator transporter  32.52 
 
 		 428 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2448  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 409 aa  219  8.999999999999998e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.581947  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3282  putative hexuronate transporter  34.57 
 
 		 424 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0854544  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2910  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 441 aa  209  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2627  major facilitator superfamily MFS_1  32.71 
 
 		 436 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04071  Hexuronate transporter  33.16 
 
 		 425 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04033  hypothetical protein  33.16 
 
 		 425 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2068  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 434 aa  202  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2353  major facilitator superfamily MFS_1  33.49 
 
 		 436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0610  major facilitator transporter  32.57 
 
 		 430 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400877  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3658  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 432 aa  196  7e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1642  major facilitator superfamily MFS_1  32.81 
 
 		 432 aa  195  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.3142  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3386  hexuronate transporter  31.85 
 
 		 434 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.333246  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3306  hexuronate transporter  31.85 
 
 		 434 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3316  hexuronate transporter  31.85 
 
 		 434 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3380  hexuronate transporter  31.85 
 
 		 434 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal  0.6284 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3479  hexuronate transporter  31.71 
 
 		 434 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3670  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 411 aa  193  5e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03520  conserved hypothetical protein  32.87 
 
 		 452 aa  192  8e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03471  hypothetical protein  32.87 
 
 		 452 aa  192  8e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1012  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 		 430 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1313  major facilitator transporter  32.4 
 
 		 433 aa  188  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.720769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1871  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 423 aa  187  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00153919  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0947  major facilitator superfamily MFS_1  32.33 
 
 		 430 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.35328  normal  0.0858315 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1611  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 		 433 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.585379  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4247  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 429 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1170  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 425 aa  182  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4579  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 433 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571903 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11473  putative hexuronate transport protein (MFS family)  30.92 
 
 		 424 aa  181  2.9999999999999997e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.485615  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4445  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 433 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0258  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 440 aa  180  4e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4207  major facilitator transporter  32.41 
 
 		 423 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0961062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4159  major facilitator transporter  32.41 
 
 		 423 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  decreased coverage  0.00263409 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3566  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 443 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000684429  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4048  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 423 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0187179  normal  0.633628 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3128  major facilitator transporter  31.5 
 
 		 435 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0834  hexuronate transporter transmembrane protein  31.57 
 
 		 435 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00560856 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3599  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 435 aa  174  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00583195  normal  0.308839 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3361  putative hexuronate transporter  31.12 
 
 		 435 aa  174  3.9999999999999995e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3357  major facilitator transporter  32.15 
 
 		 423 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0473601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0978  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 435 aa  173  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0926  putative hexuronate transporter  30.88 
 
 		 435 aa  173  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 		 420 aa  173  6.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  30.52 
 
 		 448 aa  171  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1080  putative hexuronate transporter transmembrane protein  31.5 
 
 		 432 aa  168  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.503694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 436 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 436 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 428 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 436 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 436 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 436 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  30 
 
 		 435 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  27.14 
 
 		 449 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 		 453 aa  160  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  31.07 
 
 		 450 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 446 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  27.11 
 
 		 446 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>