222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2127 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  76.56 
 
 		 418 aa  671    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  76.79 
 
 		 418 aa  665    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1054  outer membrane porin, OprD family  77.8 
 
 		 422 aa  682    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  93.54 
 
 		 418 aa  815    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1023  outer membrane porin  76.37 
 
 		 417 aa  665    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0903  outer membrane porin  79.14 
 
 		 422 aa  683    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2127  outer membrane porin  100 
 
 		 418 aa  858    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1277  outer membrane porin  75.85 
 
 		 419 aa  649    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3451  outer membrane porin  79.49 
 
 		 395 aa  662    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  76.79 
 
 		 418 aa  672    Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1173  porin, putative  74.63 
 
 		 412 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121205  normal  0.068345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1190  outer membrane porin  74.63 
 
 		 412 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569611  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  73.1 
 
 		 412 aa  618  1e-176  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1206  outer membrane porin  73.89 
 
 		 412 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3201  outer membrane porin  70.84 
 
 		 415 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27407  normal  0.0173746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3077  outer membrane porin  67.55 
 
 		 416 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0293927  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2517  BenF-like porin  69.16 
 
 		 410 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02980  putative porin  68.56 
 
 		 421 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100388 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0324  putative porin  68.18 
 
 		 416 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4527  outer membrane porin  64.42 
 
 		 424 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00920  OprD family outer membrane porin  66.83 
 
 		 423 aa  570  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22450  OprD family outer membrane porin  66.75 
 
 		 422 aa  566  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26920  OprD family outer membrane porin  68.01 
 
 		 424 aa  563  1.0000000000000001e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38130  OprD family outer membrane porin  68.61 
 
 		 426 aa  558  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.764823  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49300  OprD family outer membrane porin  67.09 
 
 		 428 aa  551  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.32887  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31300  OprD family outer membrane porin  68.45 
 
 		 429 aa  532  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1339  outer membrane porin  61.96 
 
 		 422 aa  526  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.868317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17140  outer membrane porin  59.31 
 
 		 405 aa  500  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.209334  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38140  outer membrane porin, OprD family  55.58 
 
 		 420 aa  476  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35855  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  54.48 
 
 		 417 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  54.96 
 
 		 417 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  53.32 
 
 		 413 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  50.86 
 
 		 417 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  50.37 
 
 		 417 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  50.49 
 
 		 416 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  49.51 
 
 		 416 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000105785 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  43.97 
 
 		 423 aa  364  1e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  45.97 
 
 		 416 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3574  outer membrane porin  47.12 
 
 		 430 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.135647  normal  0.538607 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  45.73 
 
 		 416 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  45.73 
 
 		 416 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2145  outer membrane porin  45.18 
 
 		 431 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832891  normal  0.088551 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3939  porin, putative  46.12 
 
 		 430 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.38519  normal  0.0206091 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2701  outer membrane porin  43.84 
 
 		 416 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  46.81 
 
 		 422 aa  344  1e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  47.3 
 
 		 415 aa  344  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1898  outer membrane porin  45.36 
 
 		 430 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  45.41 
 
 		 429 aa  333  5e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  43.78 
 
 		 421 aa  333  5e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  43.67 
 
 		 427 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  44.03 
 
 		 427 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  44.91 
 
 		 429 aa  329  7e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  44.91 
 
 		 429 aa  328  9e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  42.22 
 
 		 421 aa  328  9e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  43 
 
 		 421 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  42.58 
 
 		 429 aa  326  6e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  41.97 
 
 		 418 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0953  putative porin  43.51 
 
 		 418 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  40 
 
 		 418 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2625  outer membrane porin  41.91 
 
 		 410 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0951208  normal  0.228202 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  40.87 
 
 		 412 aa  303  6.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11340  outer membrane porin  39.09 
 
 		 428 aa  302  7.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703793  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  41.67 
 
 		 417 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2488  outer membrane porin  41.67 
 
 		 410 aa  302  9e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.246443  normal  0.663679 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  40.05 
 
 		 417 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  40.44 
 
 		 411 aa  300  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  41.79 
 
 		 410 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  39.81 
 
 		 417 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  42.23 
 
 		 421 aa  296  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  41.65 
 
 		 416 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  39.19 
 
 		 417 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4332  outer membrane porin  41.19 
 
 		 439 aa  291  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.994922 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  44.5 
 
 		 409 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4306  outer membrane porin  41.61 
 
 		 437 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  44.76 
 
 		 409 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  38.93 
 
 		 433 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  38.55 
 
 		 433 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  38.32 
 
 		 429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  37.96 
 
 		 433 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0382  outer membrane porin OprE precursor  37.83 
 
 		 460 aa  279  8e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17890  putative porin  40.4 
 
 		 416 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  38.82 
 
 		 433 aa  276  4e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25950  OprE-like outer membrane porin  37.39 
 
 		 443 aa  276  6e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.249173  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31670  outer membrane porin OprE  38.46 
 
 		 445 aa  276  7e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  36.59 
 
 		 440 aa  274  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03800  anaerobically-induced outer membrane porin OprE precursor  36.5 
 
 		 463 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.314855  normal  0.413921 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09850  putative porin  39.51 
 
 		 431 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.881809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1554  putative porin  39.1 
 
 		 416 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  39.27 
 
 		 431 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3656  aromatic compound-specific porin, putative  37.44 
 
 		 420 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755961  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21290  OprE-like outer membrane porin  37.05 
 
 		 457 aa  270  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2730  outer membrane porin  39.06 
 
 		 440 aa  270  4e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2074  outer membrane porin  37.26 
 
 		 420 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695569  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2946  outer membrane porin, OprD family  39.76 
 
 		 440 aa  269  7e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153867  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5417  outer membrane porin  39.55 
 
 		 447 aa  268  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0532754  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05170  OprE-like outer membrane porin  37.86 
 
 		 439 aa  267  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0885067  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4212  outer membrane porin  39.23 
 
 		 427 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1987  outer membrane porin  37.56 
 
 		 430 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.6739 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31180  OprE-like outer membrane porin  37.68 
 
 		 439 aa  266  4e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1272  outer membrane porin OprE  37.05 
 
 		 417 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>