34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2103 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1453  levansucrase  94.46 
 
 
431 aa  820  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118885  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2305  levansucrase  94.7 
 
 
415 aa  824  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237725  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0032  levansucrase  94.94 
 
 
431 aa  822  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49796  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0754  levansucrase  94.19 
 
 
431 aa  817  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2103  levansucrase  100 
 
 
415 aa  857  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962759  decreased coverage  0.00209256 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3405  Beta-fructofuranosidase  43.83 
 
 
473 aa  324  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.83791 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0616  Levansucrase  38.35 
 
 
532 aa  275  2e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161634 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0405  levansucrase  37.98 
 
 
522 aa  269  8e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6047  levansucrase  38.38 
 
 
531 aa  265  9e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  1.64133e-08  hitchhiker  2.66409e-06 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4171  levansucrase  38.43 
 
 
526 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0733922  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4096  levansucrase  38.68 
 
 
527 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0480075  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3698  levansucrase  38.43 
 
 
526 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4270  levansucrase  38.68 
 
 
527 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169981  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3247  levansucrase  38.68 
 
 
527 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.36332  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1531  Levansucrase  38.82 
 
 
584 aa  260  4e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.515752  normal  0.219322 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6116  levansucrase  38.93 
 
 
531 aa  259  7e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.116097 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0822  levansucrase  37.58 
 
 
494 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0735  levansucrase  37.58 
 
 
494 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1872  levansucrase  37.36 
 
 
509 aa  257  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2021  levansucrase  36.78 
 
 
534 aa  256  4e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00566302  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0466  levansucrase  37.36 
 
 
521 aa  255  8e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2102  levansucrase precursor  37.36 
 
 
521 aa  255  9e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1984  levansucrase  37.36 
 
 
494 aa  255  1e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0714  levansucrase  37.36 
 
 
494 aa  255  1e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1010  levansucrase  37.36 
 
 
494 aa  255  1e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.450168  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4097  Beta-fructofuranosidase  34.59 
 
 
451 aa  226  4e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2488  glycoside hydrolase family 68  35.29 
 
 
471 aa  214  2e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1938  Levansucrase  34.8 
 
 
436 aa  199  6e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0964  levansucrase  29.46 
 
 
385 aa  169  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1879  levansucrase  30.31 
 
 
377 aa  146  8e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1411  hypothetical protein  25.06 
 
 
1002 aa  86.7  7e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1410  hypothetical protein  26.08 
 
 
1025 aa  85.9  1e-15  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1409  hypothetical protein  24.29 
 
 
1009 aa  85.1  2e-15  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3850  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  26.79 
 
 
319 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0183549  normal  0.803751 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>