199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2076 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2076  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  327  5e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.969502  decreased coverage  0.00116153 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2278  universal stress protein family  84.38 
 
 
167 aa  275  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  4.72572e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2547  UspA domain-containing protein  64.02 
 
 
166 aa  217  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.903802  hitchhiker  2.2804e-07 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4004  hypothetical protein  64.02 
 
 
167 aa  216  9e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209434  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1927  UspA domain-containing protein  64.97 
 
 
165 aa  208  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  4.83446e-05  hitchhiker  1.2349e-12 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1767  UspA domain-containing protein  66.24 
 
 
165 aa  208  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  2.40026e-08 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41880  universal stress protein  59.51 
 
 
165 aa  208  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3555  universal stress protein family protein  58.9 
 
 
165 aa  206  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2326  universal stress protein  63.69 
 
 
165 aa  204  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341198  hitchhiker  3.87778e-05 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3444  UspA domain-containing protein  63.69 
 
 
165 aa  204  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0150899  hitchhiker  0.00194101 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  30.13 
 
 
161 aa  86.7  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1831  putative universal stress protein  30.57 
 
 
167 aa  78.2  5e-14  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322893  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3274  UspA domain-containing protein  28.21 
 
 
160 aa  72  3e-12  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0533854 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1348  UspA domain protein  30.82 
 
 
157 aa  68.6  3e-11  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  29.61 
 
 
151 aa  58.9  3e-08  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 
151 aa  58.9  3e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  28.76 
 
 
149 aa  58.2  5e-08  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  28.76 
 
 
149 aa  57.4  9e-08  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  30.32 
 
 
156 aa  56.6  1e-07  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  28.3 
 
 
147 aa  54.7  5e-07  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  27.85 
 
 
283 aa  54.7  6e-07  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  1.75107e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  28.39 
 
 
140 aa  54.3  7e-07  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  28.66 
 
 
142 aa  54.3  7e-07  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3344  UspA domain protein  26.92 
 
 
141 aa  53.1  1e-06  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225845  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  29.03 
 
 
151 aa  53.5  1e-06  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  30.46 
 
 
140 aa  53.1  2e-06  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  29.01 
 
 
288 aa  52.4  2e-06  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0818  UspA domain-containing protein  26.75 
 
 
151 aa  52.8  2e-06  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.128659 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  32.56 
 
 
143 aa  52.8  2e-06  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3081  UspA domain-containing protein  26.63 
 
 
177 aa  52.8  2e-06  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  1.10686e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3822  UspA domain protein  28.66 
 
 
159 aa  52.4  3e-06  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0223  UspA domain protein  28.68 
 
 
148 aa  52.4  3e-06  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.189341  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  27.92 
 
 
278 aa  51.6  4e-06  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  30.18 
 
 
142 aa  52  4e-06  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3134  hypothetical protein  27.74 
 
 
285 aa  51.6  5e-06  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  28.66 
 
 
142 aa  51.2  6e-06  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.50335e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  25.32 
 
 
152 aa  51.2  7e-06  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  25.32 
 
 
515 aa  50.8  8e-06  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  30.63 
 
 
300 aa  50.8  8e-06  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  28.23 
 
 
141 aa  50.1  1e-05  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  26.45 
 
 
148 aa  50.4  1e-05  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  30.63 
 
 
287 aa  50.4  1e-05  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2980  UspA domain-containing protein  29.13 
 
 
143 aa  49.7  2e-05  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  24.39 
 
 
290 aa  49.3  2e-05  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  25.81 
 
 
295 aa  49.3  2e-05  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  29.68 
 
 
156 aa  49.3  2e-05  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1859  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 
285 aa  48.9  3e-05  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  25.48 
 
 
145 aa  49.3  3e-05  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  25.66 
 
 
159 aa  48.9  3e-05  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0913  UspA domain-containing protein  30.32 
 
 
138 aa  48.9  3e-05  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.455185 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  28.31 
 
 
155 aa  48.9  3e-05  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  27.11 
 
 
147 aa  49.3  3e-05  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  26.87 
 
 
317 aa  49.3  3e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  27.74 
 
 
145 aa  48.5  4e-05  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0519  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 
188 aa  48.1  5e-05  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2846  hypothetical protein  24.84 
 
 
145 aa  48.1  5e-05  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 
147 aa  48.1  5e-05  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  8.35821e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  29.94 
 
 
143 aa  48.1  5e-05  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0929  UspA domain protein  28.37 
 
 
326 aa  48.1  6e-05  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  29.11 
 
 
300 aa  47.8  7e-05  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  25.16 
 
 
146 aa  47.8  8e-05  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  25.49 
 
 
162 aa  47.8  8e-05  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  29.84 
 
 
150 aa  47.4  9e-05  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  30.13 
 
 
294 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3712  universal stress protein  28.22 
 
 
307 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  27.1 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  27.1 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  27.63 
 
 
144 aa  47  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3170  UspA domain protein  27.1 
 
 
167 aa  47  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  25.19 
 
 
317 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3330  UspA domain-containing protein  28.95 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  34.06 
 
 
283 aa  46.6  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2643  universal stress protein UspA-like protein  26.06 
 
 
168 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.795343  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  26.62 
 
 
295 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  28.03 
 
 
297 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0966  UspA domain protein  27.66 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  27.1 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  28.3 
 
 
144 aa  46.6  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1146  UspA domain protein  25 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1042  UspA domain-containing protein  28.95 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.49662 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  26.81 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  31.61 
 
 
294 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  30.72 
 
 
164 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0874  UspA domain-containing protein  27.63 
 
 
143 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  29.85 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3148  UspA domain-containing protein  27.63 
 
 
143 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  29.79 
 
 
162 aa  45.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3185  UspA domain-containing protein  27.44 
 
 
170 aa  45.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  27.1 
 
 
159 aa  45.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  25.32 
 
 
149 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  3.16755e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  25 
 
 
147 aa  45.1  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  29.32 
 
 
154 aa  44.7  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  30 
 
 
166 aa  45.1  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3249  UspA domain-containing protein  26.97 
 
 
143 aa  45.1  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  32.37 
 
 
170 aa  44.7  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2084  UspA domain protein  24.2 
 
 
140 aa  44.7  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  30.28 
 
 
301 aa  44.7  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  32.67 
 
 
155 aa  44.7  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  32.37 
 
 
170 aa  44.7  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  28.99 
 
 
151 aa  44.7  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>