More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2018 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2018  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 242 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.426068  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2209  dienelactone hydrolase family protein  93.39 
 
 		 242 aa  474  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670258  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1626  dienelactone hydrolase  78.24 
 
 		 242 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3501  dienelactone hydrolase  73.22 
 
 		 241 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.572778  normal  0.863924 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4178  dienelactone hydrolase  72.8 
 
 		 241 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3749  dienelactone hydrolase  73.22 
 
 		 241 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1690  dienelactone hydrolase  71.97 
 
 		 241 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0305937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3677  hypothetical protein  69.46 
 
 		 241 aa  348  6e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43840  hypothetical protein  69.04 
 
 		 241 aa  345  5e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2490  dienelactone hydrolase  56.25 
 
 		 262 aa  263  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0499  dienelactone hydrolase  43.75 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1015  dienelactone hydrolase  42.92 
 
 		 261 aa  199  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0264245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02015  dienelactone hydrolase  44.16 
 
 		 264 aa  199  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2775  dienelactone hydrolase  46.38 
 
 		 269 aa  198  6e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2592  hypothetical protein  41.03 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2719  hypothetical protein  40.6 
 
 		 238 aa  186  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0694  dienelactone hydrolase  40.25 
 
 		 271 aa  186  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.115096  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1920  dienelactone hydrolase  41.6 
 
 		 264 aa  185  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2303  dienelactone hydrolase  41.6 
 
 		 264 aa  185  6e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2163  dienelactone hydrolase  38.91 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163998  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1803  dienelactone hydrolase family protein  38.24 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.100178  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1497  dienelactone hydrolase  38.78 
 
 		 246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3134  dienelactone hydrolase  41 
 
 		 234 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0587579  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  37.45 
 
 		 263 aa  169  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0163  dienelactone hydrolase  38.91 
 
 		 318 aa  167  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1219  carboxymethylenebutenolidase  34.87 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0189806  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  36.99 
 
 		 263 aa  166  5e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1264  dienelactone hydrolase family protein  34.45 
 
 		 237 aa  161  7e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4659  dienelactone hydrolase  33.89 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1093  dienelactone hydrolase  36.21 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4080  dienelactone hydrolase  35.42 
 
 		 244 aa  152  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240265  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2612  hypothetical protein  36.7 
 
 		 238 aa  150  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  35.66 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0347  dienelactone hydrolase  34.02 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.971139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  33.88 
 
 		 269 aa  149  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2739  hypothetical protein  34.47 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1525  dienelactone hydrolase  37.95 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0014  dienelactone hydrolase  35.63 
 
 		 273 aa  146  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3656  dienelactone hydrolase  37.13 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2104  dienelactone hydrolase  41.88 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0464175  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  33.47 
 
 		 270 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4214  hypothetical protein  33.61 
 
 		 262 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4157  dienelactone hydrolase  38.1 
 
 		 237 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138582  normal  0.0101627 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  32.24 
 
 		 250 aa  138  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0569  dienelactone hydrolase  33.76 
 
 		 267 aa  138  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000352652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2350  dienelactone hydrolase  36.19 
 
 		 259 aa  138  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49330  hypothetical protein  34.48 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.295044  normal  0.0937035 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3611  dienelactone hydrolase  32.14 
 
 		 267 aa  135  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000690208  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0425  dienelactone hydrolase  31.54 
 
 		 268 aa  135  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18094  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0559  dienelactone hydrolase  32.92 
 
 		 265 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  32.66 
 
 		 263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1805  dienelactone hydrolase  30.17 
 
 		 245 aa  131  6.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.0741289 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  32.79 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2218  dienelactone hydrolase  30.96 
 
 		 264 aa  130  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000562202  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1196  dienelactone hydrolase  34.74 
 
 		 263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1370  dienelactone hydrolase  30.04 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4232  dienelactone hydrolase  33.8 
 
 		 263 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.215176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  35.95 
 
 		 356 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7419  hypothetical protein  37.18 
 
 		 234 aa  126  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4947  dienelactone hydrolase  37.19 
 
 		 241 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.316291  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0597  dienelactone hydrolase family protein  36.1 
 
 		 243 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1184  dienelactone hydrolase  31.45 
 
 		 265 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00788305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1214  dienelactone hydrolase  31.05 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.602009  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1677  dienelactone hydrolase family protein  32.66 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  32.26 
 
 		 262 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0480  dienelactone hydrolase family protein  33.33 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1245  dienelactone hydrolase  32.66 
 
 		 261 aa  123  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00955102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0612  dienelactone hydrolase family protein  36.1 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0501  dienelactone hydrolase family protein  35.27 
 
 		 242 aa  122  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.821381  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0170  dienelactone hydrolase  29.19 
 
 		 246 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135133  normal  0.545513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4133  dienelactone hydrolase  37.81 
 
 		 237 aa  115  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.850524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2281  dienelactone hydrolase  32.78 
 
 		 245 aa  111  9e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187081 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1980  dienelactone hydrolase  32.78 
 
 		 245 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.228213 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3045  dienelactone hydrolase  33.61 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3032  dienelactone hydrolase  36.72 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345773 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4373  dienelactone hydrolase  32.02 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.68292 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0940  dienelactone hydrolase  29.6 
 
 		 279 aa  100  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2650  dienelactone hydrolase  29.25 
 
 		 265 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2621  dienelactone hydrolase  29.25 
 
 		 265 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2665  dienelactone hydrolase  29.25 
 
 		 265 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal  0.690988 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  31.22 
 
 		 254 aa  94.4  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2003  dienelactone hydrolase  26.27 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  31.18 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  27.6 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2579  Carboxymethylenebutenolidase  27.74 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.315807  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  26.41 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  28.8 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  30.85 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  27.27 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  28.87 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  25.68 
 
 		 247 aa  72  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  29.35 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  26.46 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  25.7 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  26.53 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  30.11 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  27.37 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  28.18 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  27.11 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  28.57 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>