More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1999 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  100 
 
 		 271 aa  550  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  94.1 
 
 		 271 aa  522  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  77.36 
 
 		 270 aa  425  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  74.8 
 
 		 270 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  74.8 
 
 		 270 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  75.3 
 
 		 270 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  74.5 
 
 		 270 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  71.37 
 
 		 270 aa  371  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  69.72 
 
 		 269 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  69.64 
 
 		 269 aa  348  5e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  57.72 
 
 		 270 aa  295  5e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  36.96 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  36.96 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  36.58 
 
 		 263 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  36.58 
 
 		 263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  35.41 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  35.97 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  38.19 
 
 		 261 aa  142  8e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  35.57 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  33.45 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  35.78 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  35.78 
 
 		 261 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  37.61 
 
 		 264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  32.32 
 
 		 331 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  33.98 
 
 		 286 aa  128  8.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  35.94 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1973  OmpA/MotB domain-containing protein  30.86 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  39.68 
 
 		 890 aa  97.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  41.59 
 
 		 398 aa  96.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  41.9 
 
 		 219 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  41.9 
 
 		 219 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  41.9 
 
 		 219 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  41.9 
 
 		 219 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  41.9 
 
 		 219 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  41.9 
 
 		 219 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  41.9 
 
 		 219 aa  93.2  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  41.9 
 
 		 219 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2385  OmpA/MotB domain protein  41.74 
 
 		 416 aa  93.2  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  41.9 
 
 		 219 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  41.9 
 
 		 220 aa  92.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  41.9 
 
 		 220 aa  92.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  41.9 
 
 		 220 aa  92.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  41.9 
 
 		 220 aa  92.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  41.9 
 
 		 220 aa  92.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  38.4 
 
 		 537 aa  92.4  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  40.34 
 
 		 631 aa  90.5  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  40.95 
 
 		 220 aa  90.5  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  30.91 
 
 		 239 aa  87.8  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  47.57 
 
 		 334 aa  87  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  44.23 
 
 		 226 aa  87  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  38.84 
 
 		 620 aa  87  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 417 aa  86.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  41.51 
 
 		 320 aa  86.3  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  46.15 
 
 		 330 aa  86.3  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  44.44 
 
 		 209 aa  85.9  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  35.77 
 
 		 185 aa  85.5  8e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  40 
 
 		 220 aa  85.5  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  37.84 
 
 		 224 aa  85.5  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  43.52 
 
 		 209 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  39.84 
 
 		 669 aa  85.1  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  41.32 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  35.21 
 
 		 587 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.83 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  38.41 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  36.75 
 
 		 630 aa  83.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0019  putative outer membrane lipoprotein  40.95 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3787  putative outer membrane lipoprotein  40.95 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  40.57 
 
 		 543 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  40.95 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  42.59 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  41.67 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1602  outer membrane protein OprF  38.68 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  41.03 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  38.41 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  47 
 
 		 356 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.62 
 
 		 542 aa  82  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  43.52 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  40.59 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  43.1 
 
 		 206 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  42.72 
 
 		 335 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 		 427 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  43.1 
 
 		 206 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3257  OmpA/MotB domain-containing protein  37.96 
 
 		 576 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  39.62 
 
 		 544 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  41.67 
 
 		 707 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  39.64 
 
 		 498 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5154  OmpA/MotB domain protein  33.77 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  42.59 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  40.19 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  39.42 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  40.37 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  42.57 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  38.52 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  37.72 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  36.92 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  37.07 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  38.14 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>