More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1964 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_1964  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  597  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00574868  normal  0.693869 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2154  hypothetical protein  95.51 
 
 
282 aa  535  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0257018  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1851  hypothetical protein  72.83 
 
 
303 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33710  PvdO  70 
 
 
284 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  6.19204e-05  normal  0.0102341 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2864  hypothetical protein  71.32 
 
 
283 aa  398  1e-110  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1679  hypothetical protein  67.79 
 
 
292 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1989  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  68.44 
 
 
301 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4081  hypothetical protein  65.8 
 
 
286 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3539  hypothetical protein  60.54 
 
 
293 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25450  hypothetical protein  67.48 
 
 
246 aa  346  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  38.64 
 
 
570 aa  172  6e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  39.59 
 
 
292 aa  169  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  37.55 
 
 
535 aa  166  3e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  38.49 
 
 
413 aa  166  3e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  32.73 
 
 
338 aa  163  2e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  36.58 
 
 
654 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  36.19 
 
 
657 aa  162  8e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  38.37 
 
 
1911 aa  162  8e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  39.69 
 
 
523 aa  160  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2124  serine/threonine protein kinase  37.18 
 
 
698 aa  159  7e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2806  hypothetical protein  35.66 
 
 
292 aa  157  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.232459  normal  0.401097 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  35.74 
 
 
616 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00418  hypothetical protein  33.56 
 
 
556 aa  152  6e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56953  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  38.37 
 
 
892 aa  149  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  36.22 
 
 
291 aa  149  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  33.45 
 
 
277 aa  146  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  36.55 
 
 
820 aa  145  6e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  34.94 
 
 
929 aa  144  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  33.56 
 
 
628 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  31.14 
 
 
549 aa  143  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  31.14 
 
 
600 aa  143  3e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  36.69 
 
 
358 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  35.34 
 
 
289 aa  143  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  34.8 
 
 
416 aa  141  1e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  2.38215e-05  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  37.45 
 
 
603 aa  140  2e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  37.39 
 
 
636 aa  139  4e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  38.4 
 
 
877 aa  139  5e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2920  hypothetical protein  30.94 
 
 
551 aa  139  7e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000907563  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  36.9 
 
 
882 aa  138  8e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  32.66 
 
 
586 aa  139  8e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  38.03 
 
 
522 aa  138  9e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  36.02 
 
 
664 aa  137  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2069  hypothetical protein  35.76 
 
 
281 aa  135  8e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425192  normal  0.19976 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  35.6 
 
 
620 aa  134  2e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  36.51 
 
 
781 aa  133  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  37.35 
 
 
925 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  33.6 
 
 
287 aa  132  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  35.74 
 
 
351 aa  132  7e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  34.54 
 
 
623 aa  132  9e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  30.8 
 
 
802 aa  131  1e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  36.65 
 
 
346 aa  131  1e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  34.13 
 
 
269 aa  131  1e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  35.71 
 
 
1196 aa  131  1e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  35.57 
 
 
637 aa  130  2e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  37.45 
 
 
527 aa  129  4e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  36.16 
 
 
538 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  33.21 
 
 
625 aa  128  1e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  33.2 
 
 
587 aa  127  2e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  33.33 
 
 
491 aa  127  2e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  38.28 
 
 
862 aa  125  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  36.15 
 
 
618 aa  124  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  33.2 
 
 
740 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  34.66 
 
 
593 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  34.66 
 
 
621 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3053  serine/threonine protein kinase  33.84 
 
 
611 aa  123  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454143  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  35.63 
 
 
617 aa  122  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1727  hypothetical protein  34.48 
 
 
305 aa  122  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.172162  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  35.21 
 
 
654 aa  121  1e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  34.27 
 
 
637 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  34.66 
 
 
517 aa  119  6e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  31.6 
 
 
497 aa  119  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  32.39 
 
 
267 aa  118  1e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0221  protein of unknown function DUF323  31.66 
 
 
293 aa  118  1e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.411087  normal  0.267436 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  30.91 
 
 
325 aa  118  1e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  34.68 
 
 
616 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  28 
 
 
348 aa  115  1e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  29.73 
 
 
267 aa  114  1e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  2.35261e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  30.15 
 
 
319 aa  114  2e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  28 
 
 
348 aa  114  2e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  30.94 
 
 
1104 aa  114  2e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  30.5 
 
 
398 aa  114  2e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  33.08 
 
 
584 aa  113  4e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  31.4 
 
 
336 aa  113  4e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.82 
 
 
554 aa  112  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  28.04 
 
 
433 aa  112  7e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  30.83 
 
 
426 aa  112  8e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  31.6 
 
 
611 aa  111  1e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0757  protein of unknown function DUF323  28.38 
 
 
287 aa  110  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  27.42 
 
 
390 aa  110  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  30.92 
 
 
1132 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  31 
 
 
751 aa  110  4e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2020  protein of unknown function DUF323  31.8 
 
 
292 aa  108  8e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1993  protein of unknown function DUF323  31.8 
 
 
292 aa  108  8e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0718  protein of unknown function DUF323  33.59 
 
 
298 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  31.62 
 
 
398 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2017  hypothetical protein  28.3 
 
 
287 aa  107  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  7.95883e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  32.13 
 
 
453 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  30.1 
 
 
826 aa  106  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0821  hypothetical protein  29.24 
 
 
624 aa  106  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0811  protein of unknown function DUF323  31.55 
 
 
323 aa  105  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00245375  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>