88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1818 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_1818  cell division protein ZipA  100 
 
 
287 aa  578  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00237692  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3657  cell division protein ZipA, putative  95.49 
 
 
288 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1593  cell division protein ZipA  76.85 
 
 
297 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.953645  normal  0.0582904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4275  cell division protein ZipA  76.17 
 
 
317 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.230657  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3601  cell division protein ZipA  77.03 
 
 
294 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00102901  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3839  cell division protein ZipA  77.78 
 
 
296 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.533942  normal  0.453684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1800  cell division protein ZipA  79.86 
 
 
288 aa  395  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  5.42289e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3805  cell division protein ZipA  68.98 
 
 
290 aa  391  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44670  cell division protein ZipA  68.23 
 
 
289 aa  381  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  1.66616e-06  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2747  cell division protein ZipA  70.49 
 
 
273 aa  356  3e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0209511  normal  0.778206 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30300  cell division protein ZipA  63.57 
 
 
285 aa  314  1e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00228143  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3406  cell division protein ZipA  50 
 
 
342 aa  155  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.037804  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1880  cell division protein ZipA  48.03 
 
 
378 aa  145  7e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00963367  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1166  cell division protein ZipA  51.39 
 
 
338 aa  143  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00263828  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0698  cell division protein ZipA  52.48 
 
 
423 aa  141  1e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000137968  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1775  cell division protein ZipA  37.1 
 
 
444 aa  141  1e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  7.85839e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3188  cell division protein ZipA  31.25 
 
 
318 aa  129  4e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  1.14957e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01849  putative cell division protein ZipA  38.53 
 
 
532 aa  129  4e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  7.20227e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3467  putative cell division protein ZipA  46.32 
 
 
380 aa  129  7e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.592721  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3266  cell division protein ZipA  32.67 
 
 
308 aa  127  2e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  1.94791e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2745  cell division protein ZipA  32.7 
 
 
328 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  2.02555e-11  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1431  cell division protein ZipA  32.7 
 
 
328 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  1.15639e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1320  cell division protein ZipA  32.7 
 
 
327 aa  126  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.80007e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1015  cell division protein ZipA  41.89 
 
 
340 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  5.90844e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0778  cell division protein ZipA  45.38 
 
 
336 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  8.81239e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004154  cell division protein ZipA  43.94 
 
 
318 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.97505e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2378  cell division protein ZipA  40.69 
 
 
335 aa  122  8e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  1.17796e-07  unclonable  1.27891e-06 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0491  cell division protein ZipA  42 
 
 
291 aa  119  4e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  6.77143e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1737  cell division protein ZipA  43.28 
 
 
341 aa  118  1e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.16283e-07  hitchhiker  1.49042e-09 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3445  cell division protein ZipA  45.45 
 
 
332 aa  118  1e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  7.60929e-10  decreased coverage  3.14053e-05 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01311  cell division protein ZipA  40.74 
 
 
323 aa  117  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2354  cell division protein ZipA  29.13 
 
 
308 aa  116  4e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2848  cell division protein ZipA  38.64 
 
 
311 aa  115  1e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.1699e-07  unclonable  1.49917e-08 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1688  cell division protein ZipA  36.51 
 
 
325 aa  112  7e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  3.83332e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1507  cell division protein ZipA  40.26 
 
 
346 aa  110  2e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.82258e-08  decreased coverage  6.92006e-10 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1574  cell division protein ZipA  39.61 
 
 
346 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  2.16303e-06  unclonable  3.39472e-05 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2462  cell division protein ZipA  41.04 
 
 
352 aa  109  4e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  5.10494e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1694  cell division protein ZipA  40 
 
 
298 aa  108  7e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  8.42049e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2515  cell division protein ZipA  40 
 
 
336 aa  108  8e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  2.31315e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1515  cell division protein ZipA  41.04 
 
 
350 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  4.03723e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2365  cell division protein ZipA  41.01 
 
 
342 aa  108  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  1.98089e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1704  cell division protein ZipA  42.64 
 
 
368 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  8.75421e-09  decreased coverage  1.08391e-10 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2759  cell division protein ZipA  31.7 
 
 
356 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  2.77167e-07  hitchhiker  6.36327e-05 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1568  cell division protein ZipA  41.61 
 
 
346 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  5.09277e-08  unclonable  7.65641e-11 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2680  cell division protein ZipA  31.7 
 
 
356 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  7.67687e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2897  cell division protein ZipA  42.64 
 
 
344 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2655  cell division protein ZipA  41.86 
 
 
364 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  4.81866e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1523  cell division protein  33.55 
 
 
230 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.918664  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0654  cell division protein ZipA  33.55 
 
 
225 aa  104  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0067  cell division protein ZipA  35.06 
 
 
269 aa  104  1e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.218831  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2663  cell division protein ZipA  40.91 
 
 
328 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  1.46198e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2572  cell division protein ZipA  40.91 
 
 
328 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  2.3932e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2793  cell division protein ZipA  40.91 
 
 
328 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  5.05214e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2621  cell division protein ZipA  40.91 
 
 
328 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  4.42866e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2687  cell division protein ZipA  40.91 
 
 
328 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000108647  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2940  cell division protein ZipA  38.06 
 
 
317 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  4.2713e-08  normal  0.111677 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2338  cell division protein ZipA  27.74 
 
 
291 aa  99.4  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.385149  normal  0.0462003 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2025  cell division protein ZipA  40.15 
 
 
267 aa  99.4  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0277053  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2542  hypothetical protein  39.37 
 
 
259 aa  98.2  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3643  cell division protein ZipA  38.81 
 
 
332 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.10035e-08  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02273  hypothetical protein  38.81 
 
 
328 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  6.12768e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2567  cell division protein ZipA  38.81 
 
 
332 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  1.67953e-08  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02312  cell division protein ZipA  38.81 
 
 
328 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  9.11583e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2547  cell division protein ZipA  38.81 
 
 
328 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.73921e-20  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1249  cell division protein ZipA  38.81 
 
 
328 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.96931e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2699  cell division protein ZipA  38.81 
 
 
328 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.64058e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1266  cell division protein ZipA  38.81 
 
 
328 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  8.46548e-08  decreased coverage  2.25757e-05 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2768  cell division protein ZipA  38.81 
 
 
328 aa  95.9  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.20135e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2672  hypothetical protein  38.58 
 
 
259 aa  96.3  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0680  cell division protein ZipA  39.2 
 
 
365 aa  89.4  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0264468  normal  0.885253 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1576  cell division protein ZipA  33.08 
 
 
395 aa  84  3e-15  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2585  cell division protein ZipA  31.08 
 
 
246 aa  82.8  5e-15  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.808255 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2129  cell division protein ZipA  27.38 
 
 
243 aa  82.8  5e-15  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.281961  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2048  cell division protein ZipA  27.38 
 
 
243 aa  82.8  6e-15  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00742  cell division protein ZipA  28.83 
 
 
243 aa  81.6  1e-14  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.415123  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0371  cell division protein ZipA  31.5 
 
 
335 aa  80.9  2e-14  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1879  cell division protein ZipA  35.21 
 
 
410 aa  80.9  2e-14  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0162  cell division protein ZipA  36.23 
 
 
331 aa  78.2  2e-13  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2439  cell division protein ZipA, putative  33.85 
 
 
222 aa  74.7  2e-12  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.734169  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0468  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  25.29 
 
 
341 aa  70.1  4e-11  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0350  putative cell division protein  28.09 
 
 
340 aa  68.2  2e-10  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0531871  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0319  cell division protein  30.95 
 
 
341 aa  67.4  3e-10  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00406721  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2191  ZipA FtsZ-binding region  30.07 
 
 
360 aa  57.4  3e-07  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0646  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  28.8 
 
 
441 aa  56.2  6e-07  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.707138  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1240  cell division protein-like  27.94 
 
 
302 aa  52.8  6e-06  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  1.93817e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0623  hypothetical protein  27.54 
 
 
389 aa  50.1  4e-05  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1733  ZipA-like protein  24.34 
 
 
421 aa  48.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0528792  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1402  ZipA-like protein  27.03 
 
 
438 aa  45.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.387913  normal  0.648083 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>