More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1812 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1794  guanine deaminase  82.56 
 
 
434 aa  759  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.868706  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1812  guanine deaminase  100 
 
 
444 aa  918  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00974317  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1587  guanine deaminase  77.67 
 
 
434 aa  717  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3607  guanine deaminase  76.51 
 
 
434 aa  713  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2754  guanine deaminase  72.73 
 
 
433 aa  656  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.481519 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3663  guanine aminohydrolase  95.19 
 
 
437 aa  862  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44770  guanine deaminase  75.29 
 
 
434 aa  676  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.828703  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4281  guanine deaminase  77.91 
 
 
434 aa  718  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523934  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3845  guanine deaminase  77.67 
 
 
434 aa  721  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.397164 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3812  guanine deaminase  75.06 
 
 
434 aa  673  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203808  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22260  guanine deaminase  69.23 
 
 
432 aa  627  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.119985  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1677  guanine deaminase  67.67 
 
 
433 aa  616  1e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4872  guanine deaminase  60.58 
 
 
449 aa  550  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.673098  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01787  hypothetical protein  56.91 
 
 
466 aa  524  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01660  guanine deaminase  57.69 
 
 
456 aa  515  1e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  1.18805e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0210  guanine deaminase  56.05 
 
 
432 aa  507  1e-142  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.20137  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2684  guanine deaminase  56.98 
 
 
441 aa  504  1e-141  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.573349 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0809  guanine deaminase  52.95 
 
 
438 aa  495  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3016  guanine deaminase  53.18 
 
 
438 aa  496  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02716  guanine deaminase  53.18 
 
 
439 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712282  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3209  guanine deaminase  53.18 
 
 
438 aa  496  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4173  guanine deaminase  53.18 
 
 
438 aa  497  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0825  guanine deaminase  53.18 
 
 
438 aa  496  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02678  hypothetical protein  53.18 
 
 
439 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.600174  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3043  guanine deaminase  52.73 
 
 
438 aa  492  1e-138  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3717  guanine deaminase  57.91 
 
 
429 aa  481  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3192  guanine deaminase  53.41 
 
 
449 aa  479  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.673626  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1807  guanine deaminase  55.35 
 
 
446 aa  476  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1336  guanine deaminase  57.72 
 
 
435 aa  476  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.521939  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0977  guanine deaminase  53.15 
 
 
439 aa  471  1e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0414452 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2299  guanine deaminase  56.58 
 
 
443 aa  471  1e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255928  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0539  guanine deaminase  52.68 
 
 
439 aa  468  1e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1018  guanine deaminase  52.68 
 
 
439 aa  468  1e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4129  guanine deaminase  52.2 
 
 
438 aa  466  1e-130  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1727  guanine deaminase  52.66 
 
 
452 aa  462  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.434119  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2046  guanine deaminase  52.52 
 
 
452 aa  464  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177828  normal  0.651599 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1087  guanine deaminase  52.42 
 
 
457 aa  464  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0146521 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0893  guanine deaminase  52.2 
 
 
438 aa  461  1e-128  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0756096  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2377  guanine deaminase  51.04 
 
 
439 aa  459  1e-128  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796063  normal  0.732304 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1148  amidohydrolase  55.45 
 
 
486 aa  455  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0946  guanine deaminase  51.26 
 
 
451 aa  454  1e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334638  normal  0.424226 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0881  guanine deaminase  52.2 
 
 
438 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.821524  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2429  guanine deaminase  49.88 
 
 
431 aa  448  1e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4655  guanine deaminase  49.77 
 
 
457 aa  445  1e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0274988  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3045  guanine deaminase  51.29 
 
 
457 aa  446  1e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.206823  normal  0.141945 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0456  guanine deaminase  50.24 
 
 
434 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4260  guanine deaminase  50.12 
 
 
425 aa  442  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910106  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0370  guanine deaminase  50 
 
 
434 aa  439  1e-122  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0354  guanine deaminase  50.25 
 
 
434 aa  441  1e-122  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1610  guanine deaminase  52.91 
 
 
437 aa  438  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4625  guanine deaminase  49.17 
 
 
447 aa  435  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.430513 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0709  guanine deaminase  51.4 
 
 
441 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2609  guanine deaminase  52.79 
 
 
436 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.694405  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0981  guanine deaminase  52.79 
 
 
436 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0166  guanine deaminase  52.79 
 
 
436 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301231  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3023  guanine deaminase  52.79 
 
 
436 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2918  guanine deaminase  52.79 
 
 
436 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2978  guanine deaminase  52.79 
 
 
436 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528772  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0463  guanine deaminase  52.79 
 
 
436 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.451458  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2250  guanine deaminase  50.47 
 
 
444 aa  428  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1926  guanine deaminase  50.71 
 
 
444 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0907648  normal  0.0757179 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2429  guanine deaminase  48.24 
 
 
440 aa  428  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.935428  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2099  guanine deaminase  49.76 
 
 
445 aa  428  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.716358 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1896  guanine deaminase  50 
 
 
433 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0545  guanine deaminase  50 
 
 
428 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3142  guanine deaminase  48.79 
 
 
436 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.14624  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3326  guanine deaminase  48.1 
 
 
435 aa  420  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2623  guanine deaminase  49.07 
 
 
454 aa  415  1e-115  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0889  guanine deaminase  48.23 
 
 
446 aa  416  1e-115  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159977  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2838  guanine deaminase  46.85 
 
 
434 aa  412  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.444806  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0293  guanine deaminase  48.89 
 
 
426 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1786  guanine deaminase  50 
 
 
453 aa  414  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4494  guanine deaminase  47.1 
 
 
435 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0638874  normal  0.0636141 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2870  guanine deaminase  49.13 
 
 
435 aa  405  1e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.153116 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1143  guanine deaminase  48.05 
 
 
428 aa  405  1e-112  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.14597  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2724  guanine deaminase  49.75 
 
 
425 aa  404  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3479  guanine deaminase  48.48 
 
 
461 aa  404  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02520  guanine deaminase  46.37 
 
 
435 aa  399  1e-110  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1905  guanine deaminase  49.36 
 
 
429 aa  398  1e-110  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0081  amidohydrolase  48.97 
 
 
513 aa  392  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3458  guanine deaminase  46.91 
 
 
434 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.164027 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0801  guanine deaminase  48.1 
 
 
445 aa  389  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3881  guanine deaminase  46.39 
 
 
428 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2771  guanine deaminase  47.49 
 
 
428 aa  375  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.888774  normal  0.860518 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1049  guanine deaminase  50.14 
 
 
427 aa  372  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1129  guanine deaminase  49.86 
 
 
427 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.387393  normal  0.517294 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3295  guanine deaminase  45.37 
 
 
445 aa  361  1e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.403629  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1047  guanine deaminase  46.03 
 
 
430 aa  360  3e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.134811  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1496  guanine deaminase  43.72 
 
 
449 aa  354  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1336  guanine deaminase  49.17 
 
 
432 aa  353  3e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.117257  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2147  guanine deaminase  43.44 
 
 
454 aa  345  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1462  guanine deaminase  43.29 
 
 
430 aa  316  6e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0429597  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0506  guanine deaminase  39.16 
 
 
465 aa  313  5e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2606  guanine deaminase  42.33 
 
 
444 aa  300  2e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0256  guanine deaminase  41.36 
 
 
439 aa  294  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1795  guanine deaminase  38.12 
 
 
432 aa  286  4e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.319049  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1468  guanine deaminase  37.04 
 
 
405 aa  270  5e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00567224  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5972  guanine deaminase  38.03 
 
 
419 aa  260  4e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.747945 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5279  amidohydrolase  37.86 
 
 
447 aa  257  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4377  guanine deaminase  34.55 
 
 
469 aa  227  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>