More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1789 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_1789  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
546 aa  1084  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.478165  decreased coverage  0.000703042 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3685  methyl-accepting chemotaxis protein  85.71 
 
 
546 aa  918  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1353  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.8 
 
 
547 aa  533  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.769572  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.31 
 
 
547 aa  513  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0341  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
544 aa  469  1e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0513  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.43 
 
 
542 aa  325  1e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0065  methyl-accepting chemotaxis protein  31.52 
 
 
548 aa  267  3e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.826549  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2256  chemotaxis sensory transducer  31.14 
 
 
548 aa  257  3e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000776973  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0033  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.84 
 
 
593 aa  257  3e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.684678  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1636  methyl-accepting chemotaxis protein  33.09 
 
 
547 aa  255  1e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.24 
 
 
640 aa  224  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  40 
 
 
640 aa  223  5e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  39.73 
 
 
629 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.83 
 
 
638 aa  218  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  33.09 
 
 
541 aa  216  7e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2395  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.12 
 
 
572 aa  215  2e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2968  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.12 
 
 
572 aa  215  2e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.536058 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3351  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.97 
 
 
570 aa  214  4e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0540062  normal  0.0241334 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3580  methyl-accepting chemotaxis protein  37.74 
 
 
546 aa  214  4e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.39 
 
 
541 aa  213  9e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0755  chemotaxis sensory transducer  32.47 
 
 
567 aa  212  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1150  chemotaxis sensory transducer  35.65 
 
 
551 aa  211  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2634  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.05 
 
 
542 aa  211  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.917034  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.48 
 
 
634 aa  211  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3218  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.5 
 
 
551 aa  211  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.359634  normal  0.412717 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.53 
 
 
425 aa  211  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.817651  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  38.11 
 
 
712 aa  209  9e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.77 
 
 
638 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4706  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  31.88 
 
 
541 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.02 
 
 
636 aa  208  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0447  chemotaxis sensory transducer  32.62 
 
 
541 aa  207  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  37.85 
 
 
712 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1334  methyl-accepting chemotaxis protein  35.56 
 
 
550 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.9 
 
 
650 aa  207  5e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.14 
 
 
638 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.52 
 
 
639 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0778  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.26 
 
 
639 aa  206  9e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.66043 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43220  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  41.24 
 
 
652 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2538  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.48 
 
 
521 aa  205  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0549264  normal  0.252917 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5553  methyl-accepting chemotaxis protein  39.04 
 
 
640 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.62 
 
 
637 aa  204  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0712  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.43 
 
 
624 aa  203  5e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  40.11 
 
 
633 aa  204  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.51 
 
 
638 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  40 
 
 
642 aa  204  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.83 
 
 
544 aa  203  6e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.51 
 
 
638 aa  203  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5092  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  39.33 
 
 
640 aa  202  1e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1324  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  44.83 
 
 
523 aa  201  2e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  42.9 
 
 
713 aa  201  2e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48030  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  31.65 
 
 
541 aa  202  2e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.478475 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5160  methyl-accepting chemotaxis protein  44.13 
 
 
647 aa  201  2e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.391343  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.59 
 
 
541 aa  202  2e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4192  chemotaxis sensory transducer  38.44 
 
 
654 aa  201  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  40.11 
 
 
638 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.26 
 
 
639 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.886367 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4658  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.26 
 
 
639 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415489  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0728  chemotaxis sensory transducer  40.16 
 
 
639 aa  199  9e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1124  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.67 
 
 
547 aa  199  1e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00163985  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1630  chemotaxis sensory transducer  32.72 
 
 
541 aa  199  1e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.54 
 
 
542 aa  199  1e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.53 
 
 
541 aa  199  1e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  decreased coverage  3.42214e-05 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.53 
 
 
541 aa  199  1e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.722367  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.11 
 
 
653 aa  199  1e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297466 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.35 
 
 
647 aa  199  1e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0828859  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.93 
 
 
541 aa  199  1e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3680  methyl-accepting chemotaxis protein  41.61 
 
 
676 aa  199  1e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.26 
 
 
639 aa  199  1e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0868  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.95 
 
 
546 aa  198  2e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43710  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  33.39 
 
 
541 aa  198  2e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67010  putative chemotaxis transducer  43.49 
 
 
647 aa  198  2e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.13 
 
 
541 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596764  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4141  chemotaxis transducer  40.26 
 
 
541 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0157  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.47 
 
 
646 aa  197  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.805637  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.35 
 
 
647 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1007  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.62 
 
 
573 aa  198  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.02936  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0379  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  42.72 
 
 
647 aa  198  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.454626  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4541  methyl-accepting chemotaxis protein  38.59 
 
 
541 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.726322  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1798  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  40.06 
 
 
681 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  39.72 
 
 
642 aa  197  4e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4218  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  31.76 
 
 
541 aa  197  4e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.56 
 
 
716 aa  197  5e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3666  chemotaxis transducer  33.21 
 
 
541 aa  197  5e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.260935  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.77 
 
 
543 aa  197  5e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.32 
 
 
637 aa  196  6e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2356  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  39.77 
 
 
619 aa  196  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0809243  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0922  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.85 
 
 
572 aa  196  8e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29760  putative chemotaxis transducer  41.51 
 
 
714 aa  196  8e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.35 
 
 
739 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247309  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.87 
 
 
627 aa  196  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.6 
 
 
541 aa  195  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2268  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.94 
 
 
541 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255239  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2546  putative chemotaxis transducer  41.24 
 
 
714 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.66 
 
 
541 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.452969  normal  0.355365 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0340  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.44 
 
 
541 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.582352  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  37.78 
 
 
626 aa  193  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.61 
 
 
638 aa  193  7e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1006  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.17 
 
 
573 aa  193  7e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.98 
 
 
533 aa  193  8e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.53 
 
 
773 aa  193  8e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>