More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1788 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3686  carbohydrate transporter, putative  89.97 
 
 		 399 aa  637    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1788  major facilitator transporter  100 
 
 		 399 aa  775    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0140849 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 418 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  38.3 
 
 		 412 aa  229  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  38.12 
 
 		 408 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  34.1 
 
 		 399 aa  213  7e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3182  major facilitator transporter  38.36 
 
 		 413 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1381  major facilitator transporter  38.86 
 
 		 394 aa  209  6e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1021  major facilitator transporter  37.8 
 
 		 415 aa  206  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122772 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2647  major facilitator family transporter  38.22 
 
 		 408 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2152  major facilitator transporter  38.22 
 
 		 408 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5698  major facilitator superfamily MFS_1  37.94 
 
 		 415 aa  203  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.574634 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4094  major facilitator superfamily MFS_1  37.27 
 
 		 422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  36.44 
 
 		 402 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0427  major facilitator superfamily MFS_1  41.44 
 
 		 390 aa  193  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.064985  normal  0.054119 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1673  major facilitator superfamily MFS_1  39.6 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  34.19 
 
 		 401 aa  190  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  36.48 
 
 		 397 aa  187  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  33.25 
 
 		 406 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  35.14 
 
 		 407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  38.79 
 
 		 735 aa  182  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0860  major facilitator transporter  38.79 
 
 		 397 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  36.69 
 
 		 390 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2790  major facilitator superfamily MFS_1  36.65 
 
 		 398 aa  176  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7381  permease  33.61 
 
 		 402 aa  175  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0862221  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2694  major facilitator transporter  37.12 
 
 		 392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  33.14 
 
 		 401 aa  169  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1133  major facilitator superfamily MFS_1  34.27 
 
 		 397 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 404 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 400 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  30.14 
 
 		 396 aa  162  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20360  arabinose efflux permease family protein  33.51 
 
 		 410 aa  160  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0512436  normal  0.41144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3167  major facilitator transporter  32 
 
 		 414 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.508842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  30.25 
 
 		 396 aa  159  7e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3841  sugar efflux transporter  28.64 
 
 		 398 aa  159  8e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820491 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  33.14 
 
 		 403 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2898  major facilitator superfamily MFS_1  32.19 
 
 		 402 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.537958  normal  0.729301 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  33.14 
 
 		 396 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 		 403 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2319  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 		 396 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0805208  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3791  sugar efflux transporter  29.89 
 
 		 389 aa  155  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0663735  decreased coverage  0.000000695018 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  32.5 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1499  sugar efflux transporter  28.53 
 
 		 376 aa  155  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671324  normal  0.520287 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  32.93 
 
 		 403 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4451  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 402 aa  155  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0839  sugar efflux transporter  30 
 
 		 399 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  29.41 
 
 		 396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5114  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 399 aa  154  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958171  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1627  sugar efflux transporter  29.68 
 
 		 396 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1648  sugar efflux transporter  29.68 
 
 		 396 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1694  sugar efflux transporter  29.68 
 
 		 396 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0396225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1813  sugar efflux transporter  29.68 
 
 		 396 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 398 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1531  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2601  major facilitator transporter  30.94 
 
 		 404 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  30.05 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2563  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 403 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  30.05 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1635  sugar efflux transporter  29.68 
 
 		 396 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.626484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 400 aa  150  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  30.31 
 
 		 391 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  30.56 
 
 		 394 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84574 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10750  sugar efflux transporter  29.49 
 
 		 396 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3560  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 400 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  30.05 
 
 		 451 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 412 aa  150  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  30.05 
 
 		 451 aa  150  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  30.05 
 
 		 451 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1932  sugar efflux transporter  25.97 
 
 		 388 aa  150  4e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17258  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  30.05 
 
 		 451 aa  150  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  30.05 
 
 		 451 aa  150  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  29.79 
 
 		 391 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3960  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 400 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  29.79 
 
 		 391 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  31.62 
 
 		 400 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  30.75 
 
 		 404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  29.47 
 
 		 404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  29.47 
 
 		 404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  29.47 
 
 		 404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5294  major facilitator transporter  33.83 
 
 		 379 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0868  sugar efflux transporter  29.87 
 
 		 399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.202356  normal  0.905992 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0700  major facilitator superfamily transporter  34.1 
 
 		 394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 397 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 398 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 404 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 391 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  30.54 
 
 		 390 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  29.47 
 
 		 404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1160  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 403 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000554807  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  30.18 
 
 		 404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 		 404 aa  146  5e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 400 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 404 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1277  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 407 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  29.74 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2000  sugar efflux transporter  26.97 
 
 		 398 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0810814 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>