88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1621 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1621  autoinducer synthesis protein  100 
 
 		 226 aa  463  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.672835  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3864  autoinducer synthesis protein PsyI  76.82 
 
 		 244 aa  354  5.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.70516  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0719  N-acylhomoserine lactone synthase YtbI  39.06 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0792  autoinducer synthesis protein  39.06 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0067  autoinducer synthesis protein  33.33 
 
 		 224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.719257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4148  Acyl-homoserine-lactone synthase  35.9 
 
 		 216 aa  128  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4429  Acyl-homoserine-lactone synthase  33.33 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1546  N-acylhomoserine lactone synthase YpsI  33.17 
 
 		 214 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1656  autoinducer synthesis protein  33.17 
 
 		 214 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1716  N-acylhomoserine lactone synthase YpsI  33.17 
 
 		 218 aa  122  6e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105822  hitchhiker  0.000229344 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0101  Acyl-homoserine-lactone synthase  33.33 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0183  N-acylhomoserine lactone synthase YtbI  36.53 
 
 		 175 aa  113  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0180575  hitchhiker  0.000000220703 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1760  autoinducer synthesis protein  32.41 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0123  autoinducer synthesis protein  31.72 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1710  autoinducer synthesis protein  29.63 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0765757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9270  putative autoinducer synthesis protein  32.32 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0259  autoinducer synthesis protein TraI (conjugation factor synthetase)  33.1 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0098  autoinducer synthesis protein  32.03 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1889  autoinducer synthesis protein  36.81 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889914  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0941  autoinducer synthesis protein  36.11 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5196  autoinducer synthesis protein  29.41 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282022  normal  0.0648346 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3396  autoinducer synthesis protein  27.38 
 
 		 206 aa  72  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4570  putative autoinducer synthesis protein  32.89 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5375  putative autoinducer synthesis protein  32.39 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0563585  normal  0.248437 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0957  autoinducer synthesis protein LuxI  28.09 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8335  putative autoinducer synthesis protein  32.45 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.613519  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4437  autoinducer synthesis protein  27.01 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2029  autoinducer synthesis protein  29.95 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5481  putative autoinducer synthesis protein  27.92 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1560  autoinducer synthesis protein  31.25 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.766209  normal  0.485309 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2390  autoinducer synthesis protein  32.65 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2668  autoinducer synthesis protein  30.25 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2929  autoinducer synthesis protein  30.19 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.71548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0965  Acyl-homoserine-lactone synthase  28.92 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.397594  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0608  putative autoinducer synthesis protein  25.81 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0361  autoinducer synthesis protein  24.38 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3811  autoinducer synthesis protein  28.19 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4275  autoinducer synthesis protein  25.13 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.722573  normal  0.550742 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9666  autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  25.29 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165621  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1512  N-acyl homoserine lactone synthase  30.67 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0575581  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1293  autoinducer synthase BpsI  29.33 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133764  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1221  autoinducer synthase BpsI  29.33 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.653596  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2483  N-acylhomoserine lactone synthase  29.33 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0701  autoinducer synthesis protein  24.26 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3286  autoinducer synthesis protein SOLI  28 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.498186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1227  N-acyl homoserine lactone synthase  27.1 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0126  autoinducer synthesis protein  28.17 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2589  autoinducer synthesis protein  25.43 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0609  autoinducer synthase BpsI  29.33 
 
 		 203 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1347  autoinducer synthetase family protein  29.33 
 
 		 203 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0960  autoinducer synthase BpsI  29.33 
 
 		 203 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0331  autoinducer synthase BpsI  29.33 
 
 		 203 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2974  autoinducer synthesis protein  25.16 
 
 		 223 aa  52.4  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.402938 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2998  N-acyl-L-homoserine lactone synthetase-like protein  23.08 
 
 		 225 aa  52  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.897575 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3897  autoinducer synthesis protein LasI  26.92 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156305  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0787  N-acyl-L-homoserine lactone synthetase-like  29.03 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.421704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45940  autoinducer synthesis protein LasI  26.92 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5808  Acyl-homoserine-lactone synthase  31.65 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.167675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1577  autoinducer synthetase  26.45 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24654  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0145  N-acylhomoserine lactone synthase  26.45 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0460086  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1658  autoinducer synthetase  26.45 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0115176  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01928  autoinducer synthase  27.34 
 
 		 182 aa  49.3  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.697337 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2851  autoinducer synthetase  24.73 
 
 		 206 aa  48.9  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0919  autoinducer synthesis protein  24.67 
 
 		 204 aa  48.9  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.142092 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6053  autoinducer synthesis protein  27.81 
 
 		 201 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5823  autoinducer synthesis protein  27.81 
 
 		 201 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.960322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3320  autoinducer synthesis protein  25.4 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2526  autoinducer synthesis protein  22.94 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6489  autoinducer synthesis protein  35.29 
 
 		 119 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191421  normal  0.837558 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0403  autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  26.16 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3969  autoinducer synthesis protein  25.5 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163172  normal  0.0220737 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2331  autoinducer synthesis protein  26.19 
 
 		 212 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.933975  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2175  autoinducer synthesis protein  26.19 
 
 		 212 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.533935 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4280  autoinducer synthesis protein  25.86 
 
 		 207 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0241247  normal  0.0105559 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0417  autoinducer synthesis protein  24.87 
 
 		 218 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3498  phospholipid/glycerol acyltransferase  21.6 
 
 		 191 aa  45.1  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.364609 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1666  autoinducer synthesis protein  26.8 
 
 		 183 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.852162 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1999  autoinducer synthesis protein  26.8 
 
 		 183 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.556283  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0322  putative autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  26.17 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805046  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0618  N-acylhomoserine lactone synthase  26.74 
 
 		 289 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0541466  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2216  autoinducer synthetase BpmI  26.74 
 
 		 275 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0690156  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2129  autoinducer synthetase BpmI  26.74 
 
 		 202 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.466862  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0700  autoinducer synthetase BpmI  26.74 
 
 		 202 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19130  autoinducer synthesis protein RhlI  22.49 
 
 		 201 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347386  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1577  N-acyl homoserine lactone synthase  26.74 
 
 		 202 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7113  putative autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  22.91 
 
 		 227 aa  42.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0959  autoinducer synthesis protein  24 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0369652  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2022  autoinducer synthetase  26.74 
 
 		 202 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>