203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1613 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1613  septum formation inhibitor  100 
 
 		 246 aa  488  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3872  septum site-determining protein MinC  97.56 
 
 		 246 aa  481  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1695  septum formation inhibitor  82.66 
 
 		 245 aa  374  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1235  septum formation inhibitor  73.17 
 
 		 242 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0560003  normal  0.567033 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1284  septum formation inhibitor  78.46 
 
 		 248 aa  362  4e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1734  septum formation inhibitor  77.29 
 
 		 275 aa  358  5e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.597956 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1326  septum formation inhibitor  77.29 
 
 		 253 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3985  septum formation inhibitor  75.89 
 
 		 255 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441904  normal  0.387462 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22040  septum formation inhibitor  66.54 
 
 		 263 aa  343  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.517212  hitchhiker  0.0000000000000594989 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1882  septum formation inhibitor  66.54 
 
 		 263 aa  341  7e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35110  septum formation inhibitor  71.01 
 
 		 238 aa  333  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0925  septum site-determining protein MinC  43.33 
 
 		 243 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00858984  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2335  septum formation inhibitor  41.74 
 
 		 249 aa  185  6e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.782568  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0508  septum formation inhibitor MinC  44.26 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3027  septum site-determining protein MinC  46.19 
 
 		 242 aa  182  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218288  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3066  septum site-determining protein MinC  43.28 
 
 		 240 aa  169  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1510  hypothetical protein  42.73 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1473  hypothetical protein  42.73 
 
 		 236 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1936  septum site-determining protein MinC  40.16 
 
 		 242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1998  septum site-determining protein MinC  43.28 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.256846  normal  0.258962 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01604  septum site-determining protein MinC  39.15 
 
 		 257 aa  161  9e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00110922  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2354  septum site-determining protein MinC  39.08 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0186227  normal  0.309008 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1838  septum site-determining protein MinC  39.53 
 
 		 259 aa  158  9e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106899 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1956  septum formation inhibitor  39.66 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000234823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1503  septum formation inhibitor  39.66 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00645654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2013  septum formation inhibitor  39.66 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00337935  normal  0.267553 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3341  septum site-determining protein MinC  40.43 
 
 		 227 aa  157  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1319  septum formation inhibitor  39.66 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000246885  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1952  septum formation inhibitor  39.66 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00224738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1940  septum formation inhibitor  39.06 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000371298  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1591  septum site-determining protein MinC  43.3 
 
 		 247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153495  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2756  septum formation inhibitor  40.8 
 
 		 233 aa  155  7e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000039542  hitchhiker  0.00154059 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2121  septum formation inhibitor  41.08 
 
 		 228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000192978  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2236  septum formation inhibitor  38.2 
 
 		 228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000399265  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2399  septum formation inhibitor  41.08 
 
 		 228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000153282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2010  septum formation inhibitor  41.08 
 
 		 228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000596174  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3345  septum site-determining protein MinC  37.5 
 
 		 253 aa  150  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1545  septum formation inhibitor  37.86 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000716221  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2006  septum formation inhibitor  40.77 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.406679  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1997  septum formation inhibitor  38.3 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000933113  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2371  septum formation inhibitor  37.5 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000657693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004086  septum site-determining protein MinC  35.78 
 
 		 220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000371161  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1276  septum formation inhibitor  38.36 
 
 		 236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289797  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01151  septum formation inhibitor  38.36 
 
 		 231 aa  145  5e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.129311  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2472  septum site-determining protein MinC  38.36 
 
 		 231 aa  145  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000733034  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2449  septum formation inhibitor  38.36 
 
 		 231 aa  145  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00348167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01161  hypothetical protein  38.36 
 
 		 231 aa  145  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0900971  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0084  septum site-determining protein MinC  37.92 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0065  septum site-determining protein MinC  37.92 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01386  septum formation inhibitor  35.32 
 
 		 220 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0014  septum site-determining protein MinC  37.13 
 
 		 243 aa  142  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.062849 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0013  septum site-determining protein MinC  37.45 
 
 		 227 aa  142  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.838268  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1320  septum formation inhibitor  37.07 
 
 		 231 aa  142  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000146927  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1973  septum formation inhibitor  37.07 
 
 		 231 aa  142  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000684881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1661  septum formation inhibitor  37.07 
 
 		 231 aa  142  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000772871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1329  septum formation inhibitor  37.07 
 
 		 236 aa  142  6e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000408843  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4713  septum site-determining protein MinC  39.57 
 
 		 248 aa  142  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0342769  decreased coverage  0.00921136 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0032  septum site-determining protein MinC  34.1 
 
 		 263 aa  141  9e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.410574 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2581  septum formation inhibitor  34.17 
 
 		 239 aa  141  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.150935  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1067  septum formation inhibitor  34.62 
 
 		 221 aa  141  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00667924  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0036  septum site-determining protein MinC  38.59 
 
 		 261 aa  137  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0444  septum formation inhibitor  34.78 
 
 		 231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.66341  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0067  septum site-determining protein MinC  36.08 
 
 		 257 aa  136  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1632  septum site-determining protein MinC  36.36 
 
 		 251 aa  135  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2173  septum formation inhibitor  34.72 
 
 		 221 aa  135  9e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000273215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2250  septum formation inhibitor  34.72 
 
 		 221 aa  135  9e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000125523  normal  0.706037 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1077  septum site-determining protein MinC  36.99 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00582076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0124  septum site-determining protein MinC  38.17 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0020  septum site-determining protein MinC  36.44 
 
 		 265 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.973742  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2576  septum formation inhibitor  34.4 
 
 		 221 aa  133  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2382  septum formation inhibitor  34.26 
 
 		 221 aa  133  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000920942  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2184  septum formation inhibitor  34.02 
 
 		 221 aa  132  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000257088  unclonable  0.00000164505 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1765  septum formation inhibitor  35.65 
 
 		 221 aa  132  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000919  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0275  septum site-determining protein MinC  40 
 
 		 277 aa  132  6.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.798079 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1164  septum site-determining protein MinC  34.96 
 
 		 228 aa  131  9e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238053  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0504  septum formation inhibitor  35.66 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.694203  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0983  septum formation inhibitor  35.66 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1930  septum formation inhibitor  32.22 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000000656846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2444  septum formation inhibitor  34.88 
 
 		 236 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000352986  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2424  septum formation inhibitor  34.38 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000361193  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1868  septum formation inhibitor  34.38 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000040137  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1902  septum formation inhibitor  34.38 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000746493  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2519  septum formation inhibitor  33.19 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000141313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1895  septum formation inhibitor  34.38 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000124722  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1737  septum formation inhibitor  34.88 
 
 		 221 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0943  septum formation inhibitor  34.88 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0009  septum site-determining protein MinC  36.44 
 
 		 256 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.274749 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2114  septum formation inhibitor  34.62 
 
 		 221 aa  126  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000440493  normal  0.228236 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0855  septum formation inhibitor  34.78 
 
 		 256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.864553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3237  septum formation inhibitor  34.73 
 
 		 267 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1569  septum formation inhibitor  34.3 
 
 		 271 aa  122  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3561  septum formation inhibitor  34.75 
 
 		 264 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2302  septum site-determining protein MinC  37.55 
 
 		 251 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0843  septum formation inhibitor  34.26 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.709272  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4087  septum formation inhibitor  34.88 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.379648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1629  septum formation inhibitor  35.81 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000164279  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3067  septum formation inhibitor  34.32 
 
 		 270 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2968  septum formation inhibitor  34.32 
 
 		 270 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.930496  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3033  septum formation inhibitor  34.32 
 
 		 270 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2113  septum formation inhibitor  34.32 
 
 		 270 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>