219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1562 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3923  hypothetical protein  92.31 
 
 
547 aa  1060  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107021  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1387  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  78.65 
 
 
549 aa  892  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1562  sulfatase  100 
 
 
558 aa  1161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0048353  hitchhiker  0.00604368 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5584  hypothetical protein  73.27 
 
 
549 aa  820  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4122  sulfatase  68.65 
 
 
545 aa  790  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39020  hypothetical protein  63.45 
 
 
567 aa  700  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0446171  normal  0.409491 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3323  hypothetical protein  63.45 
 
 
572 aa  719  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364714  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1296  hypothetical protein  67.72 
 
 
545 aa  783  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4592  hypothetical protein  67.72 
 
 
545 aa  788  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2985  sulfatase  67.04 
 
 
544 aa  775  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00955472  normal  0.0251459 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3156  hypothetical protein  46.49 
 
 
552 aa  505  1e-142  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84731  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0677  sulfatase  43.6 
 
 
568 aa  502  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0039  hypothetical protein  45.25 
 
 
565 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0024  hypothetical protein  45.25 
 
 
565 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.454428  hitchhiker  5.76677e-06 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0042  hypothetical protein  45.25 
 
 
565 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.281715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0039  hypothetical protein  45.25 
 
 
565 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.328486  hitchhiker  0.000197782 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2204  putative cell division protein  44.72 
 
 
545 aa  476  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00407882  hitchhiker  0.00021657 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4015  putative cell division protein  43.23 
 
 
548 aa  457  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1873  putative cell division protein  44.4 
 
 
545 aa  454  1e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  4.30233e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2563  putative cell division protein  44.4 
 
 
545 aa  454  1e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  4.423e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1798  putative cell division protein  41.78 
 
 
543 aa  453  1e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  4.35221e-05  normal  0.0343315 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1764  putative cell division protein  44.2 
 
 
545 aa  452  1e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.95541e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3835  putative cell division protein  42.67 
 
 
548 aa  449  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.830183  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1810  hypothetical protein  44.44 
 
 
551 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0311  putative cell division protein  42.64 
 
 
547 aa  445  1e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00469316  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21210  hypothetical protein  44.11 
 
 
551 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4354  putative cell division protein  43.3 
 
 
557 aa  440  1e-122  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03946  hypothetical protein  44.27 
 
 
547 aa  439  1e-122  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4668  putative cell division protein  43.3 
 
 
557 aa  440  1e-122  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03985  predicted metal dependent hydrolase  44.27 
 
 
547 aa  439  1e-122  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3878  sulfatase  43.12 
 
 
557 aa  439  1e-122  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3913  putative cell division protein  44.08 
 
 
547 aa  438  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.482913  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1865  sulfatase  43.07 
 
 
575 aa  436  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65649 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4579  putative cell division protein  44.08 
 
 
547 aa  437  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.507155  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5627  putative cell division protein  44.08 
 
 
547 aa  438  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.53448  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1783  sulfatase  42.72 
 
 
552 aa  432  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.349972  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1228  sulfatase  42.5 
 
 
569 aa  435  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.199097  normal  0.54589 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4639  putative cell division protein  42.37 
 
 
547 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.500642  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4639  putative cell division protein  42.72 
 
 
547 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.739605  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4555  putative cell division protein  42.72 
 
 
547 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4548  putative cell division protein  42.37 
 
 
547 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3130  sulfatase  43.3 
 
 
564 aa  433  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.013055 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2128  sulfatase  40.99 
 
 
549 aa  424  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1854  inner membrane protein  42.48 
 
 
552 aa  424  1e-117  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.458981  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6033  sulfatase  40.11 
 
 
580 aa  420  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.218752 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0471  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  42.11 
 
 
555 aa  422  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.882488 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2705  sulfatase  39.74 
 
 
557 aa  407  1e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2103  sulfatase  38.79 
 
 
541 aa  406  1e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.381763  normal  0.850087 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2193  sulfatase  39.38 
 
 
542 aa  402  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444618  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2048  hypothetical protein  38.6 
 
 
541 aa  403  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2532  sulfatase  40 
 
 
544 aa  405  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.301618  normal  0.874005 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1874  hypothetical protein  38.29 
 
 
544 aa  401  1e-110  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1018  sulfatase  38.66 
 
 
544 aa  401  1e-110  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.663871  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1318  integral membrane protein  38.46 
 
 
539 aa  401  1e-110  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4349  sulfatase  41.45 
 
 
579 aa  399  1e-110  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.398112  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1871  sulfatase  38.24 
 
 
541 aa  401  1e-110  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.754116  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2228  sulfatase  38.42 
 
 
541 aa  400  1e-110  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_004310  BR1948  hypothetical protein  38.29 
 
 
544 aa  402  1e-110  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000583  hypothetical protein  37.64 
 
 
551 aa  399  1e-110  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2254  hypothetical protein  38.42 
 
 
541 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000771345  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2371  hypothetical protein  38.42 
 
 
541 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00897064  normal  0.689534 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2103  hypothetical protein  38.42 
 
 
541 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2091  protein of unknown function DUF1705  38.42 
 
 
541 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0178711  normal  0.189898 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1916  sulfatase  37.17 
 
 
545 aa  395  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.725859  normal  0.322218 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1758  hypothetical protein  39.47 
 
 
538 aa  393  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.534399  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04472  inner membrane protein  41.24 
 
 
532 aa  393  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.898006  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2041  hypothetical protein  37.96 
 
 
542 aa  392  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.017573 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3812  sulfatase  39.48 
 
 
549 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0194754  normal  0.186688 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1167  hypothetical protein  40.11 
 
 
557 aa  393  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105391  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3478  sulfatase  38.24 
 
 
541 aa  391  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3085  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  39.3 
 
 
549 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2097  sulfatase  37.32 
 
 
541 aa  391  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2326  sulfatase  39.34 
 
 
547 aa  386  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.995391  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3282  sulfatase  38.28 
 
 
583 aa  388  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.100906  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2995  sulfatase  43.34 
 
 
549 aa  387  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00588254  normal  0.0336769 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1756  sulfatase  39.78 
 
 
550 aa  388  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1955  sulfatase  39.78 
 
 
589 aa  387  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.822176  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05289  lipid A phosphoethanolamine transferase  40.59 
 
 
550 aa  385  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0802  sulfatase  38.46 
 
 
531 aa  383  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1931  sulfatase  38.97 
 
 
582 aa  377  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.514301  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0236  sulfatase  40.04 
 
 
535 aa  373  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1048  sulfatase  37.79 
 
 
580 aa  375  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1724  hypothetical protein  39.71 
 
 
552 aa  373  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0657943  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1718  sulfatase  37.52 
 
 
588 aa  375  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.292423 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0088  type III effector HopAH2-2  35.21 
 
 
520 aa  370  1e-101  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000528702  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1454  sulfatase  37.95 
 
 
542 aa  369  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2213  sulfatase  42.15 
 
 
557 aa  368  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1142  sulfatase  41.36 
 
 
583 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.285373  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0352  membrane associated sultatease  36.85 
 
 
551 aa  366  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.310824  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2500  hypothetical protein  41.59 
 
 
573 aa  365  1e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.549124 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3435  sulfatase  37.82 
 
 
560 aa  365  1e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1723  type III effector HopAH2-2  41.49 
 
 
509 aa  365  1e-99  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0141  hypothetical protein  38.27 
 
 
502 aa  365  1e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3264  putative sulfatase  37.95 
 
 
556 aa  360  3e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.225612  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2037  sulfatase  39.57 
 
 
518 aa  360  4e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3642  sulfatase  37.05 
 
 
560 aa  360  5e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.418054  normal  0.084742 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1978  sulfatase  39.8 
 
 
545 aa  355  2e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2717  putative sulfatase  37.89 
 
 
555 aa  346  6e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.914458  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1161  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  36.38 
 
 
576 aa  344  2e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1858  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  36.52 
 
 
554 aa  341  3e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>