More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1332 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1526  beta-(1-3)-glucosyl transferase, putative  52.2 
 
 
863 aa  832    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39140  Glycosyl transferase, family 2  51.08 
 
 
863 aa  827    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0104614  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1135  glycosyl transferase family protein  52.44 
 
 
862 aa  830    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.67659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1524  glycosyl transferase, group 2 family protein  64.02 
 
 
842 aa  1136    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566497  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1332  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
831 aa  1721    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0376589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  51.47 
 
 
885 aa  833    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4093  glycosyl transferase family protein  52.32 
 
 
863 aa  833    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363982  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49360  glucosyl transferase  49.02 
 
 
869 aa  780    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.169531  normal  0.125269 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4198  glycosyl transferase family protein  52.2 
 
 
863 aa  830    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80228  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2146  glycosyl transferase family protein  42.41 
 
 
903 aa  616  1e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302574  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  38.7 
 
 
917 aa  583  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3209  glycosyl transferase family 2  38.15 
 
 
868 aa  548  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.871407  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1372  glycosyl transferase family protein  37.24 
 
 
859 aa  545  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188568  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2612  glycosyl transferase family protein  37.84 
 
 
895 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.228291  hitchhiker  0.00221032 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1779  glycosyl transferase family protein  38.1 
 
 
889 aa  533  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  37.56 
 
 
899 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4173  putative beta-(1-3)-glucosyl transferase, ndvB-like protein  37.27 
 
 
895 aa  525  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761366  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1789  glycosyl transferase family protein  37.32 
 
 
889 aa  521  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121922  normal  0.0753716 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2928  glycosyl transferase family 2  36.24 
 
 
944 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904629  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  37.37 
 
 
905 aa  479  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1698  glycosyl transferase family 2  33.86 
 
 
844 aa  469  9.999999999999999e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000612337  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1280  glycosyl transferase family protein  33.56 
 
 
889 aa  452  1e-125  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0531421  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  43.21 
 
 
919 aa  344  5e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1338  glycosyl transferase family protein  37.33 
 
 
772 aa  270  7e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2308  glycosyl transferase family 2  32.74 
 
 
610 aa  212  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0847563  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2837  glycoside hydrolase family protein  38.21 
 
 
529 aa  173  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.413837  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4421  putative beta (1-6) glucans synthase  36.98 
 
 
541 aa  167  8e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0112946  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1668  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  35.42 
 
 
650 aa  164  7e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.137314  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3208  putative glucan 1,3-beta-glucosidase  38.08 
 
 
540 aa  162  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537701  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1787  putative beta (1-6) glucans synthase  34.3 
 
 
532 aa  161  5e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1373  putative beta (1-6) glucan synthase  34.69 
 
 
535 aa  160  6e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000927844  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1781  putative beta (1-6) glucans synthase  33.7 
 
 
494 aa  158  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3979  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  36.53 
 
 
521 aa  158  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.724466  normal  0.625635 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1740  beta (1-6) glucans synthase, putative  36.53 
 
 
525 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1290  glycoside hydrolase family protein  35.29 
 
 
521 aa  157  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35060  Glycoside hydrolase  33.83 
 
 
533 aa  157  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.923975  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2602  putative beta (1-6) glucans synthase  33.84 
 
 
541 aa  154  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.288043  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1332  beta (1-6) glucans synthase  35.56 
 
 
522 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438077  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4171  putative beta (1-6) glucans synthase, ndvC-like protein  33.45 
 
 
538 aa  152  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0068  exo-beta-1 3-glucanase-like  33.96 
 
 
638 aa  153  2e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00110829  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2858  putative beta (1-6) glucans synthase  33.09 
 
 
558 aa  151  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.178086  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2614  putative beta (1-6) glucans synthase  32.37 
 
 
558 aa  151  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272631  hitchhiker  0.00127237 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1605  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 
531 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2930  putative beta (1-6) glucans synthase, NdvC-like protein  31.88 
 
 
536 aa  148  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0666963  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0794  cellulose synthase (UDP-forming)  26.84 
 
 
683 aa  129  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.298349  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1164  cellulose synthase (UDP-forming)  31.47 
 
 
652 aa  127  9e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  24.72 
 
 
672 aa  126  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  24.53 
 
 
672 aa  126  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1324  Cellulose synthase (UDP-forming)  31.47 
 
 
652 aa  126  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.531441  normal  0.84698 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1279  Cellulose synthase (UDP-forming)  25.77 
 
 
672 aa  125  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14202  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5236  cellulose synthase (UDP-forming)  29.82 
 
 
659 aa  124  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4379  glycoside hydrolase family protein  29.81 
 
 
295 aa  124  9e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1738  glycosyl transferase family protein  26.59 
 
 
658 aa  123  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0016739  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3721  putative glycosyl hydrolase  30.27 
 
 
295 aa  122  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.439077  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  27.42 
 
 
712 aa  120  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4219  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 
659 aa  120  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0273  Cellulose synthase (UDP-forming)  30.77 
 
 
652 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.79882  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1082  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.47 
 
 
657 aa  115  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299045  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0996  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.47 
 
 
657 aa  115  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231155  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2310  beta 1,3 glucan synthase catalytic subunit  28.47 
 
 
655 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  25.64 
 
 
666 aa  114  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1468  putative cellulose synthase  28.47 
 
 
655 aa  114  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244894  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1391  putative cellulose synthase  28.47 
 
 
655 aa  114  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0505  putative cellulose synthase  28.47 
 
 
657 aa  114  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0143  putative cellulose synthase  28.47 
 
 
655 aa  114  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4267  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.9 
 
 
1135 aa  113  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0232  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.18 
 
 
544 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  27.93 
 
 
749 aa  112  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3726  cellulose synthase (UDP-forming)  26.8 
 
 
664 aa  112  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3720  putative glycosyl hydrolase  30.24 
 
 
336 aa  112  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3398  Cellulose synthase (UDP-forming)  28.08 
 
 
768 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.874799  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0992  cellulose synthase (UDP-forming)  27.66 
 
 
501 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.832352 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  27.74 
 
 
716 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3605  glycosyltransferase  29.41 
 
 
658 aa  110  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0354405 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4645  Cellulose synthase (UDP-forming)  25.67 
 
 
664 aa  109  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0374  cellulose synthase (UDP-forming)  30.34 
 
 
661 aa  110  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0649  glycosyl transferase family protein  31.5 
 
 
421 aa  109  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.113034 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1704  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 
514 aa  108  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3597  glycosyltransferase  25.99 
 
 
741 aa  108  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1398  cellulose synthase (UDP-forming)  30.08 
 
 
740 aa  105  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00289904  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3741  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.91 
 
 
810 aa  102  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3169  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.56 
 
 
773 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2949  glycosyl transferase family 2  26.56 
 
 
773 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.496141 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4173  hypothetical protein  30.6 
 
 
778 aa  101  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1478  glycosyl transferase family 2  27.37 
 
 
533 aa  100  8e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  25.08 
 
 
737 aa  99.8  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4805  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.97 
 
 
804 aa  98.6  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.254969  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  26.05 
 
 
1154 aa  97.8  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0569  cellulose synthase (UDP-forming)  28.67 
 
 
758 aa  97.4  9e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3895  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  25.66 
 
 
702 aa  97.1  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  29.34 
 
 
420 aa  97.1  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3042  Cellulose synthase (UDP-forming)  25.7 
 
 
980 aa  96.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0324719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6543  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  27.92 
 
 
514 aa  96.3  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000751744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0107  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  30 
 
 
811 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.885965 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4083  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.32 
 
 
696 aa  96.7  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6620  glycosyl transferase family 2  26.46 
 
 
508 aa  96.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4799  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  29.67 
 
 
930 aa  95.5  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.105872 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4380  glycoside hydrolase family protein  25.86 
 
 
321 aa  95.5  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3940  cellulose synthase (UDP-forming)  26.73 
 
 
699 aa  95.1  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0284472 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  30.17 
 
 
422 aa  94.7  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>