More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1307 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  71.41 
 
 		 755 aa  1056    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  69.96 
 
 		 762 aa  1028    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  53.66 
 
 		 760 aa  758    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  92.06 
 
 		 793 aa  1387    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  70.42 
 
 		 765 aa  1035    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  100 
 
 		 789 aa  1560    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3649  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  56.37 
 
 		 763 aa  786    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0920169  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3683  CheA signal transduction histidine kinase  52.67 
 
 		 769 aa  696    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  75.19 
 
 		 764 aa  1122    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2304  CheA signal transduction histidine kinase  52.42 
 
 		 769 aa  708    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400657 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4942  CheA signal transduction histidine kinase  53.43 
 
 		 766 aa  725    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.993861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  69.95 
 
 		 767 aa  1028    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  41.98 
 
 		 808 aa  641    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  69.47 
 
 		 764 aa  1030    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  56.89 
 
 		 768 aa  814    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4572  CheA signal transduction histidine kinases  52.54 
 
 		 769 aa  711    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3975  CheA signal transduction histidine kinase  52.17 
 
 		 804 aa  721    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5517  CheA signal transduction histidine kinases  52.29 
 
 		 769 aa  696    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0873322  normal  0.1808 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  69.31 
 
 		 769 aa  1014    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3791  CheA signal transduction histidine kinases  52.54 
 
 		 769 aa  711    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.267283 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3733  CheA signal transduction histidine kinase  52.54 
 
 		 769 aa  710    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.577352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  54.62 
 
 		 864 aa  624  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  54.62 
 
 		 864 aa  623  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  54.46 
 
 		 864 aa  622  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  54.46 
 
 		 864 aa  622  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0964  chemotaxis histidine kinase  56.52 
 
 		 1079 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1402  putative chemotaxis sensor histidine kinase  54.46 
 
 		 864 aa  622  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  54.46 
 
 		 864 aa  622  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0505  chemotaxis sensor histidine kinase, putative  53.66 
 
 		 832 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391708  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  45.86 
 
 		 752 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0407  CheA signal transduction histidine kinase  46.79 
 
 		 896 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0417  CheA signal transduction histidine kinase  46.79 
 
 		 896 aa  558  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  31.64 
 
 		 734 aa  360  5e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 679 aa  358  2.9999999999999997e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 679 aa  357  5.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2466  CheA signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 772 aa  348  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378158  normal  0.0397197 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 742 aa  344  4e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 741 aa  336  9e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 		 762 aa  333  9e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  28.88 
 
 		 769 aa  332  2e-89  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  29.09 
 
 		 769 aa  330  4e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  29.09 
 
 		 769 aa  326  9e-88  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  32.98 
 
 		 878 aa  325  3e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 740 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  28.32 
 
 		 770 aa  313  9e-84  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 784 aa  312  2e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  28.57 
 
 		 774 aa  310  5.9999999999999995e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  30.21 
 
 		 1992 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  29.04 
 
 		 1987 aa  302  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  37.01 
 
 		 2476 aa  300  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  37.2 
 
 		 2458 aa  300  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0989  CheA signal transduction histidine kinases  28.25 
 
 		 764 aa  298  3e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.166384  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 2212 aa  298  4e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2192  CheA signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 801 aa  296  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 2423 aa  293  9e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.99 
 
 		 1971 aa  292  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 		 1646 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 		 1646 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 2539 aa  291  5.0000000000000004e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 783 aa  290  7e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  33.7 
 
 		 785 aa  289  1e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 1647 aa  287  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 		 781 aa  287  5e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  35.52 
 
 		 2336 aa  286  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 777 aa  283  9e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  33.48 
 
 		 783 aa  283  9e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 		 865 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 		 865 aa  282  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 1629 aa  279  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 1127 aa  278  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2678  CheA signal transduction histidine kinase  36.93 
 
 		 705 aa  277  5e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.295272  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 1609 aa  277  6e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  32.77 
 
 		 839 aa  276  1.0000000000000001e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2773  CheA signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 		 705 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00107192  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 770 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 1974 aa  276  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 1155 aa  274  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0238  CheA signal transduction histidine kinases  28.2 
 
 		 764 aa  273  9e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 598 aa  271  5e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 777 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  29.61 
 
 		 2301 aa  270  5.9999999999999995e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0657  CheA signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 758 aa  270  8e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0137797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 686 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 		 756 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 		 660 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 		 675 aa  266  8e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 		 1012 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0859  CheA signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 952 aa  265  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.571784  normal  0.0418696 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 974 aa  265  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0600  CheA signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 706 aa  265  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  32.89 
 
 		 2284 aa  265  4e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 1907 aa  263  8.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  31.13 
 
 		 803 aa  263  1e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2547  putative CheA signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 1098 aa  262  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3559  putative CheA signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 		 1098 aa  261  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.989868 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 1725 aa  261  4e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 934 aa  261  4e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 1725 aa  261  5.0000000000000005e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0638  CheA signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 		 753 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  29.69 
 
 		 2092 aa  259  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>