149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1275 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  100 
 
 
72 aa  147  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  90.28 
 
 
72 aa  136  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  80.95 
 
 
71 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4164  hypothetical protein  70.77 
 
 
66 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1060  hypothetical protein  76.27 
 
 
65 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  72.13 
 
 
66 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1455  hypothetical protein  74.58 
 
 
74 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.13475 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4266  hypothetical protein  75.86 
 
 
67 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710344  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15880  hypothetical protein  72.41 
 
 
64 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0875787 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1366  hypothetical protein  68.97 
 
 
64 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  68.18 
 
 
60 aa  67  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0957  hypothetical protein  42.11 
 
 
85 aa  58.2  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.283271 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3396  hypothetical protein  41.82 
 
 
68 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0264738  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  51.11 
 
 
79 aa  54.3  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  48.08 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  52.38 
 
 
267 aa  51.2  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2867  hypothetical protein  41.51 
 
 
64 aa  51.6  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.510606  hitchhiker  0.0000394649 
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  43.14 
 
 
64 aa  51.2  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0754  protein of unknown function DUF1289  48.98 
 
 
66 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0179  hypothetical protein  48.08 
 
 
78 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2045  hypothetical protein  38.18 
 
 
68 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0738495  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0228  hypothetical protein  39.68 
 
 
78 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1814  hypothetical protein  37.1 
 
 
100 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3582  hypothetical protein  37.1 
 
 
63 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765416  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  44.23 
 
 
88 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2046  hypothetical protein  39.66 
 
 
76 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00450477  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01618  hypothetical protein  44.9 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000568284  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1992  protein of unknown function DUF1289  44.9 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.11931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5224  hypothetical protein  58.97 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01608  hypothetical protein  44.9 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000323192  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1550  hypothetical protein  44.9 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5285  hypothetical protein  58.97 
 
 
74 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1063  protein of unknown function DUF1289  48.98 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336879  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1981  hypothetical protein  44.9 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000345163  hitchhiker  0.000939338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5133  hypothetical protein  58.97 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581719  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0248  hypothetical protein  53.49 
 
 
70 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.561278 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  41.38 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0966  hypothetical protein  37.1 
 
 
78 aa  48.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2184  protein of unknown function DUF1289  34.55 
 
 
74 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1599  hypothetical protein  38.89 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317306  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  44.9 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0317  hypothetical protein  42 
 
 
70 aa  47.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4708  protein of unknown function DUF1289  44.26 
 
 
92 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0857  hypothetical protein  39.22 
 
 
76 aa  47.4  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2180  hypothetical protein  45.28 
 
 
78 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351139  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3459  hypothetical protein  39.62 
 
 
65 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.203383 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5495  hypothetical protein  38.6 
 
 
74 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2063  hypothetical protein  37.74 
 
 
73 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15252  normal  0.0794579 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2035  hypothetical protein  43.9 
 
 
65 aa  47  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00150259  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3162  hypothetical protein  48.57 
 
 
81 aa  46.2  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561476  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  45 
 
 
285 aa  47  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22880  putative Fe-S protein  43.75 
 
 
70 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.190729 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4140  hypothetical protein  46.67 
 
 
106 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276441  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2792  hypothetical protein  39.58 
 
 
71 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2683  hypothetical protein  46.51 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.344711  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1367  hypothetical protein  41.18 
 
 
74 aa  45.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  41.51 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1341  hypothetical protein  46.51 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0389331  normal  0.17465 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1567  hypothetical protein  48.72 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.450531  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  43.4 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1693  hypothetical protein  37.74 
 
 
76 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.789904  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0270  hypothetical protein  46.67 
 
 
65 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1715  hypothetical protein  37.74 
 
 
76 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288825  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1931  putative Fe-S protein  43.75 
 
 
75 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236199  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1678  hypothetical protein  37.74 
 
 
76 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388169  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1507  hypothetical protein  45.71 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1799  hypothetical protein  40.82 
 
 
81 aa  44.7  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000202172  normal  0.0255641 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  40.43 
 
 
82 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1179  hypothetical protein  35.29 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2957  hypothetical protein  43.33 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1491  hypothetical protein  40.48 
 
 
63 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.248534  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1617  hypothetical protein  36.84 
 
 
303 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1457  hypothetical protein  43.59 
 
 
91 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.634836 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1947  hypothetical protein  41.03 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00081955  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3352  hypothetical protein  44 
 
 
74 aa  43.9  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1508  hypothetical protein  41.03 
 
 
80 aa  43.9  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0156  hypothetical protein  40.38 
 
 
80 aa  42.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1838  hypothetical protein  43.59 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2144  hypothetical protein  40.82 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5051  hypothetical protein  38.46 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.443997  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1874  hypothetical protein  39.58 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000160461  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1974  hypothetical protein  40 
 
 
70 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2312  protein of unknown function DUF1289  38.46 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.292265  normal  0.245299 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6327  hypothetical protein  38.46 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1676  hypothetical protein  38.46 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412222  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1752  hypothetical protein  38.46 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1674  hypothetical protein  38.46 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0337304  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1768  hypothetical protein  38.46 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5962  hypothetical protein  39.62 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166337  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1840  hypothetical protein  40 
 
 
60 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.327409  normal  0.891126 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1267  hypothetical protein  36.54 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000298758  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6017  hypothetical protein  41.03 
 
 
56 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1765  hypothetical protein  39.58 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.55498e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  36.54 
 
 
248 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2233  hypothetical protein  48.78 
 
 
61 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0963736  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  47.62 
 
 
221 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3035  protein of unknown function DUF1289  39.62 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.468674  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3754  hypothetical protein  39.62 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353082  normal  0.856634 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0330  hypothetical protein  38.18 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445716  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2207  hypothetical protein  39.58 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000511306  hitchhiker  0.0000930327 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>