More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1173 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1173  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 206 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.813849 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4540  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.59 
 
 		 205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529468  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3100  lysine exporter protein LysE/YggA  47.54 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0365  RhtB family transporter  44.06 
 
 		 205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2754  lysine exporter protein LysE/YggA  48.09 
 
 		 205 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  0.0643821 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4341  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.32 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4606  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.54 
 
 		 242 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.118982 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3434  lysine exporter protein LysE/YggA  38.65 
 
 		 203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0186  amino acid transporter LysE  39.68 
 
 		 205 aa  122  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3016  lysine exporter protein LysE/YggA  40.31 
 
 		 205 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3363  lysine exporter protein LysE/YggA  39.49 
 
 		 203 aa  115  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0656798  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.54 
 
 		 203 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.610199  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.11 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.325089 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3492  lysine exporter protein LysE/YggA  34.97 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4806  lysine exporter protein LysE/YggA  35.33 
 
 		 203 aa  98.6  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135415  normal  0.130992 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2432  RhtB family transporter  31.37 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.274649  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2130  lysine exporter protein LysE/YggA  35.58 
 
 		 202 aa  97.1  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000391872  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0945  lysine exporter protein LysE/YggA  33.01 
 
 		 203 aa  96.3  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2151  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.18 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4677  lysine exporter protein LysE/YggA  35.11 
 
 		 203 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532936  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1305  lysine exporter protein LysE/YggA  30.15 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  32.45 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  32.45 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4152  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 203 aa  89.4  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  32.98 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  32.45 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  31.91 
 
 		 210 aa  85.1  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1358  LysE family protein  36.43 
 
 		 203 aa  84.7  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0949  LysE family protein  36.43 
 
 		 203 aa  84.7  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2472  LysE family protein  36.43 
 
 		 203 aa  84.7  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.082911  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0342  LysE family protein  36.43 
 
 		 203 aa  84.7  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1281  LysE family translocator protein  36.43 
 
 		 203 aa  84.7  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18583  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0621  LysE family protein  36.43 
 
 		 217 aa  84.7  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1208  LysE family translocator protein  36.43 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  32.45 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  31.38 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0010  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.803659 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2698  putative threonine efflux protein  30.56 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.575587  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4604  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.85 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0356  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404606 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4143  lysine exporter protein LysE/YggA  31.12 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0452  lysine exporter protein LysE/YggA  31.98 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1998  amino acid efflux pump, RhtB family protein  35.93 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457454  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1303  amino acid transporter LysE  32.04 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.520276  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6503  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.81 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  30.85 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1248  amino acid transporter LysE  31.9 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.483142 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1277  lysine exporter protein LysE/YggA  31.9 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  29.08 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2711  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.32 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.223328  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4198  lysine exporter protein LysE/YggA  34.01 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000025376 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0814  hypothetical protein  35.81 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  28.81 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.04 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0412  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.07 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  28.81 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4774  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0100683  hitchhiker  0.00129257 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  27.23 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0028  lysine exporter protein LysE/YggA  29.84 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.214928 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0827  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.17 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.282435 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0757  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.17 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  0.0580671 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0047  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.84 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.743196  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0101  lysine exporter protein LysE/YggA  31.43 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.11084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2456  lysine exporter protein LysE/YggA  25.67 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010294  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.02 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3130  lysine exporter protein LysE/YggA  29.56 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.376796 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  29.89 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5050  lysine exporter protein LysE/YggA  31.18 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.637848 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4548  lysine exporter protein LysE/YggA  32.86 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6178  lysine exporter protein LysE/YggA  37.11 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.203185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4844  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.71 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0333  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.34 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.96 
 
 		 232 aa  64.7  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.87 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.912842 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2255  lysine exporter protein LysE/YggA  31.22 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674089 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  27.08 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4318  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0592644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.52 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  30.82 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.272931  normal  0.707068 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4996  lysine exporter protein LysE/YggA  33.12 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2818  lysine exporter protein LysE/YggA  29.51 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1752  homoserine/threonine efflux protein  29.1 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000289008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1890  homoserine/threonine efflux protein  29.1 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.131548  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.98 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3890  lysine exporter protein (LysE/YggA)  32.28 
 
 		 137 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.503752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0004  lysine exporter protein LysE/YggA  29.9 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.309415  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  28.43 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3399  lysine exporter protein LysE/YggA  29.45 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944216  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0053  lysine exporter protein LysE/YggA  31.87 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3551  lysine exporter protein LysE/YggA  29.25 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0065  lysine exporter protein LysE/YggA  35.86 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.969114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4074  RhtB family transporter  29.05 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1744  lysine exporter protein LysE/YggA  28.36 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257251  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2641  hypothetical protein  29.8 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.774137 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1065  lysine exporter protein LysE/YggA  32.86 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.180582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4218  L-lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.28 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3652  amino acid transporter LysE  29.51 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3214  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>