More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1146 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
294 aa  605  1e-172  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1330  glycosyl transferase, group 2 family protein  85.71 
 
 
294 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.472766  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  65.64 
 
 
300 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  64.26 
 
 
299 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  9.37683e-12 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51220  glycosyl transferase  53.57 
 
 
330 aa  297  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00120111  hitchhiker  0.000215045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0478  glycosyl transferase family protein  35.25 
 
 
300 aa  180  3e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 
294 aa  179  6e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  35.57 
 
 
296 aa  178  9e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.04 
 
 
294 aa  175  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  33.33 
 
 
294 aa  174  2e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
398 aa  129  7e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 
333 aa  122  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  32.45 
 
 
330 aa  119  8e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  1.20628e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 
306 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 
321 aa  115  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 
347 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
352 aa  115  9e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  32.88 
 
 
347 aa  115  1e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1306  glycosyl transferase family 2  26.38 
 
 
283 aa  114  2e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 
318 aa  112  7e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 
361 aa  111  1e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  30.18 
 
 
374 aa  111  1e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 
305 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
322 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.05 
 
 
326 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  31.31 
 
 
727 aa  109  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 
373 aa  108  8e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  32.71 
 
 
1177 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 
390 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  32.71 
 
 
1177 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  31.46 
 
 
334 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  25.86 
 
 
1035 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.64 
 
 
326 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
299 aa  106  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.26 
 
 
312 aa  106  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  30.57 
 
 
336 aa  106  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.85438e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.83 
 
 
326 aa  106  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 
274 aa  105  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  29.71 
 
 
347 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.64 
 
 
326 aa  105  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
318 aa  105  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 
597 aa  105  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 
305 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  29.86 
 
 
353 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 
344 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
294 aa  105  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 
334 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 
313 aa  103  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  29.12 
 
 
663 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  35.07 
 
 
336 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 
347 aa  103  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  29.26 
 
 
307 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  35.62 
 
 
303 aa  102  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  32.88 
 
 
373 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  31.56 
 
 
363 aa  102  8e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 
326 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  29.88 
 
 
672 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  29.25 
 
 
327 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1763  glycosyl transferase family 2  26.85 
 
 
333 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 
544 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  31.96 
 
 
230 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
300 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.96 
 
 
341 aa  100  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  26.97 
 
 
330 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
301 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 
812 aa  99.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2329  glycosyl transferase family 2  30.91 
 
 
344 aa  99.4  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 
327 aa  98.6  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  30.24 
 
 
268 aa  97.8  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 
1032 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  26.39 
 
 
338 aa  97.8  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 
349 aa  97.8  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
324 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1778  glycosyl transferase family 2  30.38 
 
 
292 aa  97.4  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3460  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.16 
 
 
330 aa  97.4  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.66 
 
 
312 aa  97.4  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  38.1 
 
 
573 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
365 aa  97.4  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  27.69 
 
 
337 aa  97.4  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0430  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.7 
 
 
642 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 
261 aa  96.7  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2506  b-glycosyltransferase  31.36 
 
 
309 aa  96.7  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5479  glycosyl transferase family 2  31.13 
 
 
655 aa  97.1  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  31.08 
 
 
351 aa  96.7  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.14 
 
 
254 aa  96.7  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 
390 aa  95.9  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3305  glycosyl transferase family protein  26.85 
 
 
342 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 
233 aa  95.9  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  30.21 
 
 
325 aa  95.5  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 
380 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 
1250 aa  95.1  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.85 
 
 
466 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.2 
 
 
367 aa  94.7  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2119  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.72 
 
 
253 aa  94.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.731271 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
338 aa  94.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  27.24 
 
 
581 aa  94  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.74352e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  43.24 
 
 
320 aa  94  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3070  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 
317 aa  93.6  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.976972  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0632  glycosyl transferase family 2  28.25 
 
 
313 aa  93.2  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138746  normal  0.982719 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 
333 aa  93.2  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>