More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1020 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1020  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 187 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1182  GTP cyclohydrolase I  96.24 
 
 		 187 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0891  GTP cyclohydrolase I  86.02 
 
 		 186 aa  343  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19630  GTP cyclohydrolase I  86.56 
 
 		 186 aa  343  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1690  GTP cyclohydrolase I  86.02 
 
 		 186 aa  341  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3289  GTP cyclohydrolase  84.86 
 
 		 186 aa  333  9e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2021  GTP cyclohydrolase I  77.72 
 
 		 186 aa  311  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.780834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3207  GTP cyclohydrolase I  77.17 
 
 		 186 aa  311  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.0542023 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2512  GTP cyclohydrolase I  76.63 
 
 		 186 aa  310  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3598  GTP cyclohydrolase I  79.33 
 
 		 181 aa  306  9e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42850  GTP cyclohydrolase I  79.33 
 
 		 181 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1431  GTP cyclohydrolase I  78.21 
 
 		 181 aa  302  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.426591 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1715  GTP cyclohydrolase I  78.77 
 
 		 181 aa  301  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23690  GTP cyclohydrolase I  78.21 
 
 		 181 aa  301  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0310829  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2744  GTP cyclohydrolase I  78.21 
 
 		 181 aa  299  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0752455  normal  0.719118 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1845  GTP cyclohydrolase I  78.21 
 
 		 181 aa  297  6e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.350099 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2035  GTP cyclohydrolase I  77.65 
 
 		 181 aa  295  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31903  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2294  GTP cyclohydrolase I  71.43 
 
 		 184 aa  287  8e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3782  GTP cyclohydrolase I  72.53 
 
 		 189 aa  283  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1299  GTP cyclohydrolase  71.98 
 
 		 185 aa  282  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1799  GTP cyclohydrolase I  72.13 
 
 		 198 aa  281  4.0000000000000003e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.982751  hitchhiker  0.00000626036 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0548  GTP cyclohydrolase I  70.65 
 
 		 184 aa  280  6.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1823  GTP cyclohydrolase I  75.69 
 
 		 190 aa  275  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00310183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3888  GTP cyclohydrolase I  75.98 
 
 		 181 aa  275  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.299741 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1401  GTP cyclohydrolase I  75.42 
 
 		 181 aa  273  9e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154537  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2930  GTP cyclohydrolase I  68.16 
 
 		 182 aa  272  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2469  GTP cyclohydrolase I  65.92 
 
 		 181 aa  267  7e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2093  GTP cyclohydrolase  66.85 
 
 		 179 aa  262  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.101734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0863  GTP cyclohydrolase I  64.84 
 
 		 188 aa  258  4e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2678  GTP cyclohydrolase I  65.73 
 
 		 180 aa  258  5.0000000000000005e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.508198  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1153  GTP cyclohydrolase I  64.84 
 
 		 184 aa  258  5.0000000000000005e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2814  GTP cyclohydrolase I  68.39 
 
 		 179 aa  255  3e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1670  GTP cyclohydrolase I  64.67 
 
 		 185 aa  254  5e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2683  GTP cyclohydrolase I  68.39 
 
 		 179 aa  253  8e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1393  GTP cyclohydrolase I  69.66 
 
 		 200 aa  252  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2117  GTP cyclohydrolase I  65.32 
 
 		 203 aa  242  3e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4616  GTP cyclohydrolase I  62.01 
 
 		 212 aa  241  5e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  64.16 
 
 		 235 aa  240  9e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3847  GTP cyclohydrolase I  61.93 
 
 		 218 aa  238  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  64.33 
 
 		 247 aa  237  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  59.66 
 
 		 216 aa  235  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  60.69 
 
 		 235 aa  234  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  61.27 
 
 		 239 aa  234  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  61.27 
 
 		 239 aa  234  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  60.69 
 
 		 235 aa  234  7e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  61.99 
 
 		 226 aa  233  9e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  61.63 
 
 		 219 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  59.78 
 
 		 214 aa  232  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  59.78 
 
 		 214 aa  232  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  58.56 
 
 		 223 aa  231  4.0000000000000004e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0625  GTP cyclohydrolase I  60.33 
 
 		 193 aa  230  9e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.497078 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1044  GTP cyclohydrolase  60.11 
 
 		 203 aa  229  1e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.663333 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1390  GTP cyclohydrolase I  60 
 
 		 213 aa  229  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  61.4 
 
 		 219 aa  229  1e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0969  GTP cyclohydrolase  60.12 
 
 		 243 aa  230  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0257975  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  58.96 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1481  GTP cyclohydrolase I  57.22 
 
 		 190 aa  228  3e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0193  GTP cyclohydrolase I  59.34 
 
 		 220 aa  228  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2208  GTP cyclohydrolase  59.66 
 
 		 199 aa  228  4e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0579312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  60.82 
 
 		 218 aa  228  6e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6956  GTP cyclohydrolase I  59.24 
 
 		 195 aa  227  6e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.837765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0955  GTP cyclohydrolase I  58.56 
 
 		 201 aa  227  7e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000998174  hitchhiker  0.00336193 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0187  GTP cyclohydrolase I  56.68 
 
 		 190 aa  227  1e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2932  GTP cyclohydrolase I  60.12 
 
 		 201 aa  226  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0900198 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4149  GTP cyclohydrolase I  57.78 
 
 		 210 aa  226  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  59.54 
 
 		 223 aa  225  2e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2086  GTP cyclohydrolase I  59.88 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0225  GTP cyclohydrolase I  60.47 
 
 		 190 aa  226  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1425  GTP cyclohydrolase I  59.55 
 
 		 203 aa  225  4e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.899017  normal  0.42931 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1778  GTP cyclohydrolase I  55.08 
 
 		 190 aa  224  5.0000000000000005e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0204  GTP cyclohydrolase I  59.88 
 
 		 190 aa  224  5.0000000000000005e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34960  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  58.96 
 
 		 270 aa  223  1e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1496  GTP cyclohydrolase I  55.08 
 
 		 190 aa  222  2e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0754  GTP cyclohydrolase I  59.65 
 
 		 216 aa  221  6e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08636  GTP cyclohydrolase I  56.59 
 
 		 199 aa  219  9.999999999999999e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  57.89 
 
 		 195 aa  220  9.999999999999999e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0041  GTP cyclohydrolase I  54.7 
 
 		 194 aa  218  3e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0206  GTP cyclohydrolase I  54.65 
 
 		 202 aa  218  3e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08188  hypothetical protein similar to GTP cyclohydrolase I (Broad)  57.71 
 
 		 329 aa  215  2.9999999999999998e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04920  GTP cyclohydrolase I, putative  56.65 
 
 		 435 aa  213  9.999999999999999e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2156  GTP cyclohydrolase I  60.12 
 
 		 193 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21868  predicted protein  53.76 
 
 		 186 aa  212  1.9999999999999998e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.213311  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0017  GTP cyclohydrolase I  57.3 
 
 		 224 aa  205  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  54.86 
 
 		 213 aa  204  7e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0705  GTP cyclohydrolase I  56.82 
 
 		 226 aa  204  8e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  54.29 
 
 		 213 aa  203  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0301  GTP cyclohydrolase I  56 
 
 		 225 aa  198  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000150261  normal  0.11188 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0131  GTP cyclohydrolase I  55.29 
 
 		 206 aa  197  7e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  51.43 
 
 		 207 aa  190  8e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  52.57 
 
 		 210 aa  190  9e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  51.89 
 
 		 193 aa  190  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2158  GTP cyclohydrolase I  52.54 
 
 		 213 aa  188  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284755  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3446  GTP cyclohydrolase I  53.11 
 
 		 194 aa  188  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0793851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0560  GTP cyclohydrolase I  49.15 
 
 		 198 aa  186  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  49.72 
 
 		 188 aa  185  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  50.86 
 
 		 199 aa  185  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0445  GTP cyclohydrolase I  50.28 
 
 		 205 aa  185  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0644  GTP cyclohydrolase I  50.57 
 
 		 206 aa  185  3e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.343443  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  51.43 
 
 		 200 aa  184  5e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  52.33 
 
 		 188 aa  184  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>