More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0984 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
282 aa  585  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  95.59 
 
 
272 aa  541  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4429  peptidase M48 Ste24p  81.92 
 
 
271 aa  471  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0801  peptidase M48 Ste24p  80.44 
 
 
272 aa  466  1e-130  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  80.81 
 
 
272 aa  466  1e-130  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  80.81 
 
 
279 aa  466  1e-130  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4714  peptidase M48, Ste24p  83.92 
 
 
272 aa  456  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.0690011 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3668  peptidase M48, Ste24p  78.33 
 
 
273 aa  414  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41270  Peptidase M48, Ste24p family  71.75 
 
 
273 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61290  putative lipoprotein  75.37 
 
 
273 aa  407  1e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5278  putative lipoprotein  74.63 
 
 
273 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0624214  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  52.67 
 
 
270 aa  270  3e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  52.26 
 
 
270 aa  266  3e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  53.6 
 
 
280 aa  265  8e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  49.09 
 
 
267 aa  259  5e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  3.30567e-07  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  49.81 
 
 
271 aa  258  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  49.22 
 
 
274 aa  248  6e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  47.92 
 
 
289 aa  246  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51059e-07 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0032  peptidase M48, Ste24p  46.3 
 
 
270 aa  244  8e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0018  peptidase M48, Ste24p  47.19 
 
 
272 aa  244  1e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  48.12 
 
 
267 aa  232  5e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0655  peptidase M48, Ste24p  48.16 
 
 
268 aa  231  1e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0730736  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  47.25 
 
 
258 aa  230  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0210  peptidase M48, Ste24p  48.92 
 
 
280 aa  216  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0148  peptidase M48, Ste24p  40.73 
 
 
268 aa  216  4e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4104  peptidase M48 Ste24p  48.51 
 
 
316 aa  214  2e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.75761e-08 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0517  peptidase M48, Ste24p  50.25 
 
 
281 aa  204  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2637  peptidase M48, Ste24p  46.15 
 
 
302 aa  203  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0093  putative signal peptide protein  45.78 
 
 
340 aa  203  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.485946  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0332  peptidase M48 Ste24p  49.77 
 
 
305 aa  201  9e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0192  peptidase M48, Ste24p  41.64 
 
 
319 aa  201  1e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.461964  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0264  peptidase M48 Ste24p  46.86 
 
 
288 aa  200  2e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197309  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0153  peptidase M48, Ste24p  45.24 
 
 
280 aa  199  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0497682  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0218  peptidase M48 Ste24p  46.32 
 
 
311 aa  200  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0203  peptidase M48, Ste24p  46.35 
 
 
291 aa  199  6e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0153  putative signal peptide protein  42.24 
 
 
314 aa  196  4e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700817  normal  0.82157 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0147  peptidase M48, Ste24p  44.53 
 
 
284 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0280  peptidase M48, Ste24p  44.54 
 
 
284 aa  191  8e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0043  peptidase M48 Ste24p  41.99 
 
 
314 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0046  peptidase M48 Ste24p  41.13 
 
 
314 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.330738 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2969  peptidase M48 Ste24p  40 
 
 
275 aa  184  1e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000829087  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1514  hypothetical protein  42.73 
 
 
254 aa  184  2e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  3.19394e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2379  peptidase M48 Ste24p  39.03 
 
 
285 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00799572  normal  0.0495258 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  41.53 
 
 
268 aa  179  3e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  2.69933e-07 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  38.04 
 
 
268 aa  163  4e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  3.10302e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  36.06 
 
 
262 aa  160  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2760  peptidase M48 Ste24p  37.78 
 
 
298 aa  155  7e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.293753  normal  0.755034 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  38.75 
 
 
271 aa  154  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2068  peptidase M48 Ste24p  40.34 
 
 
320 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  35.19 
 
 
262 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1200  peptidase M48 Ste24p  39.59 
 
 
275 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3099  peptidase M48 Ste24p  37.07 
 
 
349 aa  152  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6453  peptidase M48, Ste24p  35.86 
 
 
353 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0332  peptidase M48 Ste24p  35.16 
 
 
422 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1890  Zn-dependent protease  35.23 
 
 
273 aa  150  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0980  peptidase M48 Ste24p  36.07 
 
 
275 aa  150  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.269244  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4392  hypothetical protein  36.27 
 
 
266 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.863393  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0058  peptidase M48 Ste24p  35.96 
 
 
404 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0154  M48 family peptidase  36.29 
 
 
346 aa  149  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  34.8 
 
 
269 aa  149  7e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  34.66 
 
 
269 aa  148  9e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  34.66 
 
 
269 aa  148  9e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3278  peptidase M48, Ste24p  36.36 
 
 
265 aa  147  1e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  34.3 
 
 
269 aa  148  1e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  37.28 
 
 
272 aa  147  2e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  1.66595e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0179  hypothetical protein  35.86 
 
 
351 aa  147  2e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.308027  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3102  peptidase M48, Ste24p  35.34 
 
 
350 aa  147  2e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0189  hypothetical protein  35.86 
 
 
350 aa  147  2e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2488  peptidase M48, Ste24p  35.34 
 
 
350 aa  147  2e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2450  peptidase M48, Ste24p  39.58 
 
 
264 aa  147  2e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.195879  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12433  hypothetical protein  46.47 
 
 
274 aa  147  2e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0709327  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6512  peptidase M48 Ste24p  38.43 
 
 
267 aa  146  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00139826  normal  0.073163 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0374  M48 family peptidase  35.44 
 
 
350 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2904  hypothetical protein  35.86 
 
 
344 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2747  peptidase M48, Ste24p  39.91 
 
 
269 aa  146  4e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843465  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3444  hypothetical protein  35.86 
 
 
347 aa  146  4e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3243  hypothetical protein  35.86 
 
 
316 aa  146  4e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2185  hypothetical protein  35.86 
 
 
347 aa  146  4e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3040  peptidase M48 Ste24p  35.34 
 
 
344 aa  145  7e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.359784  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  36.57 
 
 
265 aa  145  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  34.88 
 
 
268 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  37.71 
 
 
248 aa  145  1e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  6.17052e-06  hitchhiker  6.5256e-06 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3118  peptidase M48 Ste24p  34.48 
 
 
350 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0012  peptidase M48, Ste24p  39.73 
 
 
284 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3157  peptidase M48, Ste24p  34.91 
 
 
344 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  35.54 
 
 
293 aa  142  7e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03478  peptidase M48, Ste24p  34.46 
 
 
268 aa  141  9e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1406  peptidase M48 Ste24p  34.83 
 
 
277 aa  139  4e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  34.48 
 
 
266 aa  139  4e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  7.04965e-06  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  41.59 
 
 
259 aa  139  4e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  36.55 
 
 
262 aa  139  4e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  37.18 
 
 
263 aa  138  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  36.89 
 
 
265 aa  138  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  32.98 
 
 
268 aa  136  3e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  37.4 
 
 
266 aa  136  3e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1935  peptidase M48 Ste24p  41.63 
 
 
271 aa  136  5e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  34.12 
 
 
266 aa  135  9e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  33.08 
 
 
263 aa  134  1e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  37.19 
 
 
255 aa  135  1e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1052  M48 family peptidase  32.82 
 
 
270 aa  134  2e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>