More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0920 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_0920  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
831 aa  1697    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  44.97 
 
 
838 aa  715    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1702  mannosyltransferase  42.16 
 
 
846 aa  624  1e-177  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.529704  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1631  glycosyl transferase group 1  42.22 
 
 
846 aa  621  1e-176  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.343672  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2168  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.39 
 
 
815 aa  598  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  39.43 
 
 
850 aa  567  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  37.09 
 
 
860 aa  514  1e-144  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  37.56 
 
 
859 aa  513  1e-144  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  50 
 
 
1261 aa  380  1e-104  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  39.56 
 
 
1241 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  45.91 
 
 
1398 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  38.34 
 
 
1241 aa  362  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2772  glycosyl transferase, group 1  32.46 
 
 
967 aa  361  4e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.602029  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2967  glycosyl transferase, group 1  45.98 
 
 
1915 aa  357  3.9999999999999996e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2579  glycosyl transferase group 1  45.98 
 
 
609 aa  357  3.9999999999999996e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0758  glycosyl transferase group 1  47.58 
 
 
1028 aa  354  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  36.58 
 
 
1243 aa  339  9.999999999999999e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  46.45 
 
 
1089 aa  335  3e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  31.89 
 
 
1229 aa  306  1.0000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  43.04 
 
 
1635 aa  300  9e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  38.19 
 
 
1219 aa  261  3e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1334  glycosyltransferase, putative  38.32 
 
 
431 aa  258  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218572  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  36.67 
 
 
1232 aa  234  6e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2582  glycosyl transferase group 1  36.76 
 
 
1332 aa  228  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.35538  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71930  glycosyltransferase WbpX  32.67 
 
 
460 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6239  glycosyltransferase WbpX  32.67 
 
 
460 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5686  glycosyl transferase, group 1  33.45 
 
 
455 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101413  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  32.08 
 
 
395 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  34.18 
 
 
374 aa  145  3e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 
382 aa  145  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  32.35 
 
 
351 aa  144  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  32.98 
 
 
400 aa  143  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  29.85 
 
 
375 aa  142  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  28.5 
 
 
381 aa  141  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0492  mannosyltransferase A  28.57 
 
 
743 aa  139  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.700737  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  28.05 
 
 
381 aa  136  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  32.5 
 
 
370 aa  135  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1975  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
763 aa  134  6.999999999999999e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.422047  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  35.15 
 
 
386 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  35.22 
 
 
394 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  35.86 
 
 
431 aa  133  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  33.05 
 
 
381 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  33.1 
 
 
417 aa  130  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  32.36 
 
 
376 aa  129  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  30.69 
 
 
408 aa  129  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  29.12 
 
 
420 aa  128  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  30.1 
 
 
375 aa  127  7e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  29.76 
 
 
375 aa  127  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  33.09 
 
 
370 aa  127  9e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  30.12 
 
 
366 aa  125  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 
380 aa  124  5e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  32.62 
 
 
382 aa  124  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 
381 aa  124  6e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  32.12 
 
 
380 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  31.32 
 
 
382 aa  124  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  24.76 
 
 
360 aa  123  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 
434 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0358  glycosyl transferase, group 1  27.72 
 
 
382 aa  123  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.348726  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 
383 aa  123  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3732  glycosyl transferase group 1  31.95 
 
 
371 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  0.583868 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 
378 aa  120  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  29.53 
 
 
373 aa  119  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
381 aa  118  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  28.11 
 
 
370 aa  118  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  32.56 
 
 
366 aa  117  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 
374 aa  117  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  34.58 
 
 
386 aa  117  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
381 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 
371 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 
371 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  34.18 
 
 
385 aa  116  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
381 aa  115  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3229  glycosyl transferase, group 1  31.27 
 
 
371 aa  115  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453901  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5863  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
444 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
384 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  32.22 
 
 
384 aa  114  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2280  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 
367 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00320483  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  31.07 
 
 
372 aa  113  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
369 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  33.47 
 
 
397 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 
377 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  32.96 
 
 
423 aa  112  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.4 
 
 
364 aa  111  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  30.66 
 
 
382 aa  111  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  30.71 
 
 
372 aa  111  7.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 
435 aa  110  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 
437 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  30.18 
 
 
366 aa  110  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.37 
 
 
401 aa  109  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.37 
 
 
414 aa  109  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  31.74 
 
 
398 aa  109  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.37 
 
 
414 aa  109  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.37 
 
 
414 aa  109  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.37 
 
 
414 aa  109  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.37 
 
 
361 aa  109  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  30.37 
 
 
361 aa  109  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3447  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.42 
 
 
369 aa  108  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
380 aa  108  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1733  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 
384 aa  108  4e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 
371 aa  108  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>