More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0862 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  75.63 
 
 
667 aa  1004    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  100 
 
 
673 aa  1366    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  57.6 
 
 
643 aa  431  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  46.39 
 
 
645 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  37.5 
 
 
656 aa  399  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  37.99 
 
 
629 aa  394  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  37.43 
 
 
656 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  38.24 
 
 
665 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0435  acyltransferase 3  38.24 
 
 
679 aa  343  7e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.81712 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  37.56 
 
 
662 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  34.45 
 
 
660 aa  336  1e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  35.29 
 
 
695 aa  331  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69170  putative O-antigen acetylase  36.17 
 
 
662 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  35.57 
 
 
695 aa  325  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  45.73 
 
 
642 aa  323  6e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  32.41 
 
 
690 aa  317  5e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  35.31 
 
 
695 aa  310  5.9999999999999995e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  35.04 
 
 
629 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_011315  VSAL_p54_03  acyltransferase  32.21 
 
 
642 aa  309  1.0000000000000001e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.362945  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  35.04 
 
 
647 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  34.9 
 
 
671 aa  301  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  37.9 
 
 
629 aa  297  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  37.67 
 
 
630 aa  294  4e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  34.34 
 
 
683 aa  293  6e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  37.57 
 
 
632 aa  290  5.0000000000000004e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  33.23 
 
 
679 aa  285  3.0000000000000004e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  37.41 
 
 
675 aa  283  6.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  39.7 
 
 
637 aa  281  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0040  acyltransferase 3  34.47 
 
 
635 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.578182  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  33.48 
 
 
665 aa  275  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  33.67 
 
 
660 aa  263  8e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  31.38 
 
 
616 aa  263  8e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  32.1 
 
 
658 aa  263  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0963  acyltransferase family protein  33.04 
 
 
759 aa  263  1e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.284523  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05637  acyltransferase  32.58 
 
 
615 aa  260  5.0000000000000005e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5647  putative acyltransferase, group 3  33.23 
 
 
654 aa  260  7e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0265  acyltransferase 3  34.16 
 
 
645 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796474  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  30.9 
 
 
635 aa  257  4e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  31.32 
 
 
634 aa  254  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  31.82 
 
 
662 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  31.45 
 
 
684 aa  251  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  41.58 
 
 
640 aa  250  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2758  O-antigen acetylase  35.62 
 
 
691 aa  243  6e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  35.9 
 
 
690 aa  243  9e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  29.62 
 
 
657 aa  241  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  32.33 
 
 
660 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  29.28 
 
 
657 aa  238  2e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4228  acyltransferase 3  31.62 
 
 
651 aa  238  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0660245  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1310  acyltransferase 3  33.18 
 
 
621 aa  235  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.502976  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5281  hypothetical protein  32.21 
 
 
644 aa  233  8.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458254  normal  0.151011 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1858  acyltransferase family protein  28.93 
 
 
636 aa  229  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.772864  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1096  acyltransferase 3  28.87 
 
 
614 aa  228  4e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  32.43 
 
 
681 aa  226  1e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3904  putative acyltransferase  31.71 
 
 
678 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  28.72 
 
 
658 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  28.11 
 
 
639 aa  219  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0761  acyltransferase 3  30.78 
 
 
690 aa  218  2e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5130  putative acyltransferase 3  31.98 
 
 
647 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  38.15 
 
 
583 aa  217  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  37.18 
 
 
603 aa  214  4.9999999999999996e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6545  acyltransferase 3  35.78 
 
 
675 aa  213  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351967 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  35.23 
 
 
638 aa  213  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4561  acyltransferase 3  32.12 
 
 
626 aa  211  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.064478  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  28.51 
 
 
675 aa  209  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  31.54 
 
 
660 aa  203  7e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  33.42 
 
 
598 aa  203  9e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5087  acyltransferase 3  33.21 
 
 
627 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2845  hypothetical protein  27.2 
 
 
658 aa  201  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  36.81 
 
 
660 aa  199  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0638  acyltransferase family protein  28.94 
 
 
647 aa  199  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.482151 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  28.51 
 
 
690 aa  198  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0069  acyltransferase 3  27.79 
 
 
652 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0131  acyltransferase 3  40.73 
 
 
726 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.971187  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0140  acyltransferase 3  40.73 
 
 
726 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.939637 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5547  acyltransferase family protein  39.41 
 
 
628 aa  196  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  26.76 
 
 
658 aa  195  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0121  acyltransferase 3  40.73 
 
 
726 aa  196  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.695544  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  28.07 
 
 
711 aa  193  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1409  acyltransferase 3  25.98 
 
 
695 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000344331  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  28.94 
 
 
682 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0485  acyltransferase 3  27.6 
 
 
777 aa  189  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.712131  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0443  acyltransferase 3  29.32 
 
 
625 aa  185  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0119902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5131  putative acyltransferase  36.4 
 
 
632 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0498038  normal  0.0856851 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26700  predicted acyltransferase  36.57 
 
 
718 aa  178  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  28.17 
 
 
716 aa  177  5e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  35.03 
 
 
607 aa  175  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2521  acyltransferase 3  35.79 
 
 
641 aa  174  5.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191199  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  34.25 
 
 
685 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  33.15 
 
 
604 aa  172  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  33.15 
 
 
604 aa  172  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26820  predicted acyltransferase  36.29 
 
 
720 aa  171  4e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26680  predicted acyltransferase  35.48 
 
 
679 aa  171  6e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00401  acyltransferase  27.02 
 
 
696 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8971  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3258  acyltransferase 3  32.51 
 
 
725 aa  169  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.575556  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6674  acyltransferase 3  39.12 
 
 
720 aa  166  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  33.61 
 
 
603 aa  164  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  33.61 
 
 
603 aa  164  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2137  hypothetical protein  32.5 
 
 
602 aa  164  7e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2687  acyltransferase 3  36.07 
 
 
734 aa  163  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231986  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  25.04 
 
 
675 aa  162  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>