More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0842 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4792  penicillin-binding protein 1B  82.56 
 
 
774 aa  1360  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000464587  hitchhiker  0.000389854 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1002  penicillin-binding protein 1B  77.91 
 
 
772 aa  1250  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  6.7337e-14 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2557  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1B  50.2 
 
 
778 aa  754  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.07966e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1407  penicillin-binding protein 1B  47.34 
 
 
748 aa  667  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0297434  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0977  penicillin-binding protein  98.19 
 
 
773 aa  1561  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0441683  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1154  penicillin-binding protein 1B  44.58 
 
 
776 aa  644  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0751  penicillin-binding protein 1B  82.28 
 
 
773 aa  1348  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.288465  hitchhiker  6.86308e-11 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0650  penicillin-binding protein 1B  44.98 
 
 
830 aa  641  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0842  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
773 aa  1585  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122469 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0825  Mutator MutT  44.7 
 
 
777 aa  652  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00304949  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0679  penicillin-binding protein 1B  48.95 
 
 
772 aa  752  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.963541  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62200  penicillin-binding protein 1B  76.39 
 
 
774 aa  1228  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.379753 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5415  penicillin-binding protein 1B  76.42 
 
 
775 aa  1225  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4683  penicillin-binding protein 1B  80.85 
 
 
773 aa  1324  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000305505 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1672  penicillin-binding protein, putative  51.04 
 
 
759 aa  742  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42560  penicillin-binding protein 1B  72.77 
 
 
780 aa  1178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4547  penicillin-binding protein 1B  80.85 
 
 
773 aa  1325  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.428177  hitchhiker  2.22687e-06 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2163  penicillin-binding protein 1B  49.66 
 
 
732 aa  733  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4681  penicillin-binding protein 1B  81.37 
 
 
773 aa  1330  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  hitchhiker  6.05496e-12 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1646  penicillin-binding protein 1B  44.11 
 
 
827 aa  630  1e-179  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.201466  hitchhiker  0.00102238 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1468  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  43.87 
 
 
827 aa  629  1e-179  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.614381  unclonable  2.4056e-06 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1297  penicillin-binding protein 1B  42.67 
 
 
780 aa  624  1e-177  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1620  penicillin-binding protein 1B  44.61 
 
 
881 aa  624  1e-177  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  8.78907e-07  unclonable  8.79141e-10 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0624  penicillin-binding protein 1B  42.99 
 
 
764 aa  602  1e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0489  penicillin-binding protein 1B  40.96 
 
 
781 aa  600  1e-170  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.290067  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0623  penicillin-binding protein 1B  42.99 
 
 
764 aa  601  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.494369 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3406  penicillin-binding protein 1B  42.99 
 
 
764 aa  601  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0633  penicillin-binding protein 1B  41.63 
 
 
768 aa  592  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3742  penicillin-binding protein 1B  42.31 
 
 
791 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0705  penicillin-binding protein 1B  41.9 
 
 
790 aa  586  1e-166  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.559633  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3164  penicillin-binding protein 1B  42.99 
 
 
768 aa  588  1e-166  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0656  penicillin-binding protein 1B  42.86 
 
 
779 aa  586  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3685  penicillin-binding protein 1B  41.9 
 
 
774 aa  583  1e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3868  penicillin-binding protein 1B  42.04 
 
 
774 aa  583  1e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0583  penicillin-binding protein 1B  42.04 
 
 
774 aa  583  1e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3270  penicillin-binding protein 1B  40.42 
 
 
766 aa  580  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0131  penicillin-binding protein 1B  42.64 
 
 
777 aa  577  1e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00472  penicillin-binding protein 1B  40.99 
 
 
742 aa  577  1e-163  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2971  peptidoglycan glycosyltransferase  42.8 
 
 
779 aa  577  1e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3123  penicillin-binding protein 1B  41.36 
 
 
789 aa  573  1e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  7.74308e-06 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3463  penicillin-binding protein 1b  40.41 
 
 
826 aa  570  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.995661  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03443  hypothetical protein  40.96 
 
 
796 aa  570  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3334  penicillin-binding protein 1b  40.28 
 
 
826 aa  569  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1000  penicillin-binding protein 1b  40.34 
 
 
824 aa  568  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3792  penicillin-binding protein 1B  40.27 
 
 
790 aa  566  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.692226  decreased coverage  9.07679e-07 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002568  multimodular transpeptidase-transglycosylase  41.78 
 
 
790 aa  567  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3894  peptidoglycan glycosyltransferase  40.82 
 
 
787 aa  566  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3981  penicillin-binding protein 1b  42.56 
 
 
836 aa  564  1e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.289458  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3110  penicillin-binding protein 1b  42.66 
 
 
826 aa  555  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2602  penicillin-binding protein transpeptidase  41.45 
 
 
791 aa  557  1e-157  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.809187  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1036  penicillin-binding protein 1b  41.63 
 
 
833 aa  551  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.970019  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1168  penicillin-binding protein 1b  40.92 
 
 
826 aa  551  1e-155  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2815  penicillin-binding protein 1b  39.84 
 
 
827 aa  544  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.692041  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4301  penicillin-binding protein  39.27 
 
 
769 aa  542  1e-152  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0596  penicillin-binding protein 1B  40.56 
 
 
730 aa  526  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0222  penicillin-binding protein 1b  41.09 
 
 
840 aa  528  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3095  penicillin-binding protein 1B  40.35 
 
 
813 aa  527  1e-148  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.911918 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0225  penicillin-binding protein 1b  40.95 
 
 
840 aa  525  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0207  penicillin-binding protein 1b  40.95 
 
 
840 aa  525  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0218  penicillin-binding protein 1b  40.95 
 
 
840 aa  524  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0206  penicillin-binding protein 1b  40.81 
 
 
840 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1239  peptidoglycan glycosyltransferase  38.66 
 
 
766 aa  520  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.191968  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0689  penicillin-binding protein 1b  40.56 
 
 
841 aa  518  1e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3510  penicillin-binding protein 1b  39.97 
 
 
844 aa  517  1e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.933967  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0152  penicillin-binding protein 1b  39.97 
 
 
844 aa  515  1e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.94433  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0153  penicillin-binding protein 1b  39.97 
 
 
844 aa  515  1e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.267501  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00148  penicillin-binding protein 1b  39.97 
 
 
841 aa  516  1e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3453  penicillin-binding protein 1B  39.97 
 
 
844 aa  516  1e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.9649  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0140  penicillin-binding protein 1b  39.84 
 
 
840 aa  516  1e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01595  penicillin-binding protein 1B  39.26 
 
 
814 aa  518  1e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00147  hypothetical protein  39.97 
 
 
841 aa  516  1e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0160  penicillin-binding protein 1b  39.97 
 
 
844 aa  515  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0158  penicillin-binding protein 1b  39.97 
 
 
844 aa  515  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1899  penicillin-binding protein 1B  38.78 
 
 
792 aa  501  1e-140  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0825  penicillin-binding protein 1B  37.52 
 
 
754 aa  498  1e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.524532  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1965  peptidoglycan glycosyltransferase  38.96 
 
 
792 aa  489  1e-137  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  35.75 
 
 
757 aa  426  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1065  penicillin-binding protein 1A  33.33 
 
 
890 aa  385  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.375339  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0908  1A family penicillin-binding protein  31.41 
 
 
766 aa  361  2e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  37.42 
 
 
720 aa  317  5e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  37.88 
 
 
739 aa  317  5e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  37.13 
 
 
714 aa  311  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  37.61 
 
 
714 aa  310  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  33.67 
 
 
744 aa  310  8e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  33.68 
 
 
701 aa  310  8e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  36.63 
 
 
732 aa  306  1e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  36.8 
 
 
741 aa  305  2e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  38.07 
 
 
757 aa  305  2e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  36.82 
 
 
735 aa  303  8e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  37.09 
 
 
734 aa  303  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  34.15 
 
 
761 aa  300  6e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  32.13 
 
 
667 aa  299  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.45418e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  33.22 
 
 
683 aa  296  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  34.18 
 
 
734 aa  296  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  32.72 
 
 
683 aa  294  4e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  32.28 
 
 
683 aa  294  5e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  31.86 
 
 
662 aa  294  5e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  32.67 
 
 
683 aa  293  6e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  34.53 
 
 
625 aa  293  7e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  32.39 
 
 
683 aa  293  7e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>