117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0838 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_0838  Rieske [2Fe-2S] region  100 
 
 
132 aa  274  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  6.49112e-05 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0972  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  80.95 
 
 
110 aa  181  2e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  2.77135e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62360  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  66.36 
 
 
115 aa  158  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5427  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  66.67 
 
 
107 aa  152  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0992  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  66.35 
 
 
105 aa  149  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  hitchhiker  1.16756e-09 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4801  Rieske (2Fe-2S) region  66.02 
 
 
105 aa  147  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0146102  hitchhiker  0.00629459 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0744  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  65.35 
 
 
105 aa  145  2e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.347579  hitchhiker  6.39734e-10 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42610  hypothetical protein  61.17 
 
 
105 aa  137  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.217045  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4688  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  63 
 
 
105 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0626972  hitchhiker  4.88951e-08 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4690  Rieske (2Fe-2S) domain protein  64 
 
 
114 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000178918 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4554  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  63 
 
 
105 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  7.41211e-07 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3370  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  45.45 
 
 
104 aa  104  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0252226 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2849  Rieske (2Fe-2S) protein  47.87 
 
 
118 aa  102  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0114  Rieske (2Fe-2S) domain protein  62.67 
 
 
108 aa  100  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225812  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3198  ferredoxin, 2Fe-2S  42.59 
 
 
112 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0027175  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.45 
 
 
153 aa  85.5  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3574  Rieske (2Fe-2S) region  45.74 
 
 
117 aa  85.9  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.556915  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3905  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  39.25 
 
 
114 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391138  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1935  hypothetical protein  40.21 
 
 
120 aa  81.6  3e-15  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455363  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0858  Rieske (2Fe-2S) region  43.16 
 
 
120 aa  80.1  9e-15  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5912  hypothetical protein  39.8 
 
 
155 aa  79.3  2e-14  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1381  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.45 
 
 
123 aa  78.2  4e-14  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3657  Rieske (2Fe-2S) region  36.04 
 
 
121 aa  77.4  6e-14  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0676  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  54.24 
 
 
123 aa  76.3  1e-13  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1723  Rieske (2Fe-2S) protein  40.26 
 
 
121 aa  75.9  2e-13  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5489  ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  37.89 
 
 
119 aa  75.9  2e-13  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.121832  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5279  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.74 
 
 
124 aa  74.7  4e-13  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238737  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1176  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.26 
 
 
125 aa  73.9  7e-13  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262842  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3141  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.64 
 
 
120 aa  73.6  8e-13  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5626  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.74 
 
 
111 aa  73.6  9e-13  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.164476 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35 
 
 
134 aa  73.6  1e-12  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00744341  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1710  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  39 
 
 
131 aa  72.4  2e-12  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0741905  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0659  hypothetical protein  37.04 
 
 
136 aa  72  2e-12  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4829  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.18 
 
 
119 aa  72.8  2e-12  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.642068 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3083  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.96 
 
 
121 aa  71.6  3e-12  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0523  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  39 
 
 
131 aa  71.6  3e-12  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472442  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1238  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
109 aa  71.6  3e-12  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724379  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2795  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  39 
 
 
131 aa  71.6  3e-12  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00324792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2799  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  39 
 
 
131 aa  71.6  3e-12  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0503713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2860  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  39 
 
 
131 aa  71.6  3e-12  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0573473  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1810  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  39 
 
 
131 aa  71.6  3e-12  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2008  Rieske (2Fe-2S) region  37.25 
 
 
119 aa  71.6  3e-12  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2487  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  39 
 
 
131 aa  71.6  3e-12  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00132222  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01838  rieske  45.21 
 
 
113 aa  70.9  5e-12  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.318103  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4226  Rieske (2Fe-2S) protein  44.16 
 
 
133 aa  71.2  5e-12  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1065  hypothetical protein  40.79 
 
 
133 aa  70.9  5e-12  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967629  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1114  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.86 
 
 
133 aa  70.5  7e-12  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0990  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.86 
 
 
136 aa  70.5  7e-12  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0994  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.86 
 
 
136 aa  70.5  7e-12  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1072  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.86 
 
 
133 aa  70.5  7e-12  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  0.136055 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2190  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.86 
 
 
132 aa  70.5  7e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0622882 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0634  Rieske (2Fe-2S) region  42.86 
 
 
133 aa  70.5  7e-12  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4785  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.04 
 
 
126 aa  70.5  8e-12  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0973  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.96 
 
 
130 aa  69.7  1e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0908  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.26 
 
 
130 aa  70.1  1e-11  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.313285  normal  0.0276254 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1043  hypothetical protein  41.56 
 
 
138 aa  70.1  1e-11  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0922873  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0821  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.48 
 
 
130 aa  70.1  1e-11  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239168  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3650  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.68 
 
 
130 aa  68.9  2e-11  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27405 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2272  Rieske (2Fe-2S) region  39.25 
 
 
134 aa  68.9  2e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1174  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.35 
 
 
142 aa  69.3  2e-11  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2640  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.76 
 
 
125 aa  69.3  2e-11  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2437  Rieske (2Fe-2S) region  43.75 
 
 
127 aa  68.9  2e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.55603  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3287  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.76 
 
 
125 aa  69.3  2e-11  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3434  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.99 
 
 
111 aa  68.9  2e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.48 
 
 
111 aa  68.2  3e-11  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.242192  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0114  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.86 
 
 
122 aa  67.8  4e-11  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0228441  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4083  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.67 
 
 
111 aa  68.2  4e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171695  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1340  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.89 
 
 
116 aa  67.8  5e-11  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  4.1033e-05 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6068  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
111 aa  67.4  6e-11  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0959217  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5218  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.98 
 
 
111 aa  67  7e-11  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434864  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0589  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.78 
 
 
126 aa  66.6  1e-10  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.03606 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3380  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.99 
 
 
111 aa  66.2  1e-10  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0350  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.37 
 
 
217 aa  65.5  2e-10  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4253  hypothetical protein  27.45 
 
 
144 aa  65.5  2e-10  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.825501  normal  0.678624 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1561  hypothetical protein  38.46 
 
 
116 aa  63.2  1e-09  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.150485  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2735  Rieske (2Fe-2S) protein  34.83 
 
 
111 aa  62.4  2e-09  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0390389  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2392  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.04 
 
 
124 aa  62.4  2e-09  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348824  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2167  hypothetical protein  35.29 
 
 
149 aa  59.3  2e-08  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2495  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.31 
 
 
151 aa  55.1  4e-07  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.746892 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0130  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.64 
 
 
149 aa  54.3  5e-07  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0036  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.37 
 
 
111 aa  52.4  2e-06  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1488  PfkB  29.49 
 
 
401 aa  52.4  2e-06  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1421  Rieske (2Fe-2S) region  32.56 
 
 
122 aa  52  3e-06  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.606028 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1663  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.1 
 
 
118 aa  50.8  7e-06  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  31.18 
 
 
270 aa  47.4  6e-05  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4812  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.95 
 
 
304 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  33.33 
 
 
289 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1676  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.5 
 
 
349 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.945696  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1649  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.5 
 
 
370 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3238  Rieske 2Fe-2S family protein  27.71 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00145958  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2157  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.95 
 
 
182 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00819561  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2454  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.96 
 
 
421 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  4.86629e-05  normal  0.341461 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3205  nitrogen-fixing NifU-like  24.74 
 
 
311 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0029  Ketohexokinase  28.89 
 
 
420 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.892362  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0161  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.38 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  3.94797e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0144  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.38 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.63 
 
 
349 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.725754  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2796  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.92 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4115  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  40.68 
 
 
127 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.063358  normal  0.0248701 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1813  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.83 
 
 
309 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>