More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0676 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0246  putative transporter  76.89 
 
 		 468 aa  636    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0772  xanthine/uracil permease family protein  94.62 
 
 		 465 aa  874    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0676  xanthine/uracil permease family protein  100 
 
 		 465 aa  916    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02070  putative transporter  77.56 
 
 		 468 aa  692    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3698  uracil-xanthine permease  71.3 
 
 		 458 aa  655    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29700  Xanthine/uracil permease family  73.8 
 
 		 434 aa  597  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440339  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2223  uracil-xanthine permease  56.34 
 
 		 486 aa  525  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9529  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2573  xanthine/uracil permease  56.86 
 
 		 488 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837533 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2762  uracil-xanthine permease  55.97 
 
 		 500 aa  504  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.648328  normal  0.727682 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1913  uracil-xanthine permease  53.43 
 
 		 468 aa  493  9.999999999999999e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00677424  normal  0.0587093 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02501  xanthine/uracil permease family protein  51.53 
 
 		 517 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001868  xanthine/uracil permease family protein  46.96 
 
 		 462 aa  429  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2284  xanthine/uracil permease family protein  48.07 
 
 		 466 aa  429  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00623  hypothetical protein  48.16 
 
 		 463 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4133  uracil-xanthine permease  47.99 
 
 		 463 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.297531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4027  uracil-xanthine permease  47.99 
 
 		 463 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3964  uracil-xanthine permease  47.99 
 
 		 463 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3521  xanthine permease  48.07 
 
 		 462 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.964115  normal  0.563042 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3954  uracil-xanthine permease  47.99 
 
 		 463 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4073  uracil-xanthine permease  47.99 
 
 		 463 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.853642 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2088  xanthine/uracil transporter  48.07 
 
 		 462 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.365471  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3953  uracil-xanthine permease  48 
 
 		 462 aa  414  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1785  uracil-xanthine permease  46.8 
 
 		 484 aa  412  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4364  uracil-xanthine permease  48.07 
 
 		 462 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0073  uracil-xanthine permease  48.43 
 
 		 464 aa  414  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.134664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4002  uracil-xanthine permease  48.07 
 
 		 462 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0034  xanthine permease  47.45 
 
 		 461 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.830973  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1007  xanthine/uracil permease family protein subfamily  48.19 
 
 		 462 aa  411  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1892  xanthine/uracil permease family protein  47.51 
 
 		 462 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1222  xanthine permease  47.51 
 
 		 462 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.622756  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4182  uracil-xanthine permease  47.33 
 
 		 472 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1231  xanthine permease  47.51 
 
 		 462 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0801  xanthine/uracil permease family protein  47.51 
 
 		 462 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3408  uracil-xanthine permease  46.98 
 
 		 462 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal  0.0616677 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0349  xanthine/uracil permease family protein  47.51 
 
 		 462 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1066  xanthine/uracil permease family protein  47.51 
 
 		 462 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4581  xanthine permease  48.3 
 
 		 462 aa  405  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0039  xanthine permease  46.89 
 
 		 461 aa  402  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1376  xanthine/uracil permease family protein  47.29 
 
 		 509 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.108395  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3915  xanthine permease  47.18 
 
 		 462 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.53056 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03512  predicted transporter  47.76 
 
 		 463 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.508451  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0051  uracil-xanthine permease  47.76 
 
 		 463 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0057  uracil-xanthine permease  47.76 
 
 		 463 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0676705 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4158  xanthine permease  47.76 
 
 		 463 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03464  hypothetical protein  47.76 
 
 		 463 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.514946  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5027  xanthine permease  47.76 
 
 		 463 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4105  xanthine permease  47.53 
 
 		 463 aa  399  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3865  xanthine permease  47.76 
 
 		 463 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3989  xanthine permease  47.31 
 
 		 463 aa  398  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4873  uracil-xanthine permease  47.31 
 
 		 466 aa  394  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.952171  normal  0.0111954 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4150  uracil-xanthine permease  48.31 
 
 		 462 aa  395  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3992  xanthine/uracil permease family protein  46.52 
 
 		 459 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1841  uracil-xanthine permease  46.74 
 
 		 459 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895635 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0445  putative transporter  47.62 
 
 		 461 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4214  uracil-xanthine permease  46.76 
 
 		 462 aa  391  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04610  putative transporter  47.65 
 
 		 461 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4497  uracil-xanthine permease  46.76 
 
 		 462 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3396  xanthine permease  46.74 
 
 		 459 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.559771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3597  xanthine permease  46.29 
 
 		 459 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243938 
 
 
-
 
NC_002950  PG2148  xanthine/uracil permease family protein  48.08 
 
 		 445 aa  378  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0538  purine/xanthine transport protein  43.31 
 
 		 453 aa  366  1e-100  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3015  xanthine/uracil permease family protein  44.54 
 
 		 466 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0826  uracil-xanthine permease  44.54 
 
 		 466 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0810  uracil-xanthine permease  44.54 
 
 		 466 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3042  xanthine/uracil permease family protein  44.54 
 
 		 466 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3208  xanthine/uracil permease family protein  44.54 
 
 		 466 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4172  xanthine/uracil permease family protein  44.54 
 
 		 466 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02715  predicted transporter  44.32 
 
 		 466 aa  355  1e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02677  hypothetical protein  44.32 
 
 		 466 aa  355  1e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92624  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1726  uracil-xanthine permease  42.57 
 
 		 452 aa  340  2.9999999999999998e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0161  xanthine permease  37.09 
 
 		 451 aa  282  1e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2522  xanthine permease  36.62 
 
 		 449 aa  251  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0140814  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0384  xanthine permease  35.35 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1592  xanthine permease  37.64 
 
 		 438 aa  250  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0385  uracil-xanthine permease  35.35 
 
 		 452 aa  251  3e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3725  uracil-xanthine permease  38.6 
 
 		 445 aa  247  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0426  uracil-xanthine permease  34.23 
 
 		 458 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3928  xanthine permease  39.11 
 
 		 461 aa  238  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.570861  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3473  uracil-xanthine permease  33.83 
 
 		 479 aa  233  5e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.179383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1668  uracil-xanthine permease  33.05 
 
 		 465 aa  224  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2388  xanthine permease  36.85 
 
 		 435 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2606  uracil-xanthine permease  32.98 
 
 		 478 aa  222  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.03048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2003  uracil-xanthine permease  35.18 
 
 		 466 aa  220  5e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0249  xanthine permease  33.75 
 
 		 487 aa  219  6e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1698  xanthine permease  33.7 
 
 		 440 aa  219  7e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1738  xanthine permease  33.7 
 
 		 440 aa  219  7e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00633397  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1662  xanthine permease  33.48 
 
 		 440 aa  216  5e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.80713 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1476  xanthine permease  33.48 
 
 		 440 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1448  xanthine permease  33.48 
 
 		 440 aa  216  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.868046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1449  xanthine permease  33.48 
 
 		 440 aa  216  5e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1592  xanthine permease  33.48 
 
 		 440 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1627  xanthine permease  33.55 
 
 		 440 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3718  xanthine permease  33.55 
 
 		 440 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.46094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1491  uracil-xanthine permease  33.55 
 
 		 440 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.994687  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1303  uracil-xanthine permease  33.33 
 
 		 440 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3202  uracil permease  33.55 
 
 		 474 aa  212  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324856  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1300  uracil-xanthine permease  34.54 
 
 		 493 aa  212  1e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3109  uracil-xanthine permease  33.77 
 
 		 470 aa  209  9e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.74503  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1691  xanthine permease  33.19 
 
 		 466 aa  209  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2010  xanthine permease  32.96 
 
 		 466 aa  207  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0376042  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>