162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0662 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0662  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  100 
 
 		 321 aa  664    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.937654 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0758  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  92.83 
 
 		 321 aa  625  1e-178  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  84.38 
 
 		 321 aa  566  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2994  2OG-Fe(II) oxygenase  72.01 
 
 		 320 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01810  putative oxidoreductase  72.19 
 
 		 320 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.773533  normal  0.461944 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0225  putative oxidoreductase  72.19 
 
 		 320 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2435  2OG-Fe(II) oxygenase  46.23 
 
 		 318 aa  292  6e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000377785  normal  0.0745566 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0856  2OG-Fe(II) oxygenase  45.71 
 
 		 313 aa  277  1e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46878  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5111  2OG-Fe(II) oxygenase  38.32 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141171  normal  0.0243264 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4357  2OG-Fe(II) oxygenase  40.44 
 
 		 327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11188  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00230)  38.08 
 
 		 349 aa  228  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1818  putative oxidoreductase  38.7 
 
 		 329 aa  225  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  39.13 
 
 		 329 aa  221  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.266793  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2858  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  37.89 
 
 		 337 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.863693  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5231  2OG-Fe(II) oxygenase  38.36 
 
 		 351 aa  209  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4351  2OG-Fe(II) oxygenase  34.23 
 
 		 337 aa  209  6e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2980  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  38.46 
 
 		 337 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00391841  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1850  2OG-Fe(II) oxygenase  39.12 
 
 		 346 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1897  2OG-Fe(II) oxygenase  39.12 
 
 		 346 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1831  2OG-Fe(II) oxygenase  39.12 
 
 		 346 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1377  2OG-Fe(II) oxygenase  41.08 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.537796  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02720  conserved hypothetical protein  35.89 
 
 		 345 aa  204  2e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1242  2OG-Fe(II) oxygenase  37.96 
 
 		 352 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888679 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  35.6 
 
 		 334 aa  203  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1380  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  37.26 
 
 		 353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87154  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1140  2OG-Fe(II) oxygenase  38.91 
 
 		 316 aa  185  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.592265  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5009  2OG-Fe(II) oxygenase  41.92 
 
 		 330 aa  182  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.455169  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4042  2OG-Fe(II) oxygenase  35.76 
 
 		 339 aa  179  7e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1362  2OG-Fe(II) oxygenase  35.87 
 
 		 341 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310836  normal  0.0218299 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2839  2OG-Fe(II) oxygenase  31.56 
 
 		 316 aa  172  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.323961  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1639  2OG-Fe(II) oxygenase  40.07 
 
 		 346 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2219  2OG-Fe(II) oxygenase  35.56 
 
 		 341 aa  171  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01276  oxidoreductase  37.01 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1698  2OG-Fe(II) oxygenase  38.41 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.199962  normal  0.108876 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10948  oxidoreductase  32.81 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07953  conserved hypothetical protein  30.35 
 
 		 338 aa  165  9e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.679163  normal  0.189791 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00051  conserved hypothetical protein: thymine dioxygenase (Eurofung)  31.34 
 
 		 350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.862893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2334  2OG-Fe(II) oxygenase  37 
 
 		 350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2035  2OG-Fe(II) oxygenase  33.76 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2834  2OG-Fe(II) oxygenase  35.58 
 
 		 311 aa  163  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0316  2OG-Fe(II) oxygenase  37.02 
 
 		 334 aa  162  9e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1330  2OG-Fe(II) oxygenase  35.83 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000246979  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3331  2OG-Fe(II) oxygenase  37.63 
 
 		 340 aa  160  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2602  2OG-Fe(II) oxygenase  37.63 
 
 		 348 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0258  2OG-Fe(II) oxygenase  34.33 
 
 		 343 aa  159  6e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2744  2OG-Fe(II) oxygenase  38.01 
 
 		 355 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5615  2OG-Fe(II) oxygenase  37.46 
 
 		 367 aa  156  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783104  normal  0.336051 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1098  2OG-Fe(II) oxygenase  33.44 
 
 		 323 aa  156  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00260099  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4252  2OG-Fe(II) oxygenase  32.01 
 
 		 344 aa  156  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2663  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  38.01 
 
 		 355 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3169  2OG-Fe(II) oxygenase  35.54 
 
 		 346 aa  156  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235169 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3789  2OG-Fe(II) oxygenase  33.92 
 
 		 352 aa  155  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1265  2OG-Fe(II) oxygenase  33.13 
 
 		 356 aa  155  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.602158  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1716  2OG-Fe(II) oxygenase  33.44 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.863963 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  36.62 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3655  2OG-Fe(II) oxygenase  36.59 
 
 		 340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  31.03 
 
 		 318 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1340  2OG-Fe(II) oxygenase  36.55 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0498174  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1734  2OG-Fe(II) oxygenase  29.9 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00619984  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0728  2OG-Fe(II) oxygenase  35.17 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03672  conserved hypothetical protein  27.46 
 
 		 335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.278231  normal  0.0460454 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17574  predicted protein  31.73 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.769732  normal  0.690692 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0315  2OG-Fe(II) oxygenase  36.68 
 
 		 334 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0311  2OG-Fe(II) oxygenase  36.68 
 
 		 334 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  33.12 
 
 		 348 aa  145  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3166  2OG-Fe(II) oxygenase  34.6 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2706  2OG-Fe(II) oxygenase  29.84 
 
 		 318 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5574  2OG-Fe(II) oxygenase  35.55 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1625  2OG-Fe(II) oxygenase  36.52 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179201 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3490  2OG-Fe(II) oxygenase  35.64 
 
 		 343 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3553  2OG-Fe(II) oxygenase  35.64 
 
 		 343 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.379896  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2632  2OG-Fe(II) oxygenase  34.36 
 
 		 344 aa  142  8e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39543  predicted protein  32.98 
 
 		 355 aa  141  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159789  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7168  hypothetical protein  35.04 
 
 		 352 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.04303  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3503  2OG-Fe(II) oxygenase  35.29 
 
 		 343 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00994559  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2508  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  36.01 
 
 		 347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  33.44 
 
 		 343 aa  139  7.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0775  2OG-Fe(II) oxygenase  35.88 
 
 		 343 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214657  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02390  conserved hypothetical protein  30.97 
 
 		 341 aa  138  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01370  conserved hypothetical protein  32.53 
 
 		 330 aa  135  9e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0670  2OG-Fe(II) oxygenase  37.92 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.635295 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4579  2OG-Fe(II) oxygenase  34.75 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2885  2OG-Fe(II) oxygenase  33.66 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1602  2OG-Fe(II) oxygenase  28.89 
 
 		 318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.29559 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1545  iron/ascorbate-dependent oxidoreductase  34.71 
 
 		 326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00526  conserved hypothetical protein  31.15 
 
 		 332 aa  129  6e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.333094 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0182  2OG-Fe(II) oxygenase  35.96 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0477  2OG-Fe(II) oxygenase  27.76 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51291  predicted protein  31.03 
 
 		 300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.964092  normal  0.399853 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36774  predicted protein  31.03 
 
 		 300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169141  normal  0.0126038 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02622  Isopenicillin N synthetase (EC 1.21.3.1)(Isopenicillin N synthase)(IPNS) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05326]  31.69 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10323  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14880)  30.63 
 
 		 375 aa  120  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.168786  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07893  conserved hypothetical protein  28.92 
 
 		 326 aa  119  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02668  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00750)  29.85 
 
 		 353 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0894035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31468  predicted protein  27.97 
 
 		 341 aa  116  5e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4256  2OG-Fe(II) oxygenase  30.3 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.798604  normal  0.385246 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5408  flavonol synthase/dioxygenase  30.03 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1135  2OG-Fe(II) oxygenase  31.51 
 
 		 340 aa  106  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2453  2OG-Fe(II) oxygenase  30.9 
 
 		 351 aa  106  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0260647  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1214  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  27.92 
 
 		 330 aa  105  8e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.982444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>