More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0659 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0659  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  100 
 
 		 307 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0755  transcriptional regulator, LysR family  93.16 
 
 		 307 aa  552  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0668  LysR family transcriptional regulator  82.43 
 
 		 309 aa  476  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3711  LysR family transcriptional regulator  73.31 
 
 		 304 aa  424  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18200  LysR family transcriptional regulator  67.69 
 
 		 306 aa  411  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1579  putative transcriptional regulator  67.35 
 
 		 306 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24760  LysR family transcriptional regulator protein  57.68 
 
 		 319 aa  335  5.999999999999999e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2914  LysR family transcriptional regulator  54.48 
 
 		 299 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2686  LysR family transcriptional regulator  54.21 
 
 		 299 aa  324  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3067  LysR family transcriptional regulator  56.31 
 
 		 296 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.436418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5646  LysR family transcriptional regulator  55.97 
 
 		 307 aa  317  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.431821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0075  transcriptional regulator, LysR family  55.48 
 
 		 304 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0067  transcriptional regulator, LysR family  55.48 
 
 		 304 aa  315  7e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0396  LysR family transcriptional regulator  51.53 
 
 		 304 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4112  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 300 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000269133 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1435  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  53.45 
 
 		 311 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1158  LysR family transcriptional regulator  53.2 
 
 		 354 aa  300  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197117  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4027  transcriptional regulator, LysR family  51.97 
 
 		 321 aa  299  5e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.198411 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0511  LysR family transcriptional regulator  48.14 
 
 		 301 aa  296  4e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.533248  hitchhiker  0.00184272 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2720  LysR family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 296 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2952  LysR family transcriptional regulator  53.04 
 
 		 296 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.845125  decreased coverage  0.00814406 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3788  LysR family transcriptional regulator  52.84 
 
 		 310 aa  291  8e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0896823  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2076  LysR family transcriptional regulator  51.19 
 
 		 309 aa  289  4e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2431  LysR family transcriptional regulator  51.19 
 
 		 307 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.557112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3264  LysR family transcriptional regulator  51.19 
 
 		 309 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.655884 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0407  LysR family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109674 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0408  LysR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 305 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2312  LysR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 302 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2713  LysR family transcriptional regulator  49.16 
 
 		 323 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.995522  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3617  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 305 aa  281  9e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1100  LysR, substrate-binding  49.17 
 
 		 307 aa  281  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0402  LysR family transcriptional regulator  49.01 
 
 		 309 aa  278  7e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3719  LysR family transcriptional regulator  50.9 
 
 		 302 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0668479 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3218  LysR family transcriptional regulator  50.86 
 
 		 319 aa  276  4e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3435  LysR family transcriptional regulator  49.16 
 
 		 308 aa  275  8e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3956  LysR family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 309 aa  275  9e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3931  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0336  LysR family transcriptional regulator  46.86 
 
 		 307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4072  LysR family transcriptional regulator  48.97 
 
 		 308 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.320377 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3879  transcriptional regulator, LysR family  48.97 
 
 		 308 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001136  transcriptional regulator  42.95 
 
 		 307 aa  261  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06651  transcriptional regulator  42.09 
 
 		 309 aa  257  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0580  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 313 aa  251  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3977  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 323 aa  250  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2512  transcriptional regulator, LysR family protein  40.55 
 
 		 299 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2174  transcriptional regulator, LysR family  47.46 
 
 		 331 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.52777  normal  0.0251381 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01965  transcriptional regulator, LysR family protein  40.61 
 
 		 302 aa  240  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.514809  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1850  transcriptional regulator, LysR family  47.46 
 
 		 331 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0195634 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0591  LysR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 304 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0506  LysR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 305 aa  231  9e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1392  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 311 aa  230  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0421756  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3695  LysR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 303 aa  229  6e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4064  LysR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 304 aa  228  7e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0472  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0453  LysR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0735  transcriptional regulator, LysR family  46.1 
 
 		 301 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4154  LysR family transcriptional regulator  41 
 
 		 303 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1404  transcriptional regulator, LysR family protein  35.84 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416275  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3893  LysR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 320 aa  217  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3328  transcriptional regulator, LysR family  42.47 
 
 		 327 aa  215  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.125153 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0631  LysR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1440  LysR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 324 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0606  LysR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2609  LysR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 310 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.379478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2745  LysR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 310 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0413  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 341 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.179367 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0592  LysR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2720  LysR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 310 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5101  LysR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 304 aa  205  7e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2692  LysR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 325 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2080  LysR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 325 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0227  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2719  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0891  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2439  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.5931  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6020  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 310 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.691555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0726  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.995424  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2359  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0712  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 310 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.894566  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4453  LysR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0347042 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1994  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 305 aa  195  9e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0915  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  35.86 
 
 		 311 aa  192  5e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1239  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 309 aa  192  7e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3338  LysR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.691581  normal  0.62369 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0791  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2544  LysR family transcriptional regulator  42.69 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2836  LysR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 306 aa  183  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5396  LysR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 304 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  0.350527 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2488  transcriptional regulator, LysR family  35.4 
 
 		 300 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000785028 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1360  transcription regulator protein  35.96 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.508448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1300  transcriptional regulator, LysR family  35.96 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0123787  normal  0.196397 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0743  LysR family transcriptional regulator  42.69 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1234  transcriptional regulator, LysR family  35.96 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.628194 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1780  LysR family substrate binding transcriptional regulator  34.41 
 
 		 306 aa  180  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1952  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 301 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.514142 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0493  transcriptional regulator, LysR family  37.31 
 
 		 298 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0246  LysR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02329  transcription regulator protein  36.3 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0102283 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2499  LysR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.374965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  36.08 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>