More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0651 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0651  helix-turn-helix, Fis-type  100 
 
 		 99 aa  201  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0987  helix-turn-helix, Fis-type  100 
 
 		 99 aa  201  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4607  helix-turn-helix, Fis-type  100 
 
 		 99 aa  201  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0627  transposase IS3/IS911 family protein  65 
 
 		 101 aa  124  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000506319 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0758  transposase IS3/IS911 family protein  65 
 
 		 101 aa  124  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.462502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2954  transposase IS3/IS911 family protein  65 
 
 		 101 aa  124  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.214998 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1762  transposase IS3/IS911 family protein  65 
 
 		 101 aa  124  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3364  transposase IS3/IS911 family protein  65 
 
 		 101 aa  124  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1550  transposase IS3/IS911 family protein  65 
 
 		 101 aa  124  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266897  hitchhiker  0.00000139324 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2972  transposase IS3/IS911 family protein  65 
 
 		 101 aa  124  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00105094  normal  0.0448799 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4698  hypothetical protein  62.38 
 
 		 102 aa  114  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4228  hypothetical protein  62.38 
 
 		 102 aa  114  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2526  hypothetical protein  62.38 
 
 		 102 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0599274  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2389  hypothetical protein  62.38 
 
 		 102 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413636  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03290  hypothetical protein  62.38 
 
 		 102 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000165521  unclonable  4.74599e-22 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51620  transposase  62.38 
 
 		 102 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141588  hitchhiker  0.0000324729 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1853  transposase IS3/IS911  57.73 
 
 		 100 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2835  hypothetical protein  61.39 
 
 		 102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2834  transposase and inactivated derivatives  58.33 
 
 		 99 aa  111  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4419  transposase, OrfA  59.79 
 
 		 102 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000424248 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0090  hypothetical protein  56.7 
 
 		 103 aa  110  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.386278  hitchhiker  0.00000000270737 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3329  IS911, transposase orfA  55.1 
 
 		 100 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0304  IS911 transposase orfA  56.7 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122708  hitchhiker  0.00078594 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4464  IS3 family transposase orfA  56.7 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0436168  hitchhiker  0.00706078 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03524  transposase  55.67 
 
 		 115 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.329504  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03475  hypothetical protein  55.67 
 
 		 115 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.395069  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1387  transposase OrfAB, subunit A  56.7 
 
 		 114 aa  107  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0731  transposase OrfAB, subunit A  56.7 
 
 		 114 aa  107  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2360  transposase OrfAB, subunit A  56.7 
 
 		 114 aa  107  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0739  transposase OrfAB, subunit A  56.7 
 
 		 114 aa  107  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0441  transposase OrfAB, subunit A  56.7 
 
 		 114 aa  107  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6037  hypothetical protein  58.76 
 
 		 102 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4090  transposase IS3/IS911 family protein  57.45 
 
 		 101 aa  107  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0647  transposase IS3/IS911 family protein  57.45 
 
 		 101 aa  107  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3958  transposase IS3/IS911 family protein  57.45 
 
 		 101 aa  107  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.98909  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3981  transposase IS3/IS911 family protein  57.45 
 
 		 101 aa  107  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.403658  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0406  transposase IS3/IS911 family protein  57.45 
 
 		 101 aa  107  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0212224  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3970  transposase IS3/IS911 family protein  57.45 
 
 		 101 aa  107  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1695  IS911, transposase orfA  54.08 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00957844  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0068  IS911, transposase orfA  54.08 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00561335  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4755  IS911, transposase orfA  54.08 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2734  IS911, transposase orfA  54.08 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2598  IS911, transposase orfA  54.08 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1768  IS911, transposase orfA  54.08 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1667  IS911, transposase orfA  54.08 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1301  IS911, transposase orfA  54.08 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4925  IS911, transposase orfA  54.08 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3829  transposase IS3/IS911 family protein  58.06 
 
 		 102 aa  105  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000725923 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0303  IS911, transposase orfA  54.08 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00845112  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2605  IS911, transposase orfA  54.08 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1637  IS911, transposase orfA  54.08 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1561  IS911, transposase orfA  54.08 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3019  IS911, transposase orfA  54.08 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3109  IS911, transposase orfA  54.08 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1237  IS911, transposase orfA  54.08 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0696  IS911, transposase orfA  54.08 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493736  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1594  IS911, transposase orfA  54.08 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0718  IS911, transposase orfA  54.08 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.373976  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0129  IS911, transposase orfA  54.08 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0117251  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0225  IS911, transposase orfA  54.08 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2274  IS911, transposase orfA  54.08 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4079  IS911, transposase orfA  54.08 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2307  IS911, transposase orfA  54.08 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4640  IS911, transposase orfA  54.08 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.553369  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0090  IS911, transposase orfA  54.08 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2161  IS911, transposase orfA  54.08 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.03565  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1100  IS911 transposase orfA  55.67 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4469  transposase IS3/IS911 family protein  57.43 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4253  transposase IS3/IS911 family protein  55.67 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237056 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3299  IS911, transposase orfA  54.08 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1020  IS911, transposase orfA  54.08 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3234  transposase IS3/IS911 family protein  57.43 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0690  IS911, transposase orfA  54.08 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141055  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0253  IS911, transposase orfA  54.08 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.653907  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1000  transposase IS3/IS911 family protein  56.38 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374803  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1605  IS911, transposase orfA  54.08 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000357192  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1687  IS911, transposase orfA  54.08 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000176402  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4929  transposase IS3/IS911  57.43 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2514  IS911, transposase orfA  54.08 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1921  IS911, transposase orfA  54.08 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4618  IS911, transposase orfA  54.08 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.55073  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1361  IS911, transposase orfA  53.06 
 
 		 100 aa  104  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0015  IS911, transposase orfA  53.54 
 
 		 101 aa  103  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5033  IS911 transposase orfA  55.1 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1641  transposase IS3/IS911  52.69 
 
 		 102 aa  100  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.783903  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1858  transposase IS3/IS911  52.69 
 
 		 102 aa  100  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2075  transposase IS3/IS911  52.69 
 
 		 102 aa  100  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2314  transposase  54.64 
 
 		 102 aa  100  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4765  transposase OrfA  53.19 
 
 		 102 aa  99  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01676  hypothetical protein  52.08 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0439  transposase  52.08 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4658  transposase IS3/IS911 family protein  50.52 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.753244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4652  transposase IS3/IS911 family protein  50.52 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1610  transposase IS3/IS911 family protein  48.98 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2050  transposase IS3/IS911 family protein  48.98 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.575718  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3016  transposase IS3/IS911 family protein  48.98 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3144  transposase IS3/IS911 family protein  48.98 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0609516  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3616  transposase IS3/IS911 family protein  48.98 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4014  transposase IS3/IS911 family protein  48.98 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0726  transposase IS3/IS911 family protein  50.52 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>