56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0642 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_0642  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  206  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0741  hypothetical protein  97.03 
 
 
101 aa  174  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.194088  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5511  hypothetical protein  83.84 
 
 
101 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63300  hypothetical protein  81.82 
 
 
101 aa  166  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0819333  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0741  hypothetical protein  72.28 
 
 
101 aa  152  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0624  hypothetical protein  87 
 
 
101 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.006247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0618  hypothetical protein  85.15 
 
 
101 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.121105  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0632  hypothetical protein  87 
 
 
100 aa  152  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0579  hypothetical protein  85.15 
 
 
132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59137 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4585  hypothetical protein  83.17 
 
 
101 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.744837  normal  0.0527952 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07270  hypothetical protein  78.22 
 
 
101 aa  141  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.713838  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0029  hypothetical protein  48 
 
 
110 aa  94.7  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1735  hypothetical protein  51.09 
 
 
116 aa  93.6  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.303631 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1298  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  47.37 
 
 
120 aa  92.8  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1858  mannonate dehydratase  43.56 
 
 
102 aa  90.9  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.401436  normal  0.311275 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0013  hypothetical protein  44 
 
 
118 aa  90.1  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.995444  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4014  hypothetical protein  48.45 
 
 
109 aa  90.1  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0591  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  43.88 
 
 
116 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2084  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  43.75 
 
 
120 aa  89.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.311505  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0280  hypothetical protein  44.9 
 
 
131 aa  87.4  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1125  hypothetical protein  41.84 
 
 
123 aa  87  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.874938 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1078  hypothetical protein  46.32 
 
 
118 aa  86.3  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0582  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  46.32 
 
 
104 aa  85.1  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0603  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  46.32 
 
 
104 aa  85.1  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.963976 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4851  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  43.75 
 
 
117 aa  84  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.563845  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1293  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  39.18 
 
 
109 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.131741  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18560  predicted pyrophosphatase  41.58 
 
 
120 aa  79.3  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254127  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0200  hypothetical protein  41.49 
 
 
129 aa  79.7  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.190025  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0679  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  38.83 
 
 
127 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.511442  hitchhiker  0.0000132281 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2074  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  36.67 
 
 
120 aa  77  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266897  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3441  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  38.64 
 
 
110 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000605354  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4182  hypothetical protein  41.11 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3228  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  37 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.491716  normal  0.0212378 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3445  hypothetical protein  40.43 
 
 
104 aa  72.4  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2737  hypothetical protein  39 
 
 
118 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.411617  normal  0.738085 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0014  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  38.95 
 
 
126 aa  72  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00301608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0928  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  37.76 
 
 
110 aa  72  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.0000193078  unclonable  0.00000000000231926 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1669  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  36.73 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3518  hypothetical protein  35.23 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000729179  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3800  hypothetical protein  35.23 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000403313  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1343  hypothetical protein  37.62 
 
 
112 aa  70.5  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1237  hypothetical protein  35.71 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0553  putative pyrophosphatase  31.31 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4465  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  34.69 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7171  hypothetical protein  34.69 
 
 
123 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2453  hypothetical protein  41.1 
 
 
118 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1513  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  26.73 
 
 
99 aa  63.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1530  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  36 
 
 
123 aa  61.6  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19640  predicted pyrophosphatase  33.71 
 
 
106 aa  57.8  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2385  hypothetical protein  31.68 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0167763  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1357  hypothetical protein  30 
 
 
118 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0253  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  34 
 
 
123 aa  54.3  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2244  hypothetical protein  31.31 
 
 
105 aa  54.3  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000059482  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0041  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  32.04 
 
 
102 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  33.67 
 
 
265 aa  47.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2161  putative cytoplasmic protein  40.62 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>