195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0638 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  100 
 
 
196 aa  390  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  92.86 
 
 
196 aa  363  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  76.02 
 
 
196 aa  306  9e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4867  peptidase S16 lon domain-containing protein  67.35 
 
 
196 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39375  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  63.92 
 
 
197 aa  246  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  64.95 
 
 
197 aa  245  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  66.84 
 
 
196 aa  241  6e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4689  peptidase S16, lon domain-containing protein  65.82 
 
 
196 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4814  ATP-dependent protease La  65.82 
 
 
197 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344958  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3807  peptidase S16, lon domain-containing protein  64.77 
 
 
194 aa  231  6e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  54.92 
 
 
196 aa  213  2e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  43.52 
 
 
200 aa  143  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  44.44 
 
 
190 aa  140  1e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.84 
 
 
193 aa  138  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  43.92 
 
 
196 aa  136  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  9.89941e-11 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3300  peptidase S16 lon domain protein  38.42 
 
 
192 aa  116  2e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02586  ATP-dependent protease La (LON) domain subfamily  38.02 
 
 
194 aa  115  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.42 
 
 
191 aa  114  9e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  39 
 
 
223 aa  113  2e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0066  peptidase S16, lon N-terminal  36.65 
 
 
210 aa  112  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.394074  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  33.98 
 
 
230 aa  110  1e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0361  peptidase S16 lon domain protein  38.22 
 
 
202 aa  110  2e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3619  peptidase S16, lon-like  35.89 
 
 
229 aa  109  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3243  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.65 
 
 
215 aa  106  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2596  peptidase S16 lon domain protein  35.15 
 
 
215 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  35.71 
 
 
207 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1650  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.67 
 
 
214 aa  100  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3049  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.49 
 
 
234 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  46.43 
 
 
196 aa  99.4  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1211  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.85 
 
 
222 aa  97.8  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0186807 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3491  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.85 
 
 
209 aa  96.7  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.06385e-06 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.12 
 
 
211 aa  96.7  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  33.99 
 
 
210 aa  96.3  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  34.3 
 
 
210 aa  96.3  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  33.33 
 
 
211 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.47 
 
 
211 aa  95.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.47 
 
 
211 aa  95.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  35.47 
 
 
211 aa  95.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5247  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.33 
 
 
224 aa  94.7  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  36.45 
 
 
211 aa  94.7  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.47 
 
 
211 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.47 
 
 
211 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  33.82 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  33.82 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  33.82 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  33.82 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  33.82 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  33.82 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  33.82 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1979  peptidase S16 lon domain protein  37.31 
 
 
185 aa  92  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.537677  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2345  ATP-dependent protease La domain protein  37.31 
 
 
185 aa  92  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4864  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.82 
 
 
209 aa  90.9  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.32 
 
 
233 aa  88.6  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  35.61 
 
 
217 aa  88.2  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0525  peptidase S16  31.35 
 
 
194 aa  86.7  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198265  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  30.96 
 
 
220 aa  85.5  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.33 
 
 
213 aa  85.5  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0257  peptidase S16 lon domain protein  31.28 
 
 
217 aa  85.1  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575451  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0321  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.66 
 
 
211 aa  84  1e-15  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0284  peptidase S16 lon domain protein  30.93 
 
 
217 aa  84  1e-15  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  39.5 
 
 
222 aa  83.2  2e-15  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  32.12 
 
 
213 aa  82.4  4e-15  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1639  peptidase S16, lon-like protein  42.48 
 
 
111 aa  82.4  4e-15  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.194614  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.94 
 
 
232 aa  80.9  1e-14  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1892  hypothetical protein  34.78 
 
 
193 aa  78.2  7e-14  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1331  peptidase S16, lon-like  27.51 
 
 
188 aa  77.8  9e-14  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178729  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03286  hypothetical protein  40.87 
 
 
198 aa  77.4  1e-13  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0402  hypothetical protein  30.1 
 
 
216 aa  77.4  1e-13  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  39.67 
 
 
226 aa  77.8  1e-13  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.26 
 
 
224 aa  76.6  2e-13  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2274  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.78 
 
 
183 aa  76.6  2e-13  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1149  peptidase S16, lon N-terminal  32.86 
 
 
225 aa  75.5  5e-13  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.55 
 
 
233 aa  74.7  7e-13  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002698  hypothetical protein  41.67 
 
 
198 aa  74.3  1e-12  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268731  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1487  peptidase S16, lon-like protein  37.39 
 
 
203 aa  73.2  2e-12  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3340  peptidase S16 lon domain protein  33.66 
 
 
225 aa  73.2  2e-12  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000299764  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1750  peptidase S16 lon domain protein  34.78 
 
 
183 aa  72.8  3e-12  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.588781  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  35.38 
 
 
220 aa  72.8  3e-12  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2710  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.06 
 
 
183 aa  72.4  4e-12  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586726  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2596  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.06 
 
 
183 aa  72.4  4e-12  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139162  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2635  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.33 
 
 
183 aa  72  6e-12  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.963975  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0885  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.64 
 
 
232 aa  71.6  6e-12  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  hitchhiker  0.0012634 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2321  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.62 
 
 
183 aa  71.2  8e-12  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.504487  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  43.56 
 
 
226 aa  71.2  1e-11  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2346  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.61 
 
 
185 aa  70.5  2e-11  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824022  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2464  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.88 
 
 
185 aa  69.7  3e-11  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1987  ATP-dependent protease La  31.62 
 
 
183 aa  68.9  4e-11  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0478  peptidase S16, lon-like  38.66 
 
 
212 aa  68.2  8e-11  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.06422  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0737  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.58 
 
 
210 aa  67.8  1e-10  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3243  peptidase S16 lon domain protein  41.67 
 
 
265 aa  67.4  1e-10  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.2 
 
 
221 aa  66.2  3e-10  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2956  peptidase S16 lon domain protein  28.78 
 
 
200 aa  65.9  4e-10  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.087431  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  40.4 
 
 
221 aa  65.1  7e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  33.5 
 
 
241 aa  64.7  8e-10  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3194  peptidase S16 lon domain protein  30.74 
 
 
258 aa  64.7  9e-10  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  29.03 
 
 
218 aa  63.9  1e-09  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1432  peptidase S16, lon-like  37.84 
 
 
224 aa  64.3  1e-09  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103336  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2169  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.73 
 
 
218 aa  64.3  1e-09  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.830411  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2954  peptidase S16, lon-like protein  38.89 
 
 
217 aa  63.2  2e-09  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  38.71 
 
 
212 aa  63.2  3e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>