42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0555 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_0555  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  461  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4959  lipoprotein, putative  96.1 
 
 
231 aa  444  1e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4911  hypothetical protein  72.15 
 
 
251 aa  334  7e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4787  hypothetical protein  71.73 
 
 
251 aa  330  8e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0504  hypothetical protein  67.76 
 
 
237 aa  321  5e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0320775  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4703  hypothetical protein  69.07 
 
 
236 aa  318  6e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0763396  normal  0.775889 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4964  hypothetical protein  71.5 
 
 
214 aa  311  4e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340246  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0600  hypothetical protein  57.44 
 
 
241 aa  247  9e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65590  hypothetical protein  50 
 
 
236 aa  228  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5692  hypothetical protein  49.58 
 
 
236 aa  227  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43450  hypothetical protein  53.28 
 
 
242 aa  221  9e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140988  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0327  protein of unknown function DUF330  27.93 
 
 
204 aa  70.9  2e-11  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  32.73 
 
 
197 aa  70.5  2e-11  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  28.57 
 
 
201 aa  67.8  2e-10  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  29.19 
 
 
198 aa  67  2e-10  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  31.65 
 
 
204 aa  58.2  1e-07  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  30.06 
 
 
203 aa  57.8  2e-07  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  28.11 
 
 
212 aa  56.6  3e-07  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1959  hypothetical protein  26.95 
 
 
199 aa  55.8  5e-07  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000996139  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0256  hypothetical protein  25.68 
 
 
205 aa  55.5  7e-07  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  28.79 
 
 
195 aa  52.8  4e-06  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0231  hypothetical protein  20.21 
 
 
241 aa  51.6  1e-05  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2579  hypothetical protein  29.35 
 
 
191 aa  51.2  1e-05  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.621383 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  26.89 
 
 
211 aa  50.4  2e-05  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  25.49 
 
 
197 aa  50.8  2e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.2506e-07 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  27.78 
 
 
201 aa  48.9  6e-05  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  27.69 
 
 
208 aa  49.3  6e-05  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0230  hypothetical protein  21.47 
 
 
241 aa  48.9  6e-05  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  29.79 
 
 
200 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  26.57 
 
 
192 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  27.34 
 
 
188 aa  47  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  27.74 
 
 
201 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02852  hypothetical protein  25.41 
 
 
189 aa  45.8  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1921  hypothetical protein  28.76 
 
 
199 aa  45.4  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1866  hypothetical protein  29.03 
 
 
197 aa  45.1  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2112  hypothetical protein  29.03 
 
 
197 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.178277  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003027  putative lipoprotein  22.52 
 
 
192 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  24.6 
 
 
196 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1569  hypothetical protein  25.78 
 
 
209 aa  42.4  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.849012  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  27.62 
 
 
196 aa  42.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  28.28 
 
 
199 aa  42.4  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3377  hypothetical protein  29.7 
 
 
201 aa  42  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.237475  normal  0.194903 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>