More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0464 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0464  putative aldolase  100 
 
 		 212 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5062  class II aldolase/adducin domain protein  97.64 
 
 		 212 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5929  putative aldolase  75.71 
 
 		 220 aa  328  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2170  putative aldolase  75.24 
 
 		 220 aa  327  7e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842805  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4425  putative aldolase  75.6 
 
 		 218 aa  327  9e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1837  putative aldolase  74.53 
 
 		 212 aa  323  9e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0769134  normal  0.0677306 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3734  putative aldolase  73.81 
 
 		 214 aa  322  3e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1425  putative aldolase  72.35 
 
 		 217 aa  321  5e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3411  putative aldolase  72.73 
 
 		 214 aa  316  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5075  putative aldolase  72.64 
 
 		 212 aa  315  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0476  putative aldolase  73.11 
 
 		 212 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3498  putative aldolase  71.23 
 
 		 213 aa  304  5.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392898  normal  0.194137 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0975  putative aldolase  73.68 
 
 		 213 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5122  putative aldolase  73.11 
 
 		 212 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3210  putative aldolase  73.11 
 
 		 212 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4552  putative aldolase  72.64 
 
 		 213 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.211976 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5157  putative aldolase  73.11 
 
 		 212 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2015  putative aldolase  73.68 
 
 		 213 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435503  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0575  putative aldolase  73.21 
 
 		 213 aa  298  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0440  putative aldolase  73.21 
 
 		 213 aa  298  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0892  putative aldolase  73.21 
 
 		 213 aa  298  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1922  putative aldolase  73.21 
 
 		 213 aa  298  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1859  putative aldolase  73.21 
 
 		 213 aa  298  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2814  putative aldolase  65.57 
 
 		 212 aa  287  7e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216378 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5143  putative aldolase  53.81 
 
 		 222 aa  228  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0444  putative aldolase  51.77 
 
 		 224 aa  218  7e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4877  putative aldolase  51.33 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3180  putative aldolase  47.17 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1137  putative aldolase  47.14 
 
 		 226 aa  187  9e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1632  putative aldolase  45.19 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4650  putative aldolase  46.41 
 
 		 221 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.590566  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2434  putative aldolase  48.72 
 
 		 211 aa  184  6e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  47.78 
 
 		 222 aa  184  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5014  putative aldolase  47.55 
 
 		 224 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0583347  normal  0.341145 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  45.93 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2628  putative aldolase  45.93 
 
 		 218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1030  putative aldolase  44.98 
 
 		 228 aa  181  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1853  putative aldolase  45.45 
 
 		 220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2082  putative aldolase  44.98 
 
 		 220 aa  178  5.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1553  putative aldolase  43.46 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal  0.465696 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2896  putative aldolase  43.96 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811936 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0116  putative aldolase  41.87 
 
 		 218 aa  169  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0144  putative aldolase  42.11 
 
 		 210 aa  168  6e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.349251  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02588  hypothetical protein  42.65 
 
 		 212 aa  167  7e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0950  class II aldolase/adducin family protein  42.65 
 
 		 212 aa  167  7e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0110  putative aldolase  43.01 
 
 		 218 aa  168  7e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02553  hypothetical protein  42.65 
 
 		 212 aa  167  7e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3035  putative aldolase  42.65 
 
 		 212 aa  167  7e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3136  putative aldolase  42.65 
 
 		 212 aa  167  7e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0974  putative aldolase  42.65 
 
 		 212 aa  167  7e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.776053  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2876  putative aldolase  42.65 
 
 		 212 aa  167  7e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0129  putative aldolase  41.63 
 
 		 224 aa  165  5.9999999999999996e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  40.41 
 
 		 210 aa  164  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  38.28 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1490  putative aldolase  41.75 
 
 		 210 aa  162  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  38.28 
 
 		 231 aa  162  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3382  class II aldolase/adducin family protein  43.72 
 
 		 217 aa  159  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  40.1 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  36.71 
 
 		 215 aa  154  7e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3066  putative aldolase  42.71 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.494057 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3225  putative aldolase  42.71 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3121  putative aldolase  42.71 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0531321 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3037  putative aldolase  42.71 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3105  putative aldolase  42.19 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2485  class II aldolase/adducin family protein  41.84 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1445  class II aldolase/adducin family protein  40.58 
 
 		 208 aa  148  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2023  class II aldolase/adducin family protein  40.58 
 
 		 208 aa  148  6e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0841682  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  39.56 
 
 		 210 aa  145  5e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2331  class II aldolase/adducin family protein  37.56 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3143  putative aldolase  41.04 
 
 		 209 aa  135  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1553  class II aldolase/adducin family protein  36.65 
 
 		 204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3731  class II aldolase/adducin family protein  36.26 
 
 		 220 aa  115  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  30.52 
 
 		 265 aa  105  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  31.46 
 
 		 214 aa  103  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  28.24 
 
 		 264 aa  102  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  33.8 
 
 		 225 aa  101  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  29.91 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  31.05 
 
 		 303 aa  100  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0503  class II aldolase/adducin family protein  33.9 
 
 		 181 aa  99.8  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2465  class II aldolase/adducin family protein  33.51 
 
 		 215 aa  98.2  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1298  class II aldolase/adducin family protein  32.22 
 
 		 398 aa  97.4  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4596  Fis family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 225 aa  95.1  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  33.98 
 
 		 217 aa  95.1  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1110  L-fuculose phosphate aldolase, putative  31.88 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  33.82 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4769  class II aldolase/adducin family protein  31.68 
 
 		 227 aa  92.8  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0434  class II aldolase/adducin family protein  32.78 
 
 		 180 aa  92  5e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1829  class II aldolase/adducin family protein  31.61 
 
 		 271 aa  92  6e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00738652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  31.71 
 
 		 222 aa  90.5  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1224  class II aldolase/adducin family protein  32.28 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.190003 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2810  class II aldolase/adducin family protein  37.28 
 
 		 332 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0403  class II aldolase/adducin family protein  31.46 
 
 		 181 aa  89.4  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.631542  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2461  class II aldolase/adducin-like protein  46.23 
 
 		 297 aa  88.6  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0319  class II aldolase/adducin-like protein  29.57 
 
 		 214 aa  88.6  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.294023  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1486  class II aldolase/adducin family protein  32.58 
 
 		 190 aa  88.2  8e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0198  class II aldolase/adducin family protein  31.07 
 
 		 180 aa  87.8  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0602846  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2472  class II aldolase/adducin family protein  34.09 
 
 		 324 aa  87  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.480175  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0695  class II aldolase/adducin family protein  30 
 
 		 428 aa  87  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  29.95 
 
 		 207 aa  86.7  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1451  L-fuculose phosphate aldolase  30.21 
 
 		 215 aa  84.7  9e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>