14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0418 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0418  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5114  hypothetical protein  82.63 
 
 		 214 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3669  hypothetical protein  49.06 
 
 		 215 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0775009  normal  0.157085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0379  hypothetical protein  42.46 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3726  hypothetical protein  28.7 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4120  hypothetical protein  30.94 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0741  hypothetical protein  27.17 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0005  hypothetical protein  30.41 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3356  hypothetical protein  28.65 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2490  hypothetical protein  25.11 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000626304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1461  hypothetical protein  28.65 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.57906  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1848  hypothetical protein  30.71 
 
 		 150 aa  50.1  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0200  hypothetical protein  26.28 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.162545 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0031  hypothetical protein  26.97 
 
 		 240 aa  42.4  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>