128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0400 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  100 
 
 		 267 aa  534  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  78.46 
 
 		 247 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  67.31 
 
 		 260 aa  359  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  61.98 
 
 		 266 aa  324  8.000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  60.84 
 
 		 273 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  60.69 
 
 		 273 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  57.79 
 
 		 273 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  57.77 
 
 		 255 aa  292  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  57.54 
 
 		 255 aa  290  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  57.54 
 
 		 255 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  37.82 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  32.69 
 
 		 278 aa  142  4e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  37.38 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2838  nuclease  30.23 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  29.27 
 
 		 286 aa  92  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  35.21 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  27.24 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0124  nuclease (SNase-like)  23.9 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00271835  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  30.48 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  31.03 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3775  nuclease  26.2 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.770263  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  34.23 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1691  nuclease  30.33 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880921 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  35.62 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  37.12 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  37.2 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  34.04 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  34.88 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  34.88 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  38.85 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  31.5 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  34.09 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  33.58 
 
 		 228 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  29.44 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  30.84 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  25.99 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  28.93 
 
 		 166 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  31.43 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  32.37 
 
 		 372 aa  60.1  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  26.63 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1371  nuclease  34.38 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.490456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  34.55 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00761  hypothetical protein  31.45 
 
 		 155 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.489486 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  29.61 
 
 		 231 aa  58.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0889  nuclease  27.61 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000805707  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0453  nuclease  28.96 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.686842 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  32.62 
 
 		 187 aa  57  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02380  micrococcal nuclease-like nuclease  32.28 
 
 		 408 aa  57  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  29.38 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0509  nuclease (SNase-like)  28.57 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.58824  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3707  nuclease (SNase domain protein)  31.29 
 
 		 171 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.112464  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  31.46 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0487  nuclease (SNase domain protein)  28.87 
 
 		 262 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3653  nuclease (SNase domain protein)  31.29 
 
 		 171 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  29.58 
 
 		 186 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  24.72 
 
 		 157 aa  54.3  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  29.94 
 
 		 171 aa  53.9  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  28.57 
 
 		 184 aa  54.7  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  25.31 
 
 		 171 aa  53.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  33.66 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  30.77 
 
 		 169 aa  53.5  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0551  nuclease (SNase-like)  30.33 
 
 		 258 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  33.13 
 
 		 185 aa  52.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  34.55 
 
 		 382 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  31 
 
 		 350 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  30.46 
 
 		 346 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0454  nuclease (SNase domain protein)  29.46 
 
 		 192 aa  51.2  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  29.29 
 
 		 214 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  26.03 
 
 		 192 aa  50.1  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf871  nuclease, lipoprotein  25.81 
 
 		 234 aa  50.1  0.00004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  26.38 
 
 		 185 aa  49.7  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  28.85 
 
 		 374 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  36.43 
 
 		 136 aa  49.7  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02740  micrococcal nuclease-like nuclease  29.63 
 
 		 259 aa  49.7  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  28.57 
 
 		 187 aa  49.3  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  26.72 
 
 		 156 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0557  nuclease (SNase-like)  37.93 
 
 		 143 aa  48.9  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.364333  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  36.17 
 
 		 240 aa  49.3  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0030  thermonuclease family protein  25.56 
 
 		 214 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0694892  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0276  nuclease (SNase-like)  25.62 
 
 		 264 aa  48.9  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  30.34 
 
 		 388 aa  48.5  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1467  Excalibur domain-containing protein  29.63 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  26.28 
 
 		 249 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  38.89 
 
 		 323 aa  47.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  26.92 
 
 		 232 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  30.66 
 
 		 148 aa  48.1  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1176  nuclease  32.26 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  29.29 
 
 		 214 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1722  nuclease (SNase domain protein)  29.7 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1250  nuclease (SNase-like)  37.76 
 
 		 124 aa  47.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0612  hypothetical protein  26.11 
 
 		 176 aa  47  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  29.29 
 
 		 214 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9251  predicted protein  27.56 
 
 		 164 aa  47  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  27.98 
 
 		 180 aa  46.6  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  27.06 
 
 		 187 aa  46.6  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  27.63 
 
 		 534 aa  46.6  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  29.25 
 
 		 166 aa  46.2  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  39.25 
 
 		 324 aa  46.2  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0274  Excalibur domain protein  33.33 
 
 		 443 aa  45.4  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>