More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0348 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  431  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  90.82 
 
 		 207 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  78.74 
 
 		 209 aa  349  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  75.36 
 
 		 208 aa  333  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  73.17 
 
 		 218 aa  319  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  70.71 
 
 		 207 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  67.82 
 
 		 211 aa  297  7e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  69.31 
 
 		 208 aa  296  1e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  65.7 
 
 		 213 aa  295  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  65.87 
 
 		 208 aa  287  7e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  66.18 
 
 		 208 aa  286  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0572  methyltransferase type 11  58.38 
 
 		 210 aa  258  5.0000000000000005e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  53.47 
 
 		 208 aa  216  2.9999999999999998e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  30.26 
 
 		 196 aa  94.7  8e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  35.18 
 
 		 1287 aa  89.7  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  34.16 
 
 		 202 aa  88.2  8e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  27.55 
 
 		 364 aa  79.3  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  30.87 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  31.53 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  31.94 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  32.28 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  32.28 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  39.62 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  28.19 
 
 		 192 aa  72  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  34.57 
 
 		 203 aa  72  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  28.12 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  29.8 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  30.57 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  35.07 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  29.73 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  36.05 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  29.89 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  25.79 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  32.34 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  36.36 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  35.07 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0183  methyltransferase type 11  29.76 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0947468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  29.05 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  36.24 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2555  methyltransferase type 12  29.73 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0699179  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  29.14 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5435  Methyltransferase type 12  29.44 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0879885  hitchhiker  0.0072084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  29.9 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  24.43 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54050  hypothetical protein  29.73 
 
 		 221 aa  62  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 220 aa  62  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0864  methyltransferase type 12  28.87 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000143474  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3361  methyltransferase type 12  29.19 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313906  normal  0.784273 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3445  Methyltransferase type 11  31.09 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  28.79 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2169  hypothetical protein  28.11 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.73 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  32.58 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3160  methyltransferase type 12  28.49 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  0.0993246 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  28.64 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  24.08 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  34.19 
 
 		 303 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  26.15 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1721  Methyltransferase type 12  27.12 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000160081 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2488  methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_004310  BR1131  hypothetical protein  30.25 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  29.55 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  29.55 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  29.55 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  29.55 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  29.55 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1170  methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0322636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  29.55 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  27.16 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  27.16 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0361  Methyltransferase type 12  27.95 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  34.01 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1089  hypothetical protein  30.28 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  31.16 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.64 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  29.79 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1254  methyltransferase type 12  32.34 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.452774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1564  conserved hypothetical protein, possible methyltransferase  25.89 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  29.45 
 
 		 390 aa  55.1  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 348 aa  55.1  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 353 aa  55.1  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2699  methyltransferase type 12  27.41 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  29.45 
 
 		 353 aa  55.1  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4088  Methyltransferase type 11  28.74 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  33.85 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2281  Methyltransferase type 11  29.65 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5472  hypothetical protein  26.71 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  35.09 
 
 		 253 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  28.68 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 253 aa  53.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  28.42 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 270 aa  53.9  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  30.38 
 
 		 551 aa  53.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2117  Methyltransferase type 11  27.85 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>