More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0305 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02166  sn-glycerol-3-phosphate transporter  72.13 
 
 		 452 aa  682    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2537  sn-glycerol-3-phosphate transporter  72.13 
 
 		 452 aa  682    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02125  hypothetical protein  72.13 
 
 		 452 aa  682    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0225  sn-glycerol-3-phosphate transporter  73.09 
 
 		 450 aa  641    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5978  sn-glycerol-3-phosphate transporter  82.96 
 
 		 448 aa  750    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4149  sn-glycerol-3-phosphate transporter  71.3 
 
 		 449 aa  647    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000087639  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1419  glycerol-3-phosphate transporter  72.13 
 
 		 452 aa  682    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1411  sn-glycerol-3-phosphate transporter  72.13 
 
 		 452 aa  682    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.476503 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5238  glycerol-3-phosphate transporter  99.33 
 
 		 449 aa  904    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0305  sn-glycerol-3-phosphate transporter  100 
 
 		 449 aa  912    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2468  sn-glycerol-3-phosphate transporter  70.67 
 
 		 452 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0862405 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2419  sn-glycerol-3-phosphate transporter  70.67 
 
 		 452 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5451  sn-glycerol-3-phosphate transporter  92.15 
 
 		 449 aa  818    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00923139 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2523  sn-glycerol-3-phosphate transporter  70.67 
 
 		 452 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2627  sn-glycerol-3-phosphate transporter  70.67 
 
 		 452 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.588856 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2622  sn-glycerol-3-phosphate transporter  72.13 
 
 		 452 aa  682    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0199  sn-glycerol-3-phosphate transporter  71.11 
 
 		 451 aa  657    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.140488  normal  0.0295712 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2380  sn-glycerol-3-phosphate transporter  72.13 
 
 		 452 aa  682    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3298  sn-glycerol-3-phosphate transporter  70.22 
 
 		 457 aa  652    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0199  sn-glycerol-3-phosphate transporter  70.43 
 
 		 449 aa  659    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000543007  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3377  sn-glycerol-3-phosphate transporter  71.69 
 
 		 452 aa  679    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3268  sn-glycerol-3-phosphate transporter  81 
 
 		 446 aa  749    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69130  sn-glycerol-3-phosphate transporter  82.55 
 
 		 448 aa  751    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2392  sn-glycerol-3-phosphate transporter  71.69 
 
 		 452 aa  679    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0247  sn-glycerol-3-phosphate transporter  70.65 
 
 		 450 aa  661    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0274937  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03311  sn-glycerol-3-phosphate transporter  71.84 
 
 		 455 aa  653    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2511  sn-glycerol-3-phosphate transporter  70.67 
 
 		 452 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1713  sn-glycerol-3-phosphate transporter  71.05 
 
 		 483 aa  677    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3958  sn-glycerol-3-phosphate transporter  72.21 
 
 		 449 aa  672    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00220837  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002677  glycerol-3-phosphate transporter  72.13 
 
 		 454 aa  649    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2804  sn-glycerol-3-phosphate transporter  72.85 
 
 		 450 aa  654    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.42488  normal  0.676266 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0001  sn-glycerol-3-phosphate transporter  74.54 
 
 		 452 aa  665    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000530916  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4646  glycerol-3-phosphate transporter  65.38 
 
 		 449 aa  588  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000791973  unclonable  8.6547e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0628  glycerol-3-phosphate transporter  65.01 
 
 		 449 aa  587  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000215527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0572  glycerol-3-phosphate transporter  64.79 
 
 		 449 aa  586  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00224555  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0661  glycerol-3-phosphate transporter  65.01 
 
 		 449 aa  587  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00772133  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0729  glycerol-3-phosphate transporter  65.29 
 
 		 449 aa  581  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.221122  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0571  glycerol-3-phosphate transporter  65.52 
 
 		 449 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00198632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0790  glycerol-3-phosphate transporter  65.52 
 
 		 449 aa  581  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000864698  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0692  glycerol-3-phosphate transporter  64.48 
 
 		 449 aa  581  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0718  glycerol-3-phosphate transporter  64.56 
 
 		 449 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000170433 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0575  glycerol-3-phosphate transporter  64.98 
 
 		 449 aa  579  1e-164  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0424748  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2870  glycerol-3-phosphate transporter  62.24 
 
 		 445 aa  580  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0556  glycerol-3-phosphate transporter  62.44 
 
 		 449 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000367094  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2060  glycerol-3-phosphate transporter  60.87 
 
 		 452 aa  542  1e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0385  glycerol-3-phosphate transporter  59.22 
 
 		 452 aa  525  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000112087  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0395  glycerol-3-phosphate transporter  59.22 
 
 		 452 aa  525  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0536129  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0577  glycerol-3-phosphate transporter  57.5 
 
 		 448 aa  526  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0511  glycerol 3-phosphate transporter  53.81 
 
 		 481 aa  518  1e-146  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000061877  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0222  glycerol-3-phosphate transporter  46.82 
 
 		 445 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.493626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0222  glycerol-3-phosphate transporter  46.82 
 
 		 445 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5349  phosphoglycerate transporter family protein  43.79 
 
 		 444 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5375  phosphoglycerate transporter family protein  44.24 
 
 		 444 aa  378  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5109  phosphoglycerate transporter family protein  43.79 
 
 		 444 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4940  glycerol-3-phosphate transporter  44.07 
 
 		 444 aa  375  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4955  glycerol-3-phosphate transporter  43.85 
 
 		 444 aa  376  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5500  phosphoglycerate transporter family protein  43.79 
 
 		 444 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5429  phosphoglycerate transporter family protein  44.24 
 
 		 444 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5051  phosphoglycerate transporter  44.14 
 
 		 444 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5381  phosphoglycerate transporter family protein  43.34 
 
 		 444 aa  372  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3790  phosphoglycerate transporter  44.6 
 
 		 446 aa  374  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5573  phosphoglycerate transporter family protein  43.12 
 
 		 444 aa  371  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1436  glycerol-3-phosphate transporter, putative  38.48 
 
 		 457 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000217705  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000089  hexose phosphate uptake regulatory protein UhpC  36.59 
 
 		 446 aa  303  4.0000000000000003e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2653  phosphoglycerate transport: transporter  36.74 
 
 		 463 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132768 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2629  phosphoglycerate transport: transporter  36.74 
 
 		 463 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2540  phosphoglycerate transport: transporter  36.32 
 
 		 463 aa  302  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2588  phosphoglycerate transport: transporter  36.32 
 
 		 463 aa  302  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2759  phosphoglycerate transporter  36.32 
 
 		 463 aa  302  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0831  GlpT/PgpT/UhpT family protein  40.18 
 
 		 456 aa  292  9e-78  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.571145  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0134  regulatory protein UhpC  34.76 
 
 		 443 aa  275  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4252  regulatory protein UhpC  35.96 
 
 		 439 aa  273  6e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5097  regulatory protein UhpC  35.96 
 
 		 439 aa  273  7e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.113676 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4032  regulatory protein UhpC  35.96 
 
 		 439 aa  272  8.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.47751 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0032  regulatory protein UhpC  35.96 
 
 		 439 aa  272  9e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03551  membrane protein regulates uhpT expression  35.96 
 
 		 439 aa  272  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0036  phosphoglycerate transporter  35.96 
 
 		 439 aa  272  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03493  hypothetical protein  35.96 
 
 		 439 aa  272  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3880  regulatory protein UhpC  35.96 
 
 		 439 aa  272  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2623  hypothetical protein  37.53 
 
 		 455 aa  270  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2474  hypothetical protein  37.53 
 
 		 455 aa  270  5e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4175  regulatory protein UhpC  35.73 
 
 		 439 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4130  regulatory protein UhpC  35.76 
 
 		 453 aa  267  2.9999999999999995e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.543128  normal  0.246836 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0083  regulatory protein UhpC  35.54 
 
 		 443 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.644662  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4078  regulatory protein UhpC  35.54 
 
 		 443 aa  265  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4177  regulatory protein UhpC  35.36 
 
 		 442 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3998  regulatory protein UhpC  35.36 
 
 		 442 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0029  regulatory protein UhpC  34.55 
 
 		 442 aa  254  3e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4014  regulatory protein UhpC  35.14 
 
 		 442 aa  253  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4119  regulatory protein UhpC  35.35 
 
 		 442 aa  252  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3502  regulatory protein UhpC  35.25 
 
 		 447 aa  250  3e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4069  regulatory protein UhpC  34.44 
 
 		 442 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1367  major facilitator superfamily MFS_1  32.27 
 
 		 446 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1773  major facilitator superfamily MFS_1  31.53 
 
 		 441 aa  243  6e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0624  regulatory protein UhpC  33.33 
 
 		 436 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0640  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 480 aa  225  1e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0187826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2433  regulatory protein UhpC  33.89 
 
 		 440 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.186527 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2344  regulatory protein UhpC  34.12 
 
 		 440 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.209168  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2547  regulatory protein UhpC  33.89 
 
 		 440 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0466951 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1684  major facilitator superfamily MFS_1  32.96 
 
 		 422 aa  225  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.597788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>