More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0299 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0299  transcriptional regulator GntR  100 
 
 		 234 aa  471  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5244  transcriptional regulator, GntR family  96.58 
 
 		 234 aa  457  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0307  GntR family transcriptional regulator  74.22 
 
 		 234 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5458  GntR family transcriptional regulator  74.36 
 
 		 235 aa  325  5e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1915  GntR domain-containing protein  71.75 
 
 		 227 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.249377 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3389  GntR domain protein  43.97 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422325  hitchhiker  0.000247854 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2597  GntR domain-containing protein  43.97 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130942 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0567  GntR family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 234 aa  185  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.837361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0566  GntR domain-containing protein  43.78 
 
 		 239 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821673  normal  0.241322 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0540  GntR domain-containing protein  43.78 
 
 		 239 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0230635  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3731  GntR family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 230 aa  177  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.069841  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3461  GntR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 230 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.488404  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2462  GntR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1202  GntR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3424  GntR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.332431  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3324  GntR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3459  GntR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1242  GntR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0381  GntR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2741  GntR domain-containing protein  43.53 
 
 		 240 aa  175  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0412292  normal  0.462713 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0645  GntR domain-containing protein  43.1 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0612  GntR domain-containing protein  43.1 
 
 		 240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.151617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0162  GntR-like  43.1 
 
 		 291 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.496913  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5075  GntR domain-containing protein  40.54 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.0518495 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2978  GntR domain-containing protein  34.82 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0212  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2102  transcription regulator protein  32.02 
 
 		 254 aa  102  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  30.26 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4879  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 234 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 233 aa  98.6  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1885  GntR domain-containing protein  32.58 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.219739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3484  GntR domain-containing protein  33.03 
 
 		 232 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0607093  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2254  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 232 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.385472  normal  0.0729055 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1728  GntR domain-containing protein  31.51 
 
 		 234 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.177351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  37.33 
 
 		 255 aa  93.2  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  31.34 
 
 		 233 aa  92.8  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01470  putative transcriptional regulator  35.85 
 
 		 228 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.763826 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0195  putative transcriptional regulator  35.38 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.361489  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0011  GntR domain protein  32.62 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0016  GntR domain protein  32.62 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0231  GntR domain-containing protein  33.19 
 
 		 268 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  29.91 
 
 		 245 aa  86.3  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  33.95 
 
 		 253 aa  85.9  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  32.14 
 
 		 230 aa  85.1  8e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6461  GntR domain protein  29.09 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0712738  hitchhiker  0.00000516822 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3963  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  36.02 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  29.11 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  33.65 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  30.41 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  29.22 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3974  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1229  GntR domain-containing protein  34.8 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1255  GntR domain-containing protein  34.8 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5470  GntR domain protein  35.02 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  32.35 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0699  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0035  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.840145  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  30.73 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 265 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  29.95 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  27.15 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  32.59 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3756  GntR domain protein  34.4 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  29.02 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  32.02 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  30.29 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  30.29 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0637  GntR domain-containing protein  33.2 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.21 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  32.56 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5153  GntR domain-containing protein  32.08 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25689  normal  0.577182 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3744  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.25 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2307  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  28.95 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.672341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1666  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5756  GntR domain protein  33.18 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  30.63 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  27.4 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.95 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6102  GntR domain-containing protein  32.27 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5660  transcriptional regulator GntR family  30.48 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 244 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  29.09 
 
 		 250 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 252 aa  75.1  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3384  transcriptional regulator PdhR  29.33 
 
 		 250 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2019  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.25 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 236 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5531  putative GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>