15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0163 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_0163  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00127626  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0243  hypothetical protein  69.79 
 
 
273 aa  313  1e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04900  hypothetical protein  52.8 
 
 
253 aa  177  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.475005  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0389  hypothetical protein  45.73 
 
 
247 aa  153  3e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4029  hypothetical protein  45.88 
 
 
272 aa  149  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1351  hypothetical protein  40.96 
 
 
268 aa  146  2e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0891  hypothetical protein  42.46 
 
 
264 aa  144  8e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.643944 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0594  hypothetical protein  45.58 
 
 
267 aa  140  2e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.464549  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3985  hypothetical protein  47.92 
 
 
253 aa  138  7e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3986  hypothetical protein  39.45 
 
 
254 aa  137  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3984  hypothetical protein  44.05 
 
 
253 aa  136  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3930  hypothetical protein  42.44 
 
 
263 aa  130  2e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0410  hypothetical protein  38.82 
 
 
196 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.500594  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3766  hypothetical protein  36.94 
 
 
243 aa  48.9  6e-05  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1614  hypothetical protein  33.33 
 
 
179 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0254992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>