More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0157 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0249  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  97.06 
 
 		 545 aa  1097    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0157  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 545 aa  1123    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.695568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6591  extracellular solute-binding protein  56.71 
 
 		 540 aa  627  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.476219 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6277  extracellular solute-binding protein  58.73 
 
 		 527 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0281814  normal  0.114415 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6090  extracellular solute-binding protein family 5  57.2 
 
 		 538 aa  623  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1495  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  56.73 
 
 		 538 aa  621  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.045715  hitchhiker  0.00127227 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6444  twin-arginine translocation pathway signal  58.73 
 
 		 527 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6679  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component  58.73 
 
 		 527 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0058  extracellular solute-binding protein  54.5 
 
 		 539 aa  615  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3074  extracellular solute-binding protein  55.56 
 
 		 536 aa  613  9.999999999999999e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483936 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0786  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  57.66 
 
 		 526 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6057  extracellular solute-binding protein  58.16 
 
 		 527 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6354  extracellular solute-binding protein  57.97 
 
 		 527 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3699  extracellular solute-binding protein  59 
 
 		 527 aa  593  1e-168  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2945  extracellular solute-binding protein  53.7 
 
 		 509 aa  567  1e-160  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5634  extracellular solute-binding protein family 5  52.83 
 
 		 540 aa  565  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2914  extracellular solute-binding protein family 5  51.04 
 
 		 537 aa  555  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1922  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  50.74 
 
 		 535 aa  555  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.92103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5594  extracellular solute-binding protein  50.28 
 
 		 535 aa  552  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459863  normal  0.392289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2187  extracellular solute-binding protein  52.56 
 
 		 519 aa  552  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.843737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5666  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  48.62 
 
 		 537 aa  546  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5006  extracellular solute-binding protein family 5  49.72 
 
 		 536 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.264167 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5304  extracellular solute-binding protein family 5  48.79 
 
 		 536 aa  529  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.85757 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1543  extracellular solute-binding protein family 5  48.47 
 
 		 513 aa  523  1e-147  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.397228  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4961  extracellular solute-binding protein  48.79 
 
 		 537 aa  521  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  normal  0.0265573 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0409  extracellular solute-binding protein  41.91 
 
 		 520 aa  395  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2781  extracellular solute-binding protein  38.74 
 
 		 525 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3746  extracellular solute-binding protein family 5  38.89 
 
 		 513 aa  345  1e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5072  extracellular solute-binding protein  39.57 
 
 		 519 aa  345  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3816  twin-arginine translocation pathway signal  37.3 
 
 		 522 aa  322  9.999999999999999e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.961587  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2178  extracellular solute-binding protein  36.04 
 
 		 529 aa  313  4.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246301  normal  0.618007 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6426  extracellular solute-binding protein family 5  36.21 
 
 		 529 aa  309  9e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312111 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4497  extracellular solute-binding protein family 5  36.59 
 
 		 529 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4502  extracellular solute-binding protein family 5  35.09 
 
 		 526 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3169  extracellular solute-binding protein  37.15 
 
 		 535 aa  296  6e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.116403 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3525  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  36.96 
 
 		 535 aa  295  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2843  extracellular solute-binding protein  36.96 
 
 		 535 aa  294  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6105  extracellular solute-binding protein family 5  36.08 
 
 		 518 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000312198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1820  twin-arginine translocation pathway signal  38.33 
 
 		 527 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.575663  normal  0.77509 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2183  extracellular solute-binding protein  31.43 
 
 		 529 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3524  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  36.64 
 
 		 534 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.413747  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3168  extracellular solute-binding protein  36.64 
 
 		 534 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2844  extracellular solute-binding protein  36.21 
 
 		 534 aa  270  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.922612  normal  0.415189 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6276  extracellular solute-binding protein family 5  34.04 
 
 		 496 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0695772 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6279  extracellular solute-binding protein family 5  33.4 
 
 		 512 aa  264  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.334528 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6274  extracellular solute-binding protein family 5  33.48 
 
 		 511 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0245039 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2105  extracellular solute-binding protein family 5  33.41 
 
 		 538 aa  250  4e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0251373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16230  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  32.5 
 
 		 516 aa  239  6.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.884302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3713  putative ABC transporter (substrate binding component)  31.11 
 
 		 516 aa  222  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0953  extracellular solute-binding protein family 5  32.01 
 
 		 532 aa  222  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5589  extracellular solute-binding protein  30.51 
 
 		 513 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1749  extracellular solute-binding protein family 5  30 
 
 		 538 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3635  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 		 515 aa  197  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.014259  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3332  extracellular solute-binding protein  28.82 
 
 		 517 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0576  extracellular solute-binding protein family 5  27.59 
 
 		 533 aa  186  9e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5692  extracellular solute-binding protein family 5  28.47 
 
 		 555 aa  179  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3338  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 524 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165624  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  28.83 
 
 		 502 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1039  extracellular solute-binding protein family 5  29.35 
 
 		 503 aa  171  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.78614  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2073  extracellular solute-binding protein  29.1 
 
 		 517 aa  171  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.610417  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2653  extracellular solute-binding protein  28.6 
 
 		 517 aa  170  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0051152  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3973  extracellular solute-binding protein family 5  29.87 
 
 		 505 aa  167  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617507  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3559  extracellular solute-binding protein  29.45 
 
 		 526 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0558  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 561 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760139  hitchhiker  0.00152331 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  29.44 
 
 		 505 aa  158  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  30.12 
 
 		 514 aa  158  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3175  extracellular solute-binding protein family 5  27.78 
 
 		 554 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000918408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3756  putative peptide ABC transporter, substrate- binding protein  28.1 
 
 		 514 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279615  normal  0.332846 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0790  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.49 
 
 		 554 aa  157  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.35 
 
 		 513 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2078  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 550 aa  154  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0155484  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1086  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 		 523 aa  152  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  27.37 
 
 		 503 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 522 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4534  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  28.54 
 
 		 504 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 		 503 aa  147  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0074  twin-arginine translocation pathway signal  27.15 
 
 		 514 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0403886  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4211  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 504 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  24.76 
 
 		 517 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2156  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 543 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.470572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1803  extracellular solute-binding protein family 5  26.98 
 
 		 499 aa  140  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0045678  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  28.54 
 
 		 509 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0232  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 		 517 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0112  extracellular solute-binding protein family 5  25.79 
 
 		 524 aa  139  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.214652  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  28.1 
 
 		 520 aa  139  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0939  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 		 517 aa  138  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  26.2 
 
 		 495 aa  136  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.47 
 
 		 532 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6371  extracellular solute-binding protein family 5  27.07 
 
 		 504 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  26.67 
 
 		 535 aa  134  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  31.64 
 
 		 516 aa  134  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1360  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 543 aa  133  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0151381 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  26.17 
 
 		 502 aa  133  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5357  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  25.53 
 
 		 502 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0991682  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  25.76 
 
 		 527 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  25.24 
 
 		 534 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6191  extracellular solute-binding protein family 5  27.07 
 
 		 504 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172417  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.66 
 
 		 516 aa  131  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5706  extracellular solute-binding protein family 5  27.75 
 
 		 552 aa  131  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5711  extracellular solute-binding protein family 5  26.86 
 
 		 550 aa  131  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.789808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>