30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0100 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_0100  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1324  hypothetical protein  48.39 
 
 
160 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0589  hypothetical protein  45.22 
 
 
160 aa  153  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.920476  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1530  hypothetical protein  45.22 
 
 
160 aa  153  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1500  hypothetical protein  45.22 
 
 
160 aa  153  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.146281  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0137  hypothetical protein  46.5 
 
 
160 aa  153  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811401  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0563  hypothetical protein  45.22 
 
 
160 aa  153  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2821  hypothetical protein  46.5 
 
 
160 aa  153  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.338668  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1307  hypothetical protein  45.22 
 
 
160 aa  153  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2317  hypothetical protein  46.5 
 
 
160 aa  153  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2338  hypothetical protein  46.5 
 
 
160 aa  153  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0918492  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0794  hypothetical protein  45.22 
 
 
160 aa  153  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.475725  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0130  hypothetical protein  46.5 
 
 
160 aa  153  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0337  hypothetical protein  45.86 
 
 
160 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.043628  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1633  hypothetical protein  44.52 
 
 
156 aa  140  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3339  hypothetical protein  48.3 
 
 
148 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595806  normal  0.189269 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2983  hypothetical protein  49.26 
 
 
139 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00581443  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2888  hypothetical protein  42.58 
 
 
152 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.70443 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1675  hypothetical protein  41.14 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2186  hypothetical protein  37.97 
 
 
172 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2298  hypothetical protein  38.78 
 
 
172 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5374  hypothetical protein  35.67 
 
 
160 aa  100  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303606  normal  0.45291 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0742  hypothetical protein  33.95 
 
 
175 aa  97.8  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.672077  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1247  hypothetical protein  34.76 
 
 
172 aa  95.5  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1238  hypothetical protein  38.85 
 
 
138 aa  90.9  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.35146  normal  0.290889 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2388  hypothetical protein  40 
 
 
84 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383815 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0026  hypothetical protein  39.76 
 
 
90 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.434634  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1282  hypothetical protein  58.97 
 
 
173 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.250651  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3003  hypothetical protein  36.99 
 
 
107 aa  50.8  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.005866  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1145  hypothetical protein  37.5 
 
 
535 aa  44.3  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0989818  hitchhiker  0.0000170395 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>