226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0080 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0080  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  511  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0108  hypothetical protein  87.73 
 
 		 272 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0054  hypothetical protein  73.02 
 
 		 285 aa  316  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0073  hypothetical protein  74.13 
 
 		 272 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268722  hitchhiker  0.000000124112 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0070  hypothetical protein  73.68 
 
 		 272 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  hitchhiker  0.000000308112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0070  hypothetical protein  73.62 
 
 		 272 aa  291  8e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96847  hitchhiker  0.00978296 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  56.39 
 
 		 273 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  58.4 
 
 		 273 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  56.81 
 
 		 273 aa  239  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0355  protein of unknown function DUF81  53.12 
 
 		 272 aa  238  5.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.397221 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2250  hypothetical protein  57.83 
 
 		 268 aa  225  6e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3591  hypothetical protein  53.93 
 
 		 273 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6243  hypothetical protein  54.51 
 
 		 272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0798  hypothetical protein  45.69 
 
 		 269 aa  218  6e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5348  hypothetical protein  52.03 
 
 		 331 aa  218  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.57762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  48.82 
 
 		 276 aa  193  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0360  hypothetical protein  52.73 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  47.31 
 
 		 268 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  48.22 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1809  hypothetical protein  49.17 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3457  hypothetical protein  46.15 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2118  hypothetical protein  45.74 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.763231  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2305  hypothetical protein  46.25 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2174  hypothetical protein  45.74 
 
 		 268 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.290408  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1671  hypothetical protein  43.77 
 
 		 268 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1668  hypothetical protein  44.27 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2280  hypothetical protein  44.85 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.645402  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1513  hypothetical protein  45.2 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.62099  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5045  hypothetical protein  45.06 
 
 		 268 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6332  hypothetical protein  44.09 
 
 		 268 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1747  hypothetical protein  44.09 
 
 		 268 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.418436  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1763  hypothetical protein  44.09 
 
 		 268 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  42.11 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2167  hypothetical protein  38.03 
 
 		 268 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.720492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  36.73 
 
 		 290 aa  112  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  28.57 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  27.73 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2294  hypothetical protein  33.58 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000192457 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  35.36 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  33.78 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  33.78 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  28.57 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  28.03 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  31.56 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  34.73 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  28.76 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  30.9 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3139  protein of unknown function DUF81  30.86 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  30.71 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  30.71 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  30.71 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  27.8 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1178  hypothetical protein  27.67 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1081  hypothetical protein  27.67 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217468  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  30.83 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  32.02 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  29.87 
 
 		 2798 aa  62.4  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  28.78 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1420  hypothetical protein  30.59 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1649  protein of unknown function DUF81  27.54 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  30.43 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  35.04 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01140  predicted permease  28.57 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  33.5 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  31.54 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  25.78 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  25.78 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0615  hypothetical protein  29.21 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.117096  normal  0.438819 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  31.17 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  28.57 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  30.81 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  32.77 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4015  hypothetical protein  32 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4089  hypothetical protein  32 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4245  hypothetical protein  32 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468612  normal  0.0890786 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2089  hypothetical protein  28.78 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  33.61 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  38.33 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1843  permease  24.41 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  26.67 
 
 		 275 aa  57  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  28.02 
 
 		 308 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3084  membrane permease protein  39.25 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  32.55 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  34.19 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  30.74 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  31.93 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3672  protein of unknown function DUF81  27.78 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  31 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  31.05 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  30.13 
 
 		 301 aa  53.9  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  31 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  23.58 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  30.11 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  34.23 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1413  hypothetical protein  26.29 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  26.71 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3420  hypothetical protein  31.49 
 
 		 269 aa  53.9  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358832 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2721  protein of unknown function DUF81  34.53 
 
 		 254 aa  53.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3834  hypothetical protein  33.02 
 
 		 252 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  28.68 
 
 		 305 aa  53.1  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>