143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0051 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0051  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0139  hypothetical protein  94.42 
 
 		 197 aa  347  9e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5477  hypothetical protein  76.06 
 
 		 193 aa  263  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0197  hypothetical protein  76.88 
 
 		 195 aa  260  8e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0218  hypothetical protein  76.88 
 
 		 195 aa  260  8e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.485558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0221  hypothetical protein  78.57 
 
 		 195 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0290  hypothetical protein  67.4 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5251  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  56.73 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2605  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  52.85 
 
 		 222 aa  177  7e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0949581  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69330  hypothetical protein  69.78 
 
 		 192 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3252  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  52.85 
 
 		 222 aa  177  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.309546 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5996  hypothetical protein  70.86 
 
 		 192 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1202  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  60.13 
 
 		 245 aa  157  7e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00500241 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3051  hypothetical protein  55.56 
 
 		 208 aa  148  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129241 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1747  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  45.61 
 
 		 187 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346445 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2944  hypothetical protein  45.4 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0723144  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3136  hypothetical protein  37.1 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0229  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  33.96 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.727419  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0787  hypothetical protein  27.44 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0614  hypothetical protein  35.98 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.431847 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001007  small-conductance mechanosensitive channel  31.41 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0381  hypothetical protein  30.95 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1549  hypothetical protein  28.06 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1265  small-conductance mechanosensitive channel  28.06 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.455732 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07084  hypothetical protein  29.71 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4184  small-conductance mechanosensitive channel  31.48 
 
 		 184 aa  62  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12023  hypothetical protein  28.57 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0790  hypothetical protein  30.34 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  30.57 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3043  hypothetical protein  35.2 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.103752  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  26.78 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  29.94 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0899  hypothetical protein  35.45 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  29.55 
 
 		 273 aa  54.7  0.0000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3441  hypothetical protein  35.45 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0852  hypothetical protein  35.45 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3512  hypothetical protein  35.45 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3635  hypothetical protein  35.45 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0961  hypothetical protein  35.45 
 
 		 150 aa  53.9  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0520  hypothetical protein  35.45 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3322  hypothetical protein  32.14 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0804  hypothetical protein  32.73 
 
 		 181 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3219  hypothetical protein  32.73 
 
 		 181 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  27.84 
 
 		 268 aa  52.4  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2956  hypothetical protein  33.67 
 
 		 176 aa  52.4  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4903  MscS mechanosensitive ion channel  31.47 
 
 		 327 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1730  MscS Mechanosensitive ion channel  31.37 
 
 		 276 aa  49.3  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.351236  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  29.19 
 
 		 682 aa  48.9  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  25.93 
 
 		 286 aa  48.1  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3896  MscS Mechanosensitive ion channel  27.01 
 
 		 283 aa  48.1  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  28.46 
 
 		 1117 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1139  MscS Mechanosensitive ion channel  32.95 
 
 		 294 aa  47  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.471247 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0851  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  27.27 
 
 		 289 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3818  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  27.27 
 
 		 289 aa  47  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.905722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0854  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 289 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0987  MscS Mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 		 238 aa  46.2  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  26.11 
 
 		 287 aa  45.8  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0427  MscS mechanosensitive ion channel  30.25 
 
 		 288 aa  45.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0918944  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  27.54 
 
 		 494 aa  45.8  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1739  MscS mechanosensitive ion channel  27.1 
 
 		 395 aa  45.4  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  27.69 
 
 		 1235 aa  45.4  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0141  MscS Mechanosensitive ion channel  35.77 
 
 		 373 aa  45.4  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195967  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  25.67 
 
 		 293 aa  45.4  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0540  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  28.75 
 
 		 173 aa  45.1  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000231888  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0104  mechanosensitive ion channel family protein  26.19 
 
 		 309 aa  45.1  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3394  MscS mechanosensitive ion channel  30.72 
 
 		 277 aa  45.1  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00053127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0786  MscS mechanosensitive ion channel  25.84 
 
 		 1066 aa  45.1  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.213544  hitchhiker  0.000495101 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 283 aa  45.1  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  29.56 
 
 		 281 aa  45.1  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  30.09 
 
 		 298 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  26.71 
 
 		 280 aa  43.9  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1640  mechanosensitive ion channel  28.75 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0204845  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  28.21 
 
 		 270 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  33.08 
 
 		 341 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  27.12 
 
 		 274 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  42.86 
 
 		 302 aa  43.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.03582 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1557  mechanosensitive ion channel family protein  30.09 
 
 		 274 aa  43.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.172425  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5024  potassium efflux system protein KefA, putative  29.27 
 
 		 1134 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0501  potassium efflux protein KefA  29.27 
 
 		 1134 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  29.27 
 
 		 1117 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0258  hypothetical protein  29 
 
 		 200 aa  43.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0587  MscS mechanosensitive ion channel  22.65 
 
 		 1067 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0226105 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3443  MscS mechanosensitive ion channel  22.65 
 
 		 1067 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0586  MscS mechanosensitive ion channel  22.65 
 
 		 1067 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0875624 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0555  MscS mechanosensitive ion channel  25.14 
 
 		 1060 aa  43.5  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0475901  normal  0.179203 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5651  hypothetical protein  28.66 
 
 		 283 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1496  MscS Mechanosensitive ion channel  25.95 
 
 		 295 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  27.05 
 
 		 291 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3549  MscS mechanosensitive ion channel  28.15 
 
 		 803 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.566467  normal  0.27975 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2942  MscS mechanosensitive ion channel  26.58 
 
 		 288 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1293  MscS Mechanosensitive ion channel  28.72 
 
 		 814 aa  43.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  25.82 
 
 		 283 aa  42.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 275 aa  42.7  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  25.61 
 
 		 286 aa  43.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  27.87 
 
 		 299 aa  43.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588  transporter, putative  22.1 
 
 		 1067 aa  42.4  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0015  MscS mechanosensitive ion channel  31.62 
 
 		 287 aa  42.7  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  27.69 
 
 		 1166 aa  42.7  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0547  MscS mechanosensitive ion channel  22.1 
 
 		 1067 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  27.33 
 
 		 276 aa  42.4  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>