More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_R0039 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_R0014  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.469751  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0029  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0847414 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0026  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0039  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000226797  normal  0.246953 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0027  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00239727  normal  0.0594729 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0022  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000352228  hitchhiker  0.00000353756 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0027  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000248152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0041  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000325058  normal  0.507644 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0021  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000252162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0054  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300765 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0019  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0178689 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0056  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299906 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0055  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297696 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0038  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352364  normal  0.157284 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0059  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0311409 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2041  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 79 bp  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t46  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t47  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t49  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133536  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2040  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 79 bp  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA27  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.237638  normal  0.165942 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA29  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000082024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA30  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000254834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0085  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.150257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0083  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R26  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000223241  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R28  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771602  normal  0.0209843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R37  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R38  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.809466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0021  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0037  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0039  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0060  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0314851 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0067  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.168888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0066  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0068  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.242521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1860  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 79 bp  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000224596  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0021  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0103753 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0036  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.227491  normal  0.213335 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0037  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451566  normal  0.215433 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0128  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000146033  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0005  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.128453  unclonable  0.0000112956 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0139  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.595909  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0041  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101983  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0050  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259699  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0067  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000256523  hitchhiker  0.000000993702 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t001  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t053  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t054  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t102  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0004  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712007  hitchhiker  0.000000679169 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0137  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.56493 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0012  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.556518  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0046  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000017154  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0047  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477067  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0129  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0066  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000109987  hitchhiker  0.00000103719 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0007  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0126  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0080  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000081344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0079  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000000855359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0004  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.660889  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0119  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0531426 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0060  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580753  hitchhiker  0.000524679 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0125  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000018032  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0021  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.76663 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0177  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0159  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00117614  hitchhiker  0.0000000316845 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0153  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000144373 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0012  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0364761 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0050  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0041  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109501  normal  0.0527209 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0047  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000429092  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0018  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0114  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0016  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0392662 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0100  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000567752  hitchhiker  0.00319693 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0019  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111576 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0114  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0027  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000494544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0078  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000246729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0018  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00473987  normal  0.433792 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0101  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000609189  hitchhiker  0.00329166 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0108  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00436109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0004  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.372238  hitchhiker  0.00144913 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0019  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000445716 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0103  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118993  normal  0.0723976 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0104  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103964  normal  0.0748014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0004  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253522  hitchhiker  0.00233636 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0103  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000505774  normal  0.231295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0104  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000485826  normal  0.231295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0138  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0127  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000164688  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0082  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000638289  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0083  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116842  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0130  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.511088  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0049  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.256681  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0052  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000247942  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0018  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0004  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>