More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_2145 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_2145  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  256  8e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  1.65245e-08  unclonable  1.11229e-06 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2474  hypothetical protein  80.65 
 
 
124 aa  201  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00217526  hitchhiker  0.000573367 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2389  hypothetical protein  49.17 
 
 
135 aa  120  6e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  6.8208e-07  hitchhiker  5.6486e-07 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2150  protein of unknown function DUF37  54.55 
 
 
69 aa  79.3  2e-14  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04301  hypothetical protein  49.33 
 
 
78 aa  79  2e-14  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1545  protein of unknown function DUF37  48.68 
 
 
76 aa  77.8  5e-14  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  47.14 
 
 
82 aa  77.8  5e-14  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  49.3 
 
 
104 aa  76.3  1e-13  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  51.39 
 
 
87 aa  76.6  1e-13  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3100  hypothetical protein  39.44 
 
 
88 aa  75.5  2e-13  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880044  normal  0.0421646 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3398  hypothetical protein  38.03 
 
 
101 aa  75.5  2e-13  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569654  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3216  hypothetical protein  39.44 
 
 
88 aa  75.5  2e-13  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222791  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6521  hypothetical protein  39.44 
 
 
88 aa  75.5  2e-13  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3236  hypothetical protein  39.44 
 
 
89 aa  75.1  3e-13  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256885  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3987  hypothetical protein  39.19 
 
 
76 aa  75.1  3e-13  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3182  hypothetical protein  38.03 
 
 
88 aa  75.1  3e-13  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190037 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4465  hypothetical protein  39.19 
 
 
76 aa  75.1  3e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0835633 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3164  hypothetical protein  38.03 
 
 
88 aa  75.1  3e-13  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345187  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3155  hypothetical protein  39.44 
 
 
111 aa  75.1  3e-13  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  1.18131e-05 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2550  hypothetical protein  38.03 
 
 
88 aa  75.1  3e-13  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0303  hypothetical protein  38.03 
 
 
89 aa  74.7  4e-13  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  45.71 
 
 
85 aa  74.7  4e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3551  hypothetical protein  38.03 
 
 
89 aa  74.7  4e-13  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0092  hypothetical protein  38.03 
 
 
89 aa  74.7  4e-13  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  45.71 
 
 
85 aa  74.7  4e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2845  hypothetical protein  38.03 
 
 
89 aa  74.7  4e-13  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0200  hypothetical protein  47.37 
 
 
76 aa  74.7  4e-13  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2240  hypothetical protein  38.03 
 
 
89 aa  74.7  4e-13  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0106  hypothetical protein  38.03 
 
 
89 aa  74.7  4e-13  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3099  hypothetical protein  39.44 
 
 
76 aa  74.3  5e-13  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  3.94667e-05 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1589  hypothetical protein  46.58 
 
 
104 aa  74.3  5e-13  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
85 aa  74.3  5e-13  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  50.72 
 
 
77 aa  73.9  6e-13  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.29723e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0788  hypothetical protein  42.5 
 
 
92 aa  73.2  1e-12  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.729241  normal  0.024971 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1745  hypothetical protein  46.05 
 
 
79 aa  73.2  1e-12  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4317  protein of unknown function DUF37  51.52 
 
 
69 aa  72.4  2e-12  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.915656  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0640  hypothetical protein  50 
 
 
73 aa  72  3e-12  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.200519  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04621  hypothetical protein  44.74 
 
 
79 aa  71.6  3e-12  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  42.86 
 
 
92 aa  71.6  3e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  40.79 
 
 
88 aa  71.2  4e-12  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  49.3 
 
 
107 aa  71.2  4e-12  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  3.55677e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  45.45 
 
 
85 aa  70.9  5e-12  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  4.93457e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2140  protein of unknown function DUF37  43.48 
 
 
79 aa  71.2  5e-12  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0911877 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  50.72 
 
 
81 aa  70.5  7e-12  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  50.72 
 
 
81 aa  70.5  7e-12  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.74281e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  47.83 
 
 
75 aa  70.5  7e-12  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2121  hypothetical protein  43.42 
 
 
88 aa  69.3  1e-11  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0094  protein of unknown function DUF37  51.52 
 
 
69 aa  69.3  1e-11  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  46.38 
 
 
78 aa  69.7  1e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  47.83 
 
 
123 aa  69.3  1e-11  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  46.38 
 
 
78 aa  69.7  1e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  46.38 
 
 
78 aa  69.7  1e-11  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  46.38 
 
 
78 aa  69.7  1e-11  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  50.79 
 
 
80 aa  70.1  1e-11  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04611  hypothetical protein  52.46 
 
 
63 aa  69.7  1e-11  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  46.38 
 
 
78 aa  69.7  1e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1486  hypothetical protein  52.11 
 
 
82 aa  70.1  1e-11  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  46.38 
 
 
78 aa  69.7  1e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23590  conserved hypothetical protein TIGR00278  48.57 
 
 
74 aa  70.1  1e-11  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000940525  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  43.42 
 
 
80 aa  69.7  1e-11  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  47.76 
 
 
85 aa  68.9  2e-11  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.85576e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  46.77 
 
 
74 aa  69.3  2e-11  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  47.76 
 
 
85 aa  68.9  2e-11  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  47.76 
 
 
85 aa  68.9  2e-11  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1630  hypothetical protein  50.72 
 
 
81 aa  69.3  2e-11  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.265757  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1496  protein of unknown function DUF37  53.52 
 
 
69 aa  68.6  2e-11  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9606  predicted protein  43.66 
 
 
80 aa  69.3  2e-11  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  47.76 
 
 
85 aa  68.9  2e-11  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  46.38 
 
 
78 aa  68.6  3e-11  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  46.38 
 
 
78 aa  68.6  3e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6485  hypothetical protein  43.84 
 
 
91 aa  68.6  3e-11  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00221195  normal  0.0771857 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1367  protein of unknown function DUF37  48 
 
 
78 aa  68.2  3e-11  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.528431  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  45.16 
 
 
76 aa  68.6  3e-11  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  46.38 
 
 
78 aa  68.6  3e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  45.16 
 
 
76 aa  68.6  3e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  42.03 
 
 
84 aa  68.6  3e-11  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  46.38 
 
 
78 aa  68.6  3e-11  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0406  hypothetical protein  50.82 
 
 
63 aa  68.6  3e-11  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  47.76 
 
 
85 aa  68.2  4e-11  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  5.45149e-08  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  45.83 
 
 
82 aa  68.2  4e-11  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  51.52 
 
 
91 aa  67.8  4e-11  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2535  hypothetical protein  50.75 
 
 
78 aa  67.8  4e-11  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.38648  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  38.16 
 
 
107 aa  67.8  5e-11  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  50.82 
 
 
89 aa  67.8  5e-11  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  43.48 
 
 
70 aa  67.8  5e-11  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5109  hypothetical protein  43.48 
 
 
95 aa  67.8  5e-11  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107467  unclonable  1.43514e-08 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5413  protein of unknown function DUF37  43.84 
 
 
144 aa  67.8  5e-11  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  44.74 
 
 
86 aa  67.8  5e-11  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  1.69142e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  46.38 
 
 
86 aa  67.8  5e-11  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  1.89964e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  45.16 
 
 
76 aa  67.4  6e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04721  hypothetical protein  49.18 
 
 
63 aa  67.4  7e-11  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.132179  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21151  hypothetical protein  39.73 
 
 
88 aa  67  7e-11  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2209  hypothetical protein  41.46 
 
 
128 aa  67.4  7e-11  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.304599  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2156  hypothetical protein  45.59 
 
 
119 aa  67  8e-11  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2398  hypothetical protein  45.21 
 
 
73 aa  67  8e-11  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.454507  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5094  protein of unknown function DUF37  47.69 
 
 
93 aa  66.6  1e-10  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4136  protein of unknown function DUF37  53.12 
 
 
69 aa  66.6  1e-10  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0543126  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  42.03 
 
 
70 aa  66.2  1e-10  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4591  hypothetical protein  44.12 
 
 
79 aa  66.6  1e-10  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00100327  hitchhiker  0.000364901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  42.03 
 
 
81 aa  66.2  1e-10  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0328546 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>