103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_2136 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_2136  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  766    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.116452 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2464  peptidoglycan-binding LysM  94.16 
 
 		 377 aa  697    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.175579 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0044  peptidoglycan-binding LysM  38.18 
 
 		 338 aa  223  4e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0056  peptidoglycan-binding LysM  36.47 
 
 		 345 aa  212  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0022  hypothetical protein  33.42 
 
 		 352 aa  211  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.124597  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0176  LysM domain protein  34.95 
 
 		 341 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00210  lysin domain-containing protein  35.76 
 
 		 341 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0021  hypothetical protein  36.06 
 
 		 341 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156222  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0020  peptidoglycan-binding LysM  34.35 
 
 		 341 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3013  peptidoglycan-binding LysM  32.87 
 
 		 345 aa  204  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0018  peptidoglycan-binding LysM  34.35 
 
 		 341 aa  202  8e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000019767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00180  peptidoglycan-binding LysM protein  33.43 
 
 		 341 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0309659  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0194  peptidoglycan-binding LysM  33.03 
 
 		 383 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2629  peptidoglycan-binding LysM  31.12 
 
 		 338 aa  176  6e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.829323  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2519  hypothetical protein  31.38 
 
 		 345 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2649  hypothetical protein  31.09 
 
 		 345 aa  169  8e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0025  peptidoglycan-binding LysM  29.66 
 
 		 374 aa  168  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0096  Peptidoglycan-binding LysM  31.32 
 
 		 349 aa  164  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2274  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  31.7 
 
 		 389 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514615 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0349  peptidoglycan-binding LysM  28.34 
 
 		 394 aa  162  7e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0885534 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0030  peptidoglycan-binding LysM  29.38 
 
 		 374 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.772252  hitchhiker  0.00540943 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0033  peptidoglycan-binding LysM  29.21 
 
 		 376 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0036  peptidoglycan-binding LysM  29.38 
 
 		 374 aa  160  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243599 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0028  peptidoglycan-binding LysM  29.1 
 
 		 374 aa  160  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.198583 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0033  LysM domain-containing protein  29.33 
 
 		 378 aa  159  7e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0032  Peptidoglycan-binding LysM  28.93 
 
 		 376 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235775 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0032  peptidoglycan-binding LysM  28.93 
 
 		 376 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0028  peptidoglycan-binding LysM  28.93 
 
 		 376 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4640  peptidoglycan-binding LysM  30.63 
 
 		 408 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3735  peptidoglycan-binding LysM  28.92 
 
 		 365 aa  153  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.315042  hitchhiker  0.00230648 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4687  peptidoglycan-binding LysM  32.53 
 
 		 417 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3680  Peptidoglycan-binding LysM  29.45 
 
 		 395 aa  152  8e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3357  Peptidoglycan-binding LysM  29.45 
 
 		 364 aa  152  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0020  peptidoglycan-binding LysM  30 
 
 		 343 aa  151  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.419154 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0039  peptidoglycan-binding LysM  29.71 
 
 		 369 aa  151  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.357546 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0282  putative signal peptide protein  28.13 
 
 		 387 aa  150  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0834  peptidoglycan-binding LysM  30.63 
 
 		 401 aa  149  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0188  peptidoglycan-binding LysM  29.7 
 
 		 350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749903 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0036  peptidoglycan-binding LysM  27.23 
 
 		 367 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.971795  normal  0.107314 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4050  peptidoglycan-binding LysM  29.22 
 
 		 426 aa  147  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.021914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0044  LysM domain-containing protein  29.71 
 
 		 346 aa  146  5e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.764087  normal  0.149636 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2842  LysM domain-containing protein  29.77 
 
 		 341 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0013  peptidoglycan-binding LysM-like protein  28.42 
 
 		 403 aa  145  8.000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.154454 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0025  peptidoglycan-binding LysM  29.69 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0077  peptidoglycan-binding LysM  29.46 
 
 		 360 aa  145  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0025  peptidoglycan-binding LysM  30 
 
 		 368 aa  145  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3861  peptidoglycan-binding LysM  30.47 
 
 		 409 aa  143  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0032  peptidoglycan-binding LysM  28.81 
 
 		 362 aa  142  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3395  Peptidoglycan-binding LysM  28.54 
 
 		 419 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3586  Peptidoglycan-binding LysM  27.92 
 
 		 377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0069  signal peptide protein  29.2 
 
 		 390 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3409  peptidoglycan-binding LysM  27.85 
 
 		 388 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392654  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4083  peptidoglycan-binding LysM  28.1 
 
 		 420 aa  139  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5114  Peptidoglycan-binding LysM  29.14 
 
 		 405 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0439251  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04054  LysM domain protein  28.8 
 
 		 366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3879  peptidoglycan-binding LysM  26.3 
 
 		 430 aa  137  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0021  LysM domain-containing protein  29.39 
 
 		 361 aa  135  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3566  peptidoglycan-binding LysM  26.48 
 
 		 358 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0024  peptidoglycan-binding LysM  30.06 
 
 		 359 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2087  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  27.06 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2472  hypothetical protein  27.19 
 
 		 391 aa  126  7e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0019  Peptidoglycan-binding LysM  26.89 
 
 		 349 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.154254 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0018  LysM domain protein  26.89 
 
 		 349 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00023  Peptidoglycan-binding LysM  27 
 
 		 367 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.574097  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00390  hypothetical protein  26.32 
 
 		 364 aa  117  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1866  peptidoglycan-binding LysM  26.62 
 
 		 384 aa  110  6e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002058  LysM domain-containing protein  25.95 
 
 		 364 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.778363  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1930  hypothetical protein  26.87 
 
 		 384 aa  107  3e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0076  putative cell wall degradation enzyme  24.86 
 
 		 353 aa  106  7e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2794  Peptidoglycan-binding LysM  25.65 
 
 		 440 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0244523  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2887  Peptidoglycan-binding LysM  25.65 
 
 		 440 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2701  peptidoglycan-binding LysM  26.61 
 
 		 440 aa  96.3  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2866  hypothetical protein  28.57 
 
 		 329 aa  95.5  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3268  Peptidoglycan-binding LysM  26.16 
 
 		 339 aa  90.9  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000361142  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2551  LysM domain-containing protein  25.45 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2695  peptidoglycan-binding LysM  25.21 
 
 		 435 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516695  normal  0.123815 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0530  peptidoglycan-binding LysM  23.21 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3691  peptidoglycan-binding LysM  24.33 
 
 		 340 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000027016  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0501  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  24.33 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0409  LysM domain-containing protein  25.61 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000322112  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0889  peptidoglycan-binding LysM  24.79 
 
 		 333 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000030411  hitchhiker  0.00000000000323717 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0537  peptidoglycan-binding LysM  26.69 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201658  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1527  Peptidoglycan-binding LysM  22.65 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27524e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2713  Peptidoglycan-binding LysM  42.31 
 
 		 335 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.292431  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  38.71 
 
 		 219 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3954  hypothetical protein  47.83 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0326  LysM domain protein  45.83 
 
 		 377 aa  48.9  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0219877  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2281  LysM domain-containing protein  57.5 
 
 		 357 aa  48.5  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0169093  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0721  peptidoglycan-binding LysM  46.67 
 
 		 572 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8593  Peptidoglycan-binding LysM  36.92 
 
 		 356 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902374  normal  0.799796 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0448  LysM domain-containing protein  42.55 
 
 		 404 aa  47  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0441  LysM domain-containing protein  42.55 
 
 		 404 aa  47  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21565  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1474  hypothetical protein  34.62 
 
 		 663 aa  46.2  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234073  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1910  peptidoglycan-binding LysM  45.65 
 
 		 382 aa  46.2  0.0009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0972  peptidoglycan-binding LysM  35.71 
 
 		 546 aa  46.2  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0553  peptidoglycan-binding LysM  46.67 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1442  hypothetical protein  41.07 
 
 		 212 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6887  transcriptional regulator, SARP family  38.3 
 
 		 935 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.691511  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1930  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 503 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0490055 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0461  peptidoglycan-binding LysM  32.88 
 
 		 439 aa  44.3  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.520913  normal  0.0203741 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>